تشخیص سرطان از مجموعه داده های ریزآرایه با به کارگیری مدل های ترکیبی
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده مهندسی
- نویسنده محمد مروت
- استاد راهنما علیرضا عصاره بیتا شادگار
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1393
چکیده
ارائه فناوری ریزآرایه در سال های اخیر، امکان مانیتورینگ بیان هزاران ژن را به طور همزمان فراهم نموده است. تحلیل هایی که در زمینه داده های ریزآرایه صورت گرفته است، بیانگر قدرت این فناوری در زمان تشخیص بسیاری از بیماری ها، از جمله سرطان است. چالشی که در این زمینه مطرح است، تعداد بالای ژن ها (ویژگی ها) و ازطرفی تعداد پایین نمونه ها است. در این پایان نامه، دو روش با دو رویکرد متفاوت به منظور ارائه یک سیستم کارای تشخیص سرطان ازطریق تحلیل داده های ریزآرایه ارائه شده است. در روش اول، چندین روش ترکیبی در راستای دستیابی به روشی مقاوم با یکدیگر ترکیب شده اند و درنهایت ترکیب نتایح توسط رأی گیری اکثریت صورت پذیرفته است. روش پیشنهادی دوم به منظور ارتقاء کارایی مرحله انتخاب ژن روش اول، از یک روش ترکیبی در مرحله انتخاب ژن سود جسته است که این روش ترکیبی، از ترکیب فیلترها و راپرها تشکیل شده است. درحقیقت به کارگیری فیلترها در گام ابتدایی این روش، زمینه را برای اعمال راپرها در گام بعدی در راستای بهبود دقت نتایج فراهم نموده است. نتایج حاصل از روش های پیشنهادی بر روی 11 مجموعه داده ریزآرایه، بیانگر کارایی بسیار بالای روش های پیشنهادی در راستای تشخیص دقیق بیماری سرطان است.
منابع مشابه
داده کاوی در داده های ریزآرایه جهت تشخیص سرطان
سالیان متمادی است که بشر می کوشد به راز بیماری ها پی برده و علت وجودی آن ها را دریابد .امکان بهره گیری از علم و فن آوری سایر علوم، دانشمندان عرصه بیولوژی را بر آن داشت که تحقیقات خود را متوجه کوچک ترین واحد زنده یک ارگانیسم، یعنی سلول نمایند. sechenaدر سال 1996 روشی را ارائه نمود که بر مبنای آن محققین قادر شدند به طور هم زمان ژن های موجود در دو بافت سالم و سرطانی را مطالعه نمایند. این تکنولوژی ...
15 صفحه اولتحلیل تصاویر ریزآرایه به منظور تشخیص نوع سرطان سینه
Background: Microarray technology is a powerful tool to study and analyze the behavior of thousands of genes simultaneously. Images of microarray have an important role in the detection and treatment of diseases. The aim of this study is to provide an automatic method for the extraction and analysis of microarray images to detect cancerous diseases. Methods: The proposed system consists of t...
متن کاملتحلیل تصاویر ریزآرایه به منظور تشخیص نوع سرطان سینه
Background: Microarray technology is a powerful tool to study and analyze the behavior of thousands of genes simultaneously. Images of microarray have an important role in the detection and treatment of diseases. The aim of this study is to provide an automatic method for the extraction and analysis of microarray images to detect cancerous diseases. Methods: The proposed system consists of t...
متن کاملبه کارگیری روش‌های خوشه‌بندی در ریزآرایه DNA
Background: Microarray DNA technology has paved the way for investigators to expressed thousands of genes in a short time. Analysis of this big amount of raw data includes normalization, clustering and classification. The present study surveys the application of clustering technique in microarray DNA analysis. Materials and methods: We analyzed data of Van’t Veer et al study dealing with BRCA1...
متن کاملانتخاب ژن و طبقه بندی سلول های سرطانی بر پایه داده های ریزآرایه با استفاده از الگوریتم ترکیبی BPSO و BLDA
داده های ریزآرایه در تشخیص و طبقه بندی انواع بافت های سرطانی نقش بسزایی دارند. در پژوهش های سرطان همیشه تعداد نسبتا کم نمونه ها در ریزآرایه باعث ایجاد مشکلاتی در طراحی طبقه بندها شده است. بنابراین داده های ریزآرایه قبل از طبقه بندی از طریق تکنیک های انتخاب ژن پیش پردازش و ژن های فاقد اطلاعات آن ها دور ریخته می شود. اساسا یک روش انتخاب ژن مناسب می تواند بطور موثر کارایی دسته بندی بیماری ها (سرطا...
متن کاملارزیابی تکنولوژی ریزآرایه های الیگونوکلئوتیدی در تشخیص باکتری های پاتوژن منتقله از طریق غذا
سابقه و هدف: روش های سنتی در تشخیص باکتری های پاتوژن منتقله از طریق غذا بسیار وقت گیر و زمانبر می باشند، بنابراین استفاده از روش های دقیق و قابل اطمینان در تشخیص پاتوژن های میکروبی مورد نیاز است. هدف از این پژوهش طراحی پرایمرهای یونیورسال برای تکثیر ژن 23S rDNA و هیبریدیزاسیون ریز آرایه های الیگونوکلئوتیدی به منظور ارزیابی کارایی و عملکرد توالی 23S rDNA در تشخیص باکتر...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده مهندسی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023