همسانه سازی و آنالیز طول کامل ژنوم دو جدایه ایرانی ویروس x سیب زمینی
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده کشاورزی
- نویسنده شبنم پیش یار
- استاد راهنما حسین معصومی جهانگیر حیدرنژاد
- سال انتشار 1392
چکیده
به منظور مطالعه ژنوم کامل ویروس x سیب زمینی، دو جدایه ker.za.1 و ker.la.2 از مناطق بردسیر و زرند کرمان جمع آوری و آلودگی آن ها نسبت به pvx به وسیله آزمون das-elisa با استفاده از آنتی سرم چند همسانه ای مورد تائید قرار گرفت. بر اساس نتایج بدست آمده طول کامل ژنوم دو جدایه معادل 6315 نوکلئوتید و حاوی ژن های rdrp، tgb1، tgb2، tgb3 و cp می باشند. مقایسه ترادف های بدست آمده نشان داد که میزان مشابهت ترادف نوکلئوتیدی دو جدایه 3/98 درصد می باشد. نتایج حاصل از این تحقیق بیانگر تشابه بالای ترادف نوکلئوتیدی ژنوم و آمینو اسیدی ژن های این دو جدایه با یکدیگر می باشد. میزان مشابهت ترادف نوکلئوتیدی ژن های rdrp، tgb1، tgb2، tgb3 و cp جدایه ker.la.2 با جدایه ker.za.1 به ترتیب 5/95، 2/96، 7/99، 2/96 و 9/97 درصد و میزان مشابهت ترادف اسید های آمینه ژن های دو جدایه با یکدیگر به ترتیب 3/98، 2/98، 100، 7/95 و 06/99 درصد می باشند.
منابع مشابه
اثبات بیماری زائی ژنوم همسانه سازی شده، انتقال و دامنه میزبانی جدایه ایرانی ویروس پیچیدگی برگ گوجه‌فرنگی
جدایه ایرانی ویروس پیچیدگی برگ گوجه‌فرنگی یکی از عوامل ایجاد کننده بیماری پیچیدگی برگ گوجه‌فرنگی است که توسط سفید بالک انتقال می‌یابد. بمنطور اثبات بیماری‌زائی ژنوم کامل این ویروس یک همسانه 5/1 برابر ژنوم در حامل دوگانه pBin19 ساخته شد و به باکتری Agrobacterium tumefaciens منتقل و از این طریق به گیاهچه‌های گوجه‌فرنگی، توتون، تاتوره و چند گیاه دیگر مایه‌زنی گردید. علائم خفیف شامل پیچیدگ...
متن کاملمکانیسم مقاومت در برابر تجمع ویروس برگ قاشقی سیب زمینی (Potato leafroll virus=PLRV) در سیب زمینی همسانه G8107(1) *
ژن خاموشی پس از ترا نویسی (Post-transcriptional gene silencing =PTGS) به عنوان یک مکانیسم طبیعی که به وسیله آن گیاهان اسیدهای نوکلئیک بیگانه مانند ژنوم ویروس‌ها را شناسایی و تجزیه می‌کنند مطرح است. در این مطالعه فرض شد که در مقاومت سیب زمینی همسانه G8107(1) در برابر تجمع PLRV نیز چنین مکانیسمی دخالت دارد. این فرضیه با آزمایش انتقال ویروس از طریق پیوند آزمون شد. در این آزمایش قطعاتی از ساقه‌ها...
متن کاملتعیین توالی کامل جدایه ایرانی ویروس موزاییک چغندرقند
ویروس موزاییک چغندر (Beet mosaic virus, BtMV)، تنها پوتی‌ویروس آلوده‌کننده چغندرقند بوده و امروزه در سراسر چغندرکاری‌های جهان پراکنش دارد. در مطالعه حاضر ژنوم کامل جدایه‌ای از این ویروس (Ir-VRU) با استفاده از آغازگرهای دژنره عمومی پوتی‌ویروس‌ها، آغازگرهای اختصاصی طراحی شده و همچنین روش 5'-RACE برای اولین بار در ایران توالی یابی شد. ژنوم کامل جدایه ایرانی BtMV، بدون در نظر گر...
متن کاملهمسانه سازی ژنوم های کامل و قطعات بزرگ dna
همسانه سازی قطعات بزرگ dna در خیلی از موارد برای مطالعه دقیق تر قطعات کلون شده ضروری است از این رو تلاش های زیادی برای همسانه سازی قطعات برزرگ dna یی و حتی ژنوم های کامل صورت گرفته است . مطالعات صورت گرفته نشان می دهد که با بهره گیری از روش های معمول ژنتیکی می توان این قطعات بزرگ و حتی ژنومهای کامل اندامکی ، باکتریایی و ویروسی را همسانه سازی نمود .این کار می تواند از طریق همسانه سازی قطعات ژنوم...
متن کاملخالصسازی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل ویروس موزائیک زرد کدو- جدایه فارس
ویروس موزائیک زرد کدو (Zucchini yellow mosaic virus) ازنمونههای کدوی دارای علایم موزائیک، تاولی شدن و بدشکلی برگ و میوه و کاهش رشد از مزارع منطقه کفترک شیراز به کمک آزمون الیزا، جداسازی و یک نمونه به‌عنوان جدایه فارس این ویروس ((ZYMV-F به منظور انجام مراحل بعدی تحقیق بررسی شد. ZYMV-F در شرایط گلخانه در کدو تکثیر و از بافتهای آلوده برای خالصسازی فیزیکی ویروس استفاده شد. از آنتی‌سرمب...
متن کاملخالص سازی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل ویروس موزائیک زرد کدو- جدایه فارس
ویروس موزائیک زرد کدو (zucchini yellow mosaic virus) ازنمونههای کدوی دارای علایم موزائیک، تاولی شدن و بدشکلی برگ و میوه و کاهش رشد از مزارع منطقه کفترک شیراز به کمک آزمون الیزا، جداسازی و یک نمونه به عنوان جدایه فارس این ویروس ((zymv-f به منظور انجام مراحل بعدی تحقیق بررسی شد. zymv-f در شرایط گلخانه در کدو تکثیر و از بافتهای آلوده برای خالصسازی فیزیکی ویروس استفاده شد. از آنتیسرمبه دست آمده...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده کشاورزی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023