نتایج جستجو برای: seq ssr .
تعداد نتایج: 22807 فیلتر نتایج به سال:
Identification of microsatellites, or simple sequence repeats (SSRs), can be a time-consuming and costly investment requiring enrichment, cloning, and sequencing of candidate loci. Recently, however, high throughput sequencing (with or without prior enrichment for specific SSR loci) has been utilized to identify SSR loci. The direct "Seq-to-SSR" approach has an advantage over enrichment-based s...
از بین نشانگر های به کار رفته در prunus، نشانگر های ریزماهواره مبتنی بر ژنوم، اطلاعات پیرامون فرایند های مرتبط با بخش بندی رویشگاه ها و جمعیت های کوچک، توزیع تنوع آللی، ارایه ی الگو های مدیریت ژرم پلاسم و روابط ژنتیکی در زمینه حفاظت ژنتیکی را بهبود بخشیده است. به علاوه بررسی ترانسکریپتومیک و ژنومیک امکان مطالعه تنوع عملکردی ژن ها، ناشی از عملکرد حاصل از بخش بندی رویشگاه، تنوع میزان مقاومت در بر...
High-throughput sequencing has been dramatically accelerating the discovery of microsatellite markers (also known as Simple Sequence Repeats). Both 454 and Illumina reads have been used directly in microsatellite discovery and primer design (the "Seq-to-SSR" approach). However, constraints of this approach include: 1) many microsatellite-containing reads do not have sufficient flanking sequence...
The transcriptome sequencing approach RNA-seq represents a powerful tool for transcriptional analysis and development of simple sequence repeat (SSR) markers nonmodel crop. In the Perilla crop, distribution different motifs showed that most abundant type was dinucleotide repeats (62.0%), followed by trinucleotide (35.3%), with two together comprising 97.3% eSSR repeats. this study, we developed...
Flowering Chinese cabbage is one of the most important vegetable crops in southern China. Genetic improvement of various agronomic traits in this crop is underway to meet high market demand in the region, but the progress is hampered by limited number of molecular markers available in this crop. This study aimed to develop EST-SSR markers from transcriptome sequences generated by next-generatio...
*Correspondence: Andrey Tatarenkov, Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of California, 441 Steinhaus Hall, Irvine, CA 92697-2525, USA e-mail: [email protected] For more than two decades, mitochondrial DNA sequences and simple sequence repeats (SSRs, or microsatellite loci) have served as gold standards in population genetics. More recently, next generation sequencing (NGS)...
توسعه برنامه‌های به‌نژادی عدس برای مقابله با عوامل نامساعد محیطی نسبت به سایر حبوبات، به علت کمبود منابع ژنتیکی با چالش‌های بیشتری روبرو می‌باشد. نشانگرهای EST-SSR به‌دلیل ایجاد چندشکلی در نواحی کدکننده ژن‌ها، یکی از پرکاربردترین نشانگرهای مولکولی در بسیاری از برنامه‌های اصلاحی به‌شمار می‌روند. از این‌رو در تحقیق حاضر به‌منظور توسعه نشانگرهای EST-SSR در مقیاس بالا، از فرآیند سرهم‌بندی مجموعه خو...
توسعه برنامه‌های به‌نژادی عدس برای مقابله با عوامل نامساعد محیطی نسبت به سایر حبوبات، به علت کمبود منابع ژنتیکی با چالش‌های بیشتری روبرو می‌باشد. نشانگرهای EST-SSR به‌دلیل ایجاد چندشکلی در نواحی کدکننده ژن‌ها، یکی از پرکاربردترین نشانگرهای مولکولی در بسیاری از برنامه‌های اصلاحی به‌شمار می‌روند. از این‌رو در تحقیق حاضر به‌منظور توسعه نشانگرهای EST-SSR در مقیاس بالا، از فرآیند سرهم‌بندی مجموعه خو...
Transcriptome analysis is an efficient way to explore molecular markers in plant species, for which genome sequences have not been published. To address the limited number of markers published for the Welsh onion, this study found 6486 loci of genic simple sequence repeats (SSR), which consisted of 1–5 bp repeat motifs, based on next-generation sequencing (NGS) technology and the RNA-Seq approa...
بادام و گونه های وحشی آن که در مرکز و غرب آسیا گسترش یافته اند، دارای تنوع ژنتیکی بسیاری می باشند و به این دلیل منبع مهمی برای استفاده در اصلاح نباتات محسوب می شوند. در این مطالعه تنوع ژنتیکی 19 رقم بادام (prunus dulcis)، شامل 10 رقم بادام ایرانی و 9 رقم بادام خارجی مورد بررسی و تجزیه و تحلیل قرار گرفت و سعی شد تا رابطه و تنوع ژنتیکی میان این ارقام با استفاده از 12 جفت آغازگر rna-seq ssr شناسا...
نمودار تعداد نتایج جستجو در هر سال
با کلیک روی نمودار نتایج را به سال انتشار فیلتر کنید