تهیه شناسنامه مولکولی و ارزیابی روابط ژنتیکی ارقام خرمای بومی ایران با استفاده از مارکرهای rapd و issr

پایان نامه
چکیده

خرما یکی از محصولات باغی مهم است. اهمیت خرما به دلیل صادراتی بودن آن و نیز ارزش غذایی بالا و محصولات متعدد و متنوعی دیگری است که از آن بدست می آیند. شناخت تنوع ژنتیکی و طبقه بندی ذخایر توارثی (ژرم پلاسم) از فعالیت های مهم و ضروری در به نژادی و مدیریت حفظ ذخایر ژنتیکی گیاهان می باشد. در این تحقیق 75 نمونه از 15 جمعیت درخت خرما به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی توسط نشانگرهای مولکولی issr و rapd مورد بررسی قرار گرفتند. در بررسی تنوع ژنتیکی این نمونه ها از 14 آغازگر 17 و 18 نوکلئوتیدی issr در مجموع 162 باند تولید شد که از میان آن ها 155 باند چندشکل بودند. بیشترین تعداد الل های تکثیر شده و تعداد الل های چندشکل مربوط به آغازگر 886 ubc، بیشترین شاخص محتوای چندشکلی مربوط به 884 ubc و بیشترین شاخص نشانگر مربوط به 840 ubc است. بیشترین و کمترین تشابه ژنتیکی نیز به ترتیب بین جمعیت های دیری و گنتار (994/0) و کبکاب با هر یک از جمعیت های دیری و گنتار (941/0) مشاهده شد. همچنین استفاده از 10 آغازگر 10 نوکلئوتیدی rapd در بررسی تنوع ژنتیکی 132 باند تولید شد که 122 باند از میان آن ها چندشکل بودند. بیشترین تعداد کل الل های تکثیر شده، تعداد الل های چندشکل، شخص محتوای چندشکلی و نیز بیشترین شاخص نشانگر مربوط به 211 oligo است. همچنین در روش rapd نیز مشخص شد که بیشترین و کمترین تشابه ژنتیکی به ترتیب میان دو جمعیت گنتار و دیری (993/0) و خضراوی با هر یک از جمعیت های گنتار و دیری (945/0) مشاهده شد. مقادیر ضریب همبستگی کوفنتیک بین ماتریس عدم تشابه دایس و تجزیه خوشه ای در دو روش issr و rapd به ترتیب 873/0 و 884/0 برآورد گردید و تجزیه خوشه ای در هر دو سیستم نشانگری issr و rapd با استفاده از روش nj و ماتریس عدم تشابه دایس انجام گرفت. تجزیه خوشه ای در دو روش issr و rapd به ترتیب 15 جمعیت مورد بررسی را در 2 و 3 گروه قرار داد. همبستگی بالای دو ماتریس عدم تشابه دایس در روش rapd و issr (988/0 = r) نشان دهنده همخوانی اطلاعات دو سیستم نشانگری استفاده شده در تعیین هویت مولکولی جمعیت های مورد نظر می باشد. تجزیه واریانس مولکولی تلفیق دو نشانگر نیز نشان داد که اختلاف بین جمعیت های مختلف استفاده شده در این تحقیق از لحاظ الل تکثیر شده در دو سیستم نشانگری issr و rapd معنی دار است. نتایج این پژوهش نشان داد که هر دو نشانگر issr و rapd روش-های کارآمد برای مطالع تنوع ژنتیکی میان جمعیت های خرما می باشند.

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام انار ایران (Punica granatum L.) با استفاده از نشانگرهای RAPD و ISSR

با توجه به تنوع بالای مورفولوژیکی در ارقام انار ایران، تنوع ژنتیکی 24 رقم انار با استفاده از نشانگرهای RAPD و ISSR مورد بررسی قرار گرفت. آغازگرهای RAPD در مجموع 131 قطعه DNA تکثیر نمودند که 29 قطعه آنها (14/22 درصد) چندشکل بودند. آغازگرهای ISSR نیز از مجموع 173 قطعه تکثیر شده، 29 (37 درصد) چند‌شکلی حاصل نمودند. میانگین محتوای اطلاعات چندشکل (PIC) برای آغازگرهای RAPD و ISSR به ترتیب 128/0 و 163/...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی ارقام مختلف پنبه با استفاده از مارکرهای مولکولی RAPD

  سابقه و هدف : پنبه یکی از مهم ترین محصولات گیاهی در ایران است و در نواحی مختلفی کشت می شود . کشت مداوم یکسری از   ژنوتیپ ها منجر به فرسایش ژنتیکی در دراز مدت می گردد، بنابر این مطالعه تنوع ژنتیکی و معرفی ارقامی با تنوع ژنتیکی بالا امری مهم و ضروری است .   مواد و روش ها : در این مطالعه تنوع ژنتیکی ده رقم مختلف پنبه تتراپلوئید (.Gossypium hirsutum L) با استفاده از روش مولکولی RAPD مورد ارزیابی ...

متن کامل

ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام انار ایران (punica granatum l.) با استفاده از نشانگرهای rapd و issr

با توجه به تنوع بالای مورفولوژیکی در ارقام انار ایران، تنوع ژنتیکی 24 رقم انار با استفاده از نشانگرهای rapd و issr مورد بررسی قرار گرفت. آغازگرهای rapd در مجموع 131 قطعه dna تکثیر نمودند که 29 قطعه آنها (14/22 درصد) چندشکل بودند. آغازگرهای issr نیز از مجموع 173 قطعه تکثیر شده، 29 (37 درصد) چند شکلی حاصل نمودند. میانگین محتوای اطلاعات چندشکل (pic) برای آغازگرهای rapd و issr به ترتیب 128/0 و 163/...

متن کامل

ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام و ژنوتیپ‌های بومی مختلف انگور (Vitis vinifera) با استفاده از نشانگرهای ISSR

انگور یکی از مهمترین محصولات باغی است که به­دلیل ارزش اقتصادی و غذایی آن به­طور گسترده کشت می­شود. به­منظور دست­یابی به ارقام جدید با عملکرد بالا و صفات کیفی بهتر، شناسایی ارقام موجود ضروری است. برخی از گونه­های وحشی انگور در معرض فرسایش ژنتیکی قرار دارند؛ لذا تعیین تنوع ژنتیکی ارقام و ژنوتیپ­های وحشی انگور به­منظور توسعه برنامه­­های اصلاحی آینده انگور دارای اهمیت بالایی می­باشد. در این تحقیق ت...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی جمعیتهای باریجه (Ferula gummosa Boiss.) ایران، با استفاده از مارکرهای مولکولی RAPD

در این تحقیق، از نشانگر مولکولی RAPD برای تعیین تنوع ژنتیکی 13 جمعیت باریجه (Ferula gummosa Boiss.) ایران استفاده شد. هفت پرایمر مورد استفاده، تعداد 69 باند قابل‌تشخیص ایجاد نمودند که 94% آنها (64 باند) در بین جمعیتهای مختلف چند شکلی نشان دادند. تعداد متوسط باندها به ازای هر آغازگر 14/9 بود. برای تعیین میزان تشابه بین جمعیتها، از ضریب تشابه دایس استفاده گردید. بیشترین میزان تشابه (80/.) بین دو ...

متن کامل

بررسی روابط ژنتیکی ارقام کلزا با استفاده از نشانگرهای RAPD

Limited geographic area and focused modification of rapeseed during of its breeding cases have been led to the limited genetic basis. So, the evaluation of genetic diversity in modern cultivars of canola to estimating and maintain of genetic resources is essential. In this study, the genetic diversity of 45 genotypes of rapeseed was investigated using 12 RAPD markers .Cluster analysis by Dice c...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ایلام - دانشکده کشاورزی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023