بررسی نظری برهمکنش های الکترواستاتیک در ساختار نوکلئوزوم

پایان نامه
چکیده

در موجودات یوکاریوتی dna با پروتئین های هسته ای هیستون همراه شده و کروماتین را شکل می دهد. نوکلئوزوم، واحد سازنده ی کروماتین است که هر جفت باز در طول ژنوم تکرار می شود. فرآیندهای ژنتیکی حیاتی نظیر همانندسازی، رونویسی، نوترکیبی، و بیماری هایی نظیر سرطان و عفونت های ویروسی بستگی به دسترسی به محتوای dna کروماتینی دارند و تحت تاثیر ساختار نوکلئوزوم قرار می گیرند. پروتئین های هیستونی در دو گروه کلی: هیستون های هسته هشت تایی و هیستون های ارتباط دهنده هستند. هسته هشت تایی هیستون، اولین مرحله متراکم سازی dna در هسته سلول های یوکاریوتی را تسهیل می کند. چهار نوع برهمکنش در ساختار نوکلئوزوم بین هیستون و dna وجود دارد: ) برهمکنش های الکترواستاتیک ) پیوندهای هیدروژنی ) پیوندهای هیدروژنی با واسطه مولکول های آب ) برهمکنش های هیدروفوب. به عنوان مثال، عرض شیارهای کوچک وابسته به توالی dna است. کم پهنا شدن شیار کوچک منجر به افزایش پتانسیل الکترواستاتیک موضعی میشود و این افزایش پتانسیل برهمکنش اختصاصی dna و پروتئین های هیستونی را سبب می شود. در این پایان نامه، برهمکنش های الکترواستاتیک اختصاصی در چندین ساختار نوکلئوزومی که ساختار کریستالی شده آن ها در بانک داده های پروتئین موجود است مورد بررسی قرار گرفته اند. این بررسی ها بیشتر بر پایه ی مقایسه دو ساختار نوکلئوزومی ncp147 و ncp601l است. بررسی ها نشان می دهند که برهمکنش الکترواستاتیک بین dna و هیستون ها به میزان زیادی به توالی dna نوکلئوزومی وابسته است و توالی dna نقش پیچیده و مهمی در جایگیری نوکلئوزوم بر روی dna ایفا می کند.

منابع مشابه

مطالعه نظری برهمکنش های مولکولی مشتق های بنزن پارا استخلاف شده با هیدروژن سیانید

در این مقاله اثرهای برهمکنش ­های غیر کووالانسی بررسی شده ­اند، جایی کههیدروژن سیانید  به عنوان یک دهنده پروتون و سامانه­ های π گوناگون مانند مشتق­ های بنزن پارا استخلاف شده (H، F، Cl، OH، SH، CH3 و NH2)<e...

متن کامل

بررسی آزمایشگاهی و بهینه‌سازی عملکرد رسوب‌دهندۀ الکترواستاتیک

در این پژوهش عملکرد یک رسوب­دهندۀ الکترواستاتیک استوانه­ای تک‌مرحله‌ای برای جداسازی ذرات گچ و نمک با قطر متوسط ذرات 180 و 290 نانومتر از جریان هوا به‌صورت آزمایشگاهی موردبررسی قرارگرفته است. اثر خواص ساختاری، اندازۀ ذرات و مقاومت ویژۀ الکتریکی و مشخصه‌های عملیاتی، اختلاف‌پتانسیل،­ قطر الکترود تخلیه، سرعت جریان هوا و جریان الکتریکی بر بازده جداسازی بررسی شد. نتایج نشان می­دهد بازده جداسازی ذ...

متن کامل

الکترواستاتیک در فضازمانهای کرمچاله‌ای

  Regarding the static form of Maxwell’s equations in wormhole background geometry, we obtain a generalised form of Laplace’s equation. Because of peculiar geometry of the throat, lines of force that enter the wormhole at one mouth and emerge from the other, initially converge and then diverge. So, for a remote observer the wormhole can act as a charge distribution that modifies the potential, ...

متن کامل

مدل سازی نظری به هم پیوستن و جدا شدن پروتئین های هیستون در نوکلئوزوم

سلول های یوکاریوتی به کمک پروتئین های هیستون بسته بندی شده و تشکیل نوکلئوزوم می دهند. نوکلئوزوم ها طی مراحل دیگری از بسته بندی در ساختاری به اسم کروماتین در درون هسته ی سلول جا داده می شوند. بنابراین ذره ی مرکزی نوکلئوزوم (ncp) زیر واحد تشکیل دهنده ی اولیه کروموزوم است. پروتئین های هشت تایی هیستون قسمت مرکزی نوکلئوزوم را تشکیل می دهند که از چهار جفت پروتئین h2b،h2a ، h4وh3 تشکیل شده است. dna با...

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تحصیلات تکمیلی علوم پایه زنجان - دانشکده زیست شناسی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023