مطالعه روابط خویشاوندی بین جمعیت های آویشن (thymus spp.) با استفاده از نشانگرهای مولکولی و مقدار ترکیبات اسانس
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده کشاورزی
- نویسنده سیده محدثه راستجو
- استاد راهنما علیرضا علی اکبر بابک ربیعی داود بخشی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1391
چکیده
در این پژوهش، تنوع ژنتیکی 21 جمعیت آویشن از مناطق مختلف کشور با استفاده از نشانگرهای aflp و ترکیب های شیمیایی موجود در اسانس ارزیابی شدند. پس از هضم dna ژنومی نمونه های مورد مطالعه به کمک آنزیم های ecori و msei، از 10 ترکیب آغازگری برای تکثیر و انگشت نگاری نمونه ها استفاده شد. آغازگرهای مورد مطالعه در کل 490 نوار ایجاد کردند که از این تعداد، 459 نوار (95/93%) چندشکل بودند. محتوای اطلاعات چندشکل (pic)، از 31/0 تا 42/0 متغیر و میانگین آن 37/0 تعیین شد. برآورد میانگین تنوع ژنی نی (h) و شاخص شانون (i) نشان داد که بیشترین تنوع ژنتیکی در نشانگر e32-m93 (47/0=i و 32/0=h) و کم ترین تنوع در نشانگر e33-m39 (32/0=i و 19/0=h) مشاهده شد. برای تعیین میزان تشابه بین جمعیت ها، از ضریب تشابه جاکارد استفاده شد و سپس از تجزیه خوشه ای به روش upgma به منظور گروه بندی نمونه ها استفاده گردید. نتایج تجزیه خوشه ای نشان داد که 21 جمعیت مورد مطالعه در پنج گروه اصلی قرار گرفتند. نتایج تجزیه به مختصات اصلی نیز نشان داد که آغازگرهای مورد استفاده توزیع نسبتا مناسب و یکنواختی در ژنوم جمعیت های مربوطه داشته و می توان نتایج حاصل از این آغازگرها را به کل ژنوم تعمیم داد. اسانس جمعیت های استان گیلان به روش تقطیر با آب استخراج شد و سپس ترکیب های تشکیل دهنده اسانس نمونه ها به وسیله gc و gc/ms مورد تجزیه و شناسایی قرار گرفتند. بیشترین و کمترین بازده اسانس نیز به ترتیب مربوط به دو گونه t. fedtschencoi (منجیل) وt. caucasicus (جاده اسالم به خلخال) بود. در مجموع 37 ترکیب در اسانس شناسایی شد که میزان آن ها از 786/42 تا 337/93 درصد متغیر بود. از میان ترکیب های شناسایی شده، 7 ترکیب در بین جمعیت ها مشترک بوده و از درصد نسبتا بالایی برخوردار بودند. همچنین فعالیت آنتی اکسیدانی عصاره های آبی و الکلی گیاه آویشن به روش dpph بررسی شد. از بین جمعیت های مورد مطالعه، گونه های t. pubescens در عصاره آبی و t. caucasicus در عصاره الکلی دارای بیشترین فعالیت آنتی اکسیدانی بوده و می توان از این گونه ها جهت مقاصد مختلف به ویژه کاربردهای دارویی استفاده کرد. نتایج حاصل از تجزیه خوشه ای بر مبنای ترکیب های شیمیایی نیز نشان داد که جمعیت های مربوط به یک گونه، ترکیب های شیمیایی مشابهی داشته و در یک گروه قرار گرفتند. به طور کلی، نتایج این مطالعه نشان داد که تنوع شیمیایی و مولکولی قابل توجهی بین جمعیت های مطالعه شده و به خصوص جمعیت های گیلان وجود داشت. همچنین، بین تنوع مشاهده شده از لحاظ نشانگرهای aflp با تنوع جغرافیایی مطابقت وجود داشت و گروه بندی حاصل از داده های مولکولی نیز تا حدی با گروه بندی ترکیبات شیمیایی مطابقت داشت.
منابع مشابه
بررسی تنوع ژنتیکی در بین و درون برخی از جمعیت های آویشن آذربایجانی (thymus migricus klokov & desj.-shost) با استفاده از نشانگرهای مولکولی rapd
در مطالعه حاضر نشانگرهای مولکولی rapd جهت بررسی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم برخی از جمعیت های وحشی آویشن آذربایجانی (thymus migricus klokov & desj.-shost) در ایران بکار برده شد. از تعداد 21 آغازگر ده نوکلئوتیدی بکار برده شده، در مجموع 310 نوار با وضوح بالا تولید شد که از این تعداد، 14 نوار مونومورفیک و 296 نوار دارای چند شکلی (پلی مورفیسم) بودند. به طور میانگین تعداد 76/14 نوار به ازای هر آغازگر بدست...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی در بین و درون برخی از جمعیت های آویشن آذربایجانی (thymus migricus klokov & desj.-shost) با استفاده از نشانگرهای مولکولی rapd
در مطالعه حاضر نشانگرهای مولکولی rapd جهت بررسی تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم برخی از جمعیت های وحشی آویشن آذربایجانی (thymus migricus klokov & desj.-shost) در ایران بکار برده شد. از تعداد 21 آغازگر ده نوکلئوتیدی بکار برده شده، در مجموع 310 نوار با وضوح بالا تولید شد که از این تعداد، 14 نوار مونومورفیک و 296 نوار دارای چند شکلی (پلی مورفیسم) بودند. به طور میانگین تعداد 76/14 نوار به ازای هر آغازگر ...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی و روابط خویشاوندی یونجههای یکساله دیپلوئید و تتراپلوئید با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
Annual medics are used for hey production, soil protection, biological fixation of N2 and green manure. In the present study, the inter and intra specific genetic diversity and relatedness of 4 diploid and two tetraploid (M. rugosa and M. scutellata) annual medics were evaluated using microsatellite markers. PCR analysis was performed on genomic DNA from individual plant and PCR products were d...
متن کاملبررسی روابط خویشاوندی برخی گونههای ماشک (Vicia spp.) براساس پروتئینهای ذخیره-ای و نشانگرهای RAPD
به منظور بررسی روابط فیلوژنتیکی برخی گونهها، زیرگونهها و اکوتیپهای ماشک، 17 نمونه توسط الکتروفورز پروتئینهای ذخیرهای دانه و 14 نمونه نیز توسط نشانگرهای RAPD (رپید) مورد مطالعه قرار گرفتند. پروتئینهای ذخیرهای دانه از بذرهای جمعآوری شده و DNA نمونهها از برگ بوتههای کشت شده استخراج شد. شاخص تنوع ژنی نی و شانون مربوط به نشانگرهای رپید و پروتئین تفاوت قابل ملاحظهای باهم نداشت، ولی شاخص...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی و روابط خویشاوندی یونجههای یکساله دیپلوئید و تتراپلوئید با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
Annual medics are used for hey production, soil protection, biological fixation of N2 and green manure. In the present study, the inter and intra specific genetic diversity and relatedness of 4 diploid and two tetraploid (M. rugosa and M. scutellata) annual medics were evaluated using microsatellite markers. PCR analysis was performed on genomic DNA from individual plant and PCR products were d...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی در بین و درون برخی از جمعیتهای آویشن آذربایجانی (Thymus migricus Klokov & Desj.-Shost) با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD
در مطالعه حاضر نشانگرهای مولکولی RAPD جهت بررسی تنوع ژنتیکی ژرمپلاسم برخی از جمعیتهای وحشی آویشن آذربایجانی (Thymus migricus Klokov & Desj.-Shost) در ایران بکار برده شد. از تعداد 21 آغازگر ده نوکلئوتیدی بکار برده شده، در مجموع 310 نوار با وضوح بالا تولید شد که از این تعداد، 14 نوار مونومورفیک و 296 نوار دارای چند شکلی (پلیمورفیسم) بودند. بهطور میانگین تعداد 76/14 نوار بهازای هر آغازگر بدست...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده کشاورزی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023