مقایسه ترادف قطعات 6 تا 10 ژنوم ویروس کوتولگی زبر ذرت (mrdv) و ویروس کوتولگی گال سیاه برنج (rbgdv).

ویروس کوتولگی زبر ذرت (maize rough dwarf virus, mrdv) یکی از ویروسهای مهم ذرت در دنیا است که در جنوب ایران نیز هرساله خسارتهای زیادی به این محصول مهم وارد میکند به طوری که در سالهای 85-82 خسارتهای زیادی به ذرت کاران وارد کرد. mrdv متعلق به جنس فیجی ویروس از تیره رئوویریده میباشد. ژنوم mrdv شامل 10 قطعه (s1-s10) آر-ان-ای دو رشته ای است که در پیکره های ایزومتریک با پوشش پروتئینی دولایه قرار میگیرد. تحقیق حاضر به منظور تعیین ترادف کامل 5 قطعه از ژنوم این ویروس: s6,s7,s8,s9,s10 صورت گرفته است. بدین منظور گیاهان ذرت با علائم مشخص کوتولگی و گال های ریز (توته ای) در سطح زیرین برگ از مزارع استان فارس جمع آوری شد. پس از اثبات آلودگی با آزمون الیزا، ویروس با روش خالص سازی فیزیکی (از طریق سانتریفوژ کردن افتراقی) از برگ های آلوده گیاه استخراج شد. آزمون rt-pcr با استفاده از آغازگرهای اختصاصی انجام شد. محصول pcr با استفاده از ins t/a clone pcr product cloning kit (fermentas) در پلاسمید ptz57r/t در سویه dh5? باکتری e. coli همسانه سازی شد و پلاسمید حاوی قطعات استخراج و ترادف آنها تعیین گردید. پس از تعیین ترادف قطعات و مقایسه آنها با ترادف های سایر فیجی ویروسهای موجود در بانک ژن، با برنامه های ,dnaman dnastar و mega4 آنالیزهای فیلوژنتیک صورت گرفت. نتایج حاکی از آن بود که این ویروس با وجود شباهتهای زیاد به rbsdv(چین) و mrdv(ایتالیا)، از نظر فیلوژنی با این دو ویروس متمایز است. ترادف کامل نوکلئوتیدی این ویروس در ایران برای اولین بار گزارش میشود