جداسازی و شناسایی مولکولی قارچ های آبزی استان مازندران

گونه های متعلق به اوومیست ها بسیاری از مناطق و نیچ های اکولوژیکی را اشغال کرده اند. خانواده saprolegniaceae متعلق به همین رده، شامل گونه های زیادی از کپک های آبزی است که معمولا رفتار ساپروفیتی روی بقایای گیاهان و حیوانات دارند. اعضای برخی از این گونه ها می توانند همچنین پاتوژن گیاهان و ماهی ها باشند. اغلب این گونه های خسارتزا شامل جنس های achlya، dictyuchus، saprolegnia و aphanomyces هستند. استفاده از dna برای شناسایی گونه های اوومیست ها به خوبی رایج شده است اما بارکد گذاری dna با واحد یک و دو سیتوکروم اکسیداز (cox1 و cox2) روش نسبتا جدیدی است که هنوز هم در حال ارزیابی برای رسیدن به یک روش با اهمیت در شناسایی اعضای اوومیست هاست. در این بررسی پس از شناسایی مورفولوژیکی بوسیله ی کلید های معتبر، نواحی its، cox1 و cox2 57 ایزوله که نماینده 3 جنس و 6 گونه (achlya recurva، a. bisexualis، dictyuchus monosporus، saprolegnia ferax، s. bulbosa و s. debaryana) بودند توالی یابی شدند. مقایسه ای از توالی های این سه بخش نشان داد که شناسایی با ناحیه ی cox1 یک گزینه ی کاربردی است و بخاطر استفاده از ژنوم میتوکندریایی به جای dna هسته روشی مکمل به شمار می رود. در برخی از موارد cox1 در شناسایی تا سطح گونه نسبت به its نتایج متمایزتری نشان داد اما cox2 ناحیه ی مناسبی برای شناسایی ایزوله ها نبود. نتایج بدست آمده در این بررسی این موضوع را تایید می کند که توالی یابی ناحیه ی cox1 و داده های ایجاد شده یک منبع مناسب برای رده بندی اعضای خانواده ی saprolegniaceae است. البته در کنار شناسایی مورفولوژیکی، its و cox1 برای شناسایی اعضای خانواده ی saprolegniaceae نواحی قابل قبول و مکمل هم به شمار می روند. در مجموع به غیر از s. ferax 5 گونه دیگر این بررسی برای ایران جدید هستند.