بررسی ساختاری و ترمودینامیکی تری پپتید hco-val-gly-gly-nh2 با استفاده ازمحاسبات مکانیک کوانتومی

پایان نامه
چکیده

در این تحقیق می توان به نتایج زیر دست یافت : نتایج محاسبات برای کنفورماسیون های مختلف حاصل از چرخش زنجیر جانبی آمینواسید والین برای تری پپتیدهای val-gly-gly-nh2-hco ? hco-gly-gly-val-nh2 وhco-gly-val-gly-nh2 در دو فرم l و dدر سطح تئوری b3lyp با سری پایه (d)g31-6 به کمک نرم افزار گوسین ?سه مینیمم در زوایای ?60 =? ، ?180 = ? و? 60- = ? نشان داد ، که به ترتیب : گوچ مثبت (+g) ، آنتی (a) و گوچ منفی (g-) نامگذاری شدند . با توجه به محاسبات بدست آمده برای فرم l پایدارترین حالت ?60- ? ? و برای فرم d پایدارترین حالت شامل ?60 = ? می باشد . بررسی نقشه راما چاندران برای تری پپتید های مورد نظر در حالت های x-?l-?l ? x-?l-l? و x-l?-l? برای ?60 = ? ،?180 = ? و?60- = ? نشان داد که کنفورمر l?l?l? در هر سه حالت برای تری پپتیدهای val-gly-gly-nh2-hco و hco-gly-val-gly-nh2 پایدارترین کنفورمر می باشد . در ضمن برای تری پپتید hco-gly-gly-val-nh2 در حالت x-l?-l? برای ?180 = ? در فرم l کنفورمر l?l?l? و برای فرم d کنفورمرd ?l?l? به عنوان پایدارترین کنفورمرها بدست آمدند . همچنین با توجه به نتایج بدست آمده از کنفورمرهای بررسی شده در نقشه های راما چاندران برای دو فرم l و d مقایسه تری پپتیدها در این تحقیق برای این دو فرم نیز انجام شد و حالتهای انانتیومری مورد بررسی قرار گرفت .

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

بررسی ساختاری و تعیین برخی توابع ترمودینامیکی صورتبندی های مختلف تری پپتید hco-gly-l-leu-gly-nh2 با استفاده از محاسبات مکانیک کوانتومی

در این تحقیق، صورتبندی های مدل تری پپتید 2hco-gly-l-leu-gly-nh، که درساختار پلی پپتید پروتئین الاستین می باشد، در اثر چرخش زوایای دووجهی زنجیر جانبی و زوایای پیچشی اسکلت، در فاز گازی مورد مطالعه قرار گرفته است. همه محاسبات با استفاده از برنامه گوسین 2003 و با بهره گیری از سطوح تئوری hf و b3lyp با سری پایه (d) g31-6 انجام شده است. این تحقیق شامل 3 بخش می شود: بخش اول: ابتدا طی دو مرحله ساختاره...

مطالعه کانفورماسیونی دی پپتید محافظت شده hco-gly-l-val-nh2 با استفاده از محاسبات کوانتومی

در این تحقیق ? کنفورماسیون های دی پپتید hco–gly –l–val–nh2 که در پروتئین های متعددی وجود دارد ? در فاز گازی مورد بررسی قرار گرفته است . محاسبات با استفاده از برنامه گوسین 3 و با بهره گیری از سطوح مختلف تئوری و سری های پایه زیر انجام شده است . ? hf/6-31g* ? hf/6–311++g** ? b3lyp/6–31g* ? mp2/6–31g* بدین صورت که ابتدا ساختارهای بهینه و انرژی برای کنفورماسیون های حاصل از چرخش زاویه (?...

بررسی ساختاری و تعیین برخی توابع ترمودینامیکی کنفورمرهای مختلف تری پپتید gly-ser-gly با استفاده از محاسبات مکانیک کوانتومی

در این تحقیق،کنفورماسیون های مدل تری پپتید gly- ser - gly که درساختار پلی پپتید مادر پروتئین فیبروئین می باشد،در اثر چرخش زنجیر جانبی و زوایای پیچشی اسکلت،در فاز گازی مورد مطالعه قرار گرفته است.همه محاسبات با استفاده از برنامه گوسین 2003 و با بهره گیری از سطوح تئوری hf با سری پایه(d)g31-6 وg(d, f)++311- 6 و سطح b3lyp با سری پایه(d)g31-6 انجام شده است. ابتدا ساختارهای بهینه و انرژی برای کنفورما...

15 صفحه اول

مطالعه کنفورمرهای مختلف دی پپتید محافظت شده hco-gly-l-leu-nh2 با استفاده از محاسبات کوانتومی

چکیده : در این تحقیق ، کنفورماسیون های مختلف دی پپتید hco-gly-l-leu-nh2 در اثر چرخش زنجیر های جانبی و زوایای پیچشی اسکلت ، در فاز گازی مورد بررسی قرار گرفته است . محاسبات با استفاده از برنامه گوسین 2003 در سطح hfبا سری پایه 6-31g*و6-311++g** و در سطح b3lyp با سری پایه 6-31g* انجام شده است. در ابتدا از چرخش زاویه زنجیره جانبی (?1) ، به فواصل?30 از صفر تا ?360 درجه ساختار های بهینه و انرژی محا...

15 صفحه اول

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

دانشگاه آزاد اسلامی - دانشگاه آزاد اسلامی واحد شاهرود - دانشکده علوم پایه

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023