طراحی و ساخت یک واریته کوچک ساختاری از آلفا 1-آنتی تریپسین با حفظ فعالیت مهاری

پایان نامه
چکیده

آلفا1-آنتی تریپسین (?-1 antitrypsin, aat) یکی از اعضاء سوپر فامیلی سرپین ها و از مهار کننده های الاستاز نوتروفیل است.aat دارای ساختار دوم ویژه شامل سه صفجه بتا , نه آلفا هلیکس و لوپ مرکزی واکنشگر (rcl) می باشد. aat، پروتئازهای هدف را با تشکیل یک کمپلکس پایدار مهار می کند که در این حالت rcl برش یافته و درون ?-sheet a درج می شود که همراه با تغییر کانفورماسیون در aat می باشد. پلیمریزاسیون خود به خودی و ناپایداری پروتئین aat چالش های پیش رو در تولید دارو علیه بیماری های نقص آلفا 1- آنتی تریپسین می باشند. بنابراین هدف، تولید داروهایی با درجه پلیمریزاسیون کمتر و پایداری بالاتر است. به علاوه داروهایی با اندازه کوچکتر توسط سیستم تحویل دارو ترجیح داده می شوند. بنابراین ما در این تحقیق اندازه پروتئین را از ناحیه n-- ترمینال کاهش دادیم. به منظور بررسی تاثیر حضور قطعه n - ترمینال (رزیدوهای 1 تا 43) روی خواص ساختاری aat ، لوپ و ناحیه ?-helix در ابتدای n- ترمینال از ساختار حذف شدند. سپس زمان 10ns شبیه سازی دینامیک مولکولی برای پروتئین طبیعی و پروتئین جدید با اندازه کوچکتر انجام شد. ویژگیهای ساختاری نظیر کانفورماسیون ساختار، root mean square ، fluctuation ، internal non bonded interactions و total accessible surface area(asa) برای ساختارهای نتیجه شده از هر جریان md مقایسه شدند. این نتایج هیچ تفاوت قابل توجهی را در این ویژگی ها برای دو ساختار مذکور نشان نداد. بنابراین این یافته ها دلایل مطمئنی برای ادامه این مطالعه در در زمینه تجربی را فراهم کردند. در فاز آزمایشگاهی دو aat طبیعی و تغییر یافته جدید ساخته شد. هر یک از ساخته ها در وکتور pgapz? درج شدند و جداگانه درون مخمر pichia pastoris (سویه x33) ترانسفورم شدند. ارزیابی فعالیت مهاری با روش tic هیچ تفاوت قابل ملاحظه ای را در دو ساختار نشان نداد

منابع مشابه

بررسی فنوتیپ ها و فعالیت مهاری الفا - یک آنتی تریپسین در بیماران آمفیزم

ABSTRACT Alpha 1-Antitrypsin is one of the most important serine protease in human serum,inhibiting several proteases.As an inhibitor of proteases it is a non-specific lever in humoral defence of the body. Its level increases significantly under the infections condition of pregnancy. The health of lung,too, depends on maintaininig the equilibrium of protease antitrypsin ,and Alpha 1-trypsin p...

متن کامل

بررسی تغییرات آلفا-1 – آنتی تریپسین (1 –AT) در سرم بیماران هیپوتیروئیدی

Alpha-1- Protease inhibitor or a1-Antitrypsin (a1-AT) is an a1-glycoprotein and a small molecule which acts as an extracellular inhibitor of serin proteases. It seems that this molecule protein has a protective role in tissues such as inhibition (inactivation) of elastase, colagenase, etc. a1-AT deficiency is a hereditary disorder which characteristed by reduced a1-AT serum level and may ...

متن کامل

مهندسی آلفا- 1 آنتی تریپسین انسانی با هدف کاربرد استنشاقی

آلفا 1-آنتی تریپسین (?1at) گلیکوپروتئین 394 اسیدآمینه ای و دارای 3 جایگاه گلیکوزیلاسیون است که متعلق به خانواده سرین پروتئاز می باشد و می تواند رنج وسیعی از پروتئازها را مهار کند. ?1at ریه را از نوتروفیل الاستاز در حالت التهابی و عفونی محافظت می کند بنابراین مهارکننده نوتروفیل الاستاز نامیده می شود. عدم حضور یا عملکرد ناکارآمد ?1at در ریه منجر به عملکرد کنترل نشده الاستاز و شکست الاستین می شود ...

 - TGF ، سنتز آلفا ـ 1 ـ آنتی تریپسین را در سلولهای هپاتومای انسانی (HepG2)

Cytokines protein or glycoproteins synthesized by a wide range of cell types including lymphocytes, macrophages, platelets, and monocytes. Cytokines induse synthesis of acute phase protein in hepatocytes. So far eight cytokines has been shown can induce acute phase protein synthesis in hepatocyte and hepatoma cell culture. There are evidences that transforming growth factor-alpha (TGF-a) secr...

متن کامل

مقایسه فعالیت آلفا-۱-آنتی تریپسین در افراد چاق با افراد دارای وزن طبیعی

زمینه و هدف: چاقی از اولویت های مهم بهداشتی در جهان است چرا که باعث افزایش مریضی و اختلال در کیفیت زندگی می شود. آلفا-1-آنتی تریپسین (aat) فراوان ترین مهارکننده پروتئاز در خون است می­کند. بنابراین نقص یا کمبود آن به طور قابل توجهی خطر ابتلا به بیماری های مختلف را افزایش می دهد.  aat ممکن است در توسعه و عوارض چاقی نقش داشته باشد. این مطالعه جهت تعیین فعالیت aat در افراد چاق در مقایسه با افراد دا...

متن کامل

بررسی سطح سرمی پروتئین آلفا-1-آنتی تریپسین با روش زون کاپیلاری الکتروفورز در بیماران مبتلا به سرطان مولتیپل میلوما در مرحله‌‌ی یک بیماری

Background & Aims: Acute phase proteins are synthesized mainly by the liver and macrophages in an inflammatory conditions as a result of some trauma and malignancies. Increased levels of these proteins have been reported in many cancer tumors and multiple myeloma as an important indicator of prognosis of malignancies. Because of importance of this issue, we investigate the serum level ...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023