بررسی بیوانفورماتیکی اریبی کدون در چرخه های متابولیکی گاو شیری

پایان نامه
چکیده

مطالعات زیادی در زمینه اریبی کدون در موجودات مختلف صورت گرفته است، اما هنوز بحث های زیادی در مورد آن وجود دارد. در این مطالعه، با دید بیوانفورماتیکی به بررسی این پدیده در چرخه های متابولیکی مهم در گاو پرداخته شده است. اریبی کدون و پارامترهای مهمی مانند شاخص سازگاری کدون، میزان gc و غیره و نیز الگوهای کدونی بکار رفته در چرخه ها با نوشتن برنامه ای به زبان r مورد بررسی قرار گرفتند. با توجه به پیش فرض اولیه برای انتخاب ژن های با بیان بالا (انتخاب ژن هایی با gc مساوی و یا بیشتر از میانگینgc در چرخه مربوطه)، تجزیه و تحلیل های نمودارهای بدست آمده از برنامه r نشان داد که اکثریت ژن ها دارای بیان، محتوای gc3، enc و cai بالا بودند. کدون هایی که دارای فراوانی بیشتری نسبت به دیگرکدون های مترادف بودند، به gیا c ختم می شدند. میزان rscu نیز در کدون های منتهی به g یا c نیز دارای بیشترین میزان بودند. نتایج حاصله نشان داد که پیش فرض اولیه تا حدودی تایید می گردد ولی برای نتیجه گیری قاطع نیاز به آزمایشات میکروآرایه می باشد.

منابع مشابه

تحلیل فنوتیپی باروری در گله های گاو شیری هلشتاین ایران

هدف این پژوهش، بررسی وضعیت صفات مختلف تولیدمثلی در گاوهای هلشتاین ایران بود. در مجموع تعداد 221501 رکورد تولیدمثلی در تلیسه و گاو در نوبت های زایش 1 تا 5 که طی سال های 1380 تا 1390 در 60 گله گاو شیری متعلق به بنیاد مستضعفان و تعاونی وحدت اصفهان زایش داشتند، استفاده شد. تجزیه و تحلیل های آماری با استفاده از رویه های مدل های خطی تعمیم یافته و تابعیت نرم افزار آماری SAS انجام شد. در گاو‌ها، میانگی...

متن کامل

اثرات زیست‌محیطی و مزایای اقتصادی چرخه مدیریت کود دامی با تولید بیوگاز در مزارع صنعتی پرورش گاو شیری

چرخه مدیریت کود دامی از مرحله جمع­آوری تا کاربرد در مزرعه در پرورش گاو شیری برای سناریوهای مختلف از نظر زیست‌محیطی و اقتصادی مورد بررسی قرار گرفت. به همین منظور ترکیب کود در این چرخه با توجه به جیره مصرفی دام تعیین گردید. اثرات زیست‌محیطی به کمک استانداردها و سودمندی اقتصادی هر سناریو با نرم‌افزار کامفار محاسبه شد. نتایج این تحقیق حاکی از سودمند بودن احداث نیروگاه بیوگاز علی‌رغم نیاز آن به سرما...

متن کامل

بررسی ارتباط عیار سرمی پروژسترون و استروژن با یافته های سونوگرافیک کیست های تخمدانی گاو شیری

کیستهای تخمدانی در گاوهای شیری ساختارهای فولیکولی هستند که بیش از  2/5سانتی متر قطر داشته و حداقل به مدت  10روز در غیاب جسم زرد باقی مانده باشند. میزان وقوع کیستهای تخمدانی بر طبق گزارشات از  % 6تا  %19میباشند. تخمدان کیستیک یک ناهنجاری مهم در تولیدمثل گاوهای شیری میباشد و تشخیص به موقع عارضه و درمان آن از ضررهای اقتصادی هنگفتی جلوگیری می نماید. در این بررسی میزان ارتباط بین عیار سرمی پروژست...

متن کامل

بررسی سرواپی دمیولوژیک آلودگی لپتوسپیرائی در کارکنان و گله های گاو شیری دامپروریهای اطراف مشهد

متن کامل

زاویه کپلی مناسب برای گاو شیری

متن کامل

آنالیز شبکه های متابولیکی دخیل در تولید شیر در گاو

مدل سازی متابولیسم تولید شیر مبتنی بر بازسازی شبکه متابولیکی بافت غده پستانی گاو، می تواند منجر به دیدگاه سیستمی به این فرآیند پیچیده و درک بهتر آن گردد. این بازسازی با استفاده از اطلاعات ژنومی قابل دسترس گاو امکان پذیر است. در این پژوهش، اطلاعات مورد نیاز، از پایگاه های داده ncbi ، uniprot، kegg و brenda جمع آوری و مورد استفاده قرار گرفتند. . نتایج آنالیزهای انجام شده در این تحقیق می تواند برا...

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه فردوسی مشهد - دانشکده کشاورزی

کلمات کلیدی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023