استفاده از توصیف کننده های عاری از جهت در مطالعه کمی ساختار-فعالیت ترکیبات بتا-کربولین
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی
- نویسنده والنتین داودیان
- استاد راهنما جهانبخش قاسمی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1390
چکیده
هدف از مطالعه حاضر ایجاد یک مدل کیوسار سه بعدی معتبر با قابلیت پیشگویی بالا برای مجموعه-ای از داروهای ضدتومور می باشد. توصیف کننده های عاری از جهت، توصیف کننده هایی مستقل از هم ترازی و کاملاً قابل درک و قابل تفسیر از نظر شیمیایی هستند. این توصیف کننده ها مشابه روش کومفا از انرژی برهمکنش های برمبنای میدان نیرو مشتق می شوند که در هر نقطه از شبکه احاطه کننده مولکول محاسبه شده اند. متغیرهای استفاده شده در روش grind به صورت بردارهایی هستند که دو نقطه از فضا را با خصوصیات میدانی متفاوت به هم متصل می کنند. بنابراین مدل بهینه نهایی مدل هایی شبیه به مدل های کیفی فارماکوفوری را ارائه می دهند که می توانند یک الگوی فضایی از نحوه اتصالات در سایت فعال پروتئین را در اختیار ما قرار دهند. همچنین جهت بررسی بیشتر از یکی دیگر از روش های کیوسار سه بعدی مستقل از هم ترازی موسوم به روش volsurf استفاده شده است. توصیف گرهای مولکولی volsurf ویژگی های فارماکوشیمیایی و فارماکوسینتیکی ترکیبات را ارائه می کنند، اماgrind بیشتر جهت گیری به سمت ارائه توانایی مولکول برای اتصال با بیومولکول ها را دارد و بنابراین برای ارائه خواص فارماکودینامیکی مناسب تر است. با وجود تفاوت در ماهیت توصیف کننده ها در دو روش نتایج نسبتاً یکسانی حاصل شده است
منابع مشابه
اثرات غلظت های مختلف رقیق کننده منی عاری از ترکیبات حیوانی بر ویژگی های اسپرم بز در شرایط سرد
یک حجم منی به دست آمده از 4 راس بز نژاد مهابادی 3-4 ساله در فصل تولیدمثلی در 20 حجم رقیق کننده بر پایه بافر تریس حاوی مقادیر 0/5، 1، 1/5، 2 و 2/5 درصد لسیتن سویا به عنوان افزودنی با منشا غیرحیوانی و یک درصد زرده تخم مرغ به عنوان افزودنی با منشا حیوانی مخلوط شد و اثرات افزودنی ها بر جنبایی کل و پیش رونده، زنده مانی، یک پارچگی غشاء و میزان اسپرم...
متن کاملاثرات غلظت های مختلف رقیق کننده منی عاری از ترکیبات حیوانی بر ویژگی های اسپرم بز در شرایط سرد
یک حجم منی به دست آمده از 4 راس بز نژاد مهابادی 4-3 ساله در فصل تولیدمثلی در 20 حجم رقیق کننده بر پایه بافر تریس حاوی مقادیر 0/5، 1، 1/5، 2 و 2/5 درصد لسیتن سویا به عنوان افزودنی با منشا غیرحیوانی و یک درصد زرده تخم مرغ به عنوان افزودنی با منشا حیوانی مخلوط شد و اثرات افزودنی ها بر جنبایی کل و پیشرونده، زنده مانی، یک پارچگی غشاء و میزان اسپرم های دارای ...
متن کاملمقایسه روش های سنجش فعالیت آنزیم تجزیه کننده ترکیبات ارگانوفسفره با استفاده از تکنیک های اسپکتروسکوپی، FPLC و ISE
سابقه و هدف: امروزه تولید آنزیم های با قابلیت تجزیه ترکیبات ارگانوفسفره مثل ارگانوفسفات هیدرولاز(OPH) شناسایی از اهمیت ویژهای برخوردار است. تولید این آنزیم ها با کارایی بالا یکی از اهداف مهندسی پروتئین است. بنابراین استفاده از تکنیک های کارا برای اندازه گیری فعالیت آنزیم مهم می باشد. مواد و روش ها: در این تحقیق از تکنیک سنجش یونی[1] جهت بررسی میزان تجزیه دی ایزوپروپیل فلوروفسفاتاز( DFP )و با تک...
متن کاملروش های خطی و غیرخطی ارتباط کمی ساختار- فعالیت جهت پیش بینی فعالیت دارویی برخی از مشتقات آمینواسیدها
این پژوهش به پیش بینی فعالیت دارویی 38 مشتق آمینواسید به عنوان بازدارنده های هیستون دی استیلاز (hdac) جهت درمان سرطان و برخی از بیماری ها اختصاص دارد. آنزیم های hdac موجب تسریع روند حذف گروه های استیل از باقیمانده های لیزین از پروتیین های شامل هیستون (histone) می شوند. پس از محاسبه ی توصیف کننده های مولکولی مستقل، با استفاده از روش مرحله ای انتخاب متغیر و گزینش 4 توصیف کننده، جهت مدل سازی از رگ...
متن کاملرابطه ساختار- فعالیت در برخی ترکیبات فسفرآمید
با استفاده از تکنیک QSAR در سال‌های اخیر روابط ریاضی بسیاری در ارتباط بین ساختار شیمیایی و فعالیت بیولوژیکی ترکیبات هم‌خانواده بدست آمده است. در این روش با انتخاب مولکول‌هایی با خواص الکترونی، فضایی و آبگریزی معین، تغییرات هدفداری در ساختار عمومی ترکیب مادر ایجاد می‌شود. با اندازه‌گیری خواص شیمی ـ فیزیکی و فعالیت بیولوژیکی (سمیت، فعالیت دارویی) و یا هر فعالیت بیولوژیکی دیگر، یک خانواده از مولکو...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023