در این مقاله پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی بر پایه توالی اسید های آمینه آن ارائه خواهد شد. برای تعریف فاکتوری به منظور تشخیص میزان انعطاف پذیری از انرژی دو اسید آمینه متوالی استفاده شد. با استفاده از تحلیل های آماری برروی این انرژی، عددی بین صفر و صد به هر جفت اسید آمینه تعلق می گیرد که آنرا عدد انعطاف پذیری می نامیم. در نظر گرفتن اثرات همسایه ها تا چهار همسایه اسید آمینه باعث بهبود پیشگو...

برخی از موجودات سردزی پروتئینی به نام پروتئین های ضدیخ را تولید می کنند که مایع های سلول را دربرابر یخ زدگی محافظت می کنند. این دسته از پروتئین ها در افزایش تحمل دانه های گیاهان در برابریخ زدگی، نگهداری بافت ها در شرایط سرد و تولید گیاهان سردزی کاربرد دارند. شناسایی پروتئین های ضدیخ به خاطر شباهت بسیار کم توالی ها مشکل می باشد. برخی از محققین این موضوع را جهت مطالعه انتخاب کردند اما هنوز درصد د...

بار، ممان دوقطبی و مقادیر ویژه ممان چهارقطبی بعنوان خواص فیزیکوشیمیایی برای پیشگویی عملکردِ اتّصال پروتئینها به ریبونوکلئیک اسید در این تحقیق مورد استفاده قرار گرفتند. از روش ساده و کارآی لوژستیک رگرسیون برای انجام عمل پیشگویی استفاده شد. در معادله لوجیت حاصل، پارامتر بار بیشترین ضریب (19/19) و بیشترین تاثیر را در پیشگویی داشت و بعد از آن پارامتر ممان دوقطبی اهمیت داشت. روش لوژستیک رگرسیون بصورت ...

پروتئینها ماکروملکولهایی هستند که تمام اعمال مهم در ارگانیسمها از جمله انتقال مواد غذایی، تشخیص و انتقال پیامها انجام میدهند. از آنجا که عملکرد پروتئینها وابسته به ساختار فضایی آنهاست، پیشگویی ساختار فضایی پروتئین حائز اهمیت است. هدف از این تحقیق پیشگویی ساختار پروتئین با استفاده از اطلاعات ساختاری ساختار دوم است. در روش پیشنهادی در این تحقیق، با استفاده از الگوریتم رقابت استعماری، تعدادی ساختا...

پژوهش حاضر به منظور ارزیابی سور فکتانت آنیونی SDS در شرایط مختلف محیطی بر دینامیک رشد جلبک دونالیلا ویریدیس انجام گردید. تاثیر این ماده با غلظت های 0/1 ، 1 و 10 میلی گرم بر لیتر و اسیدیته 7، 8، 9 و 10 بر محیط کشت دونالیلا مورد بررسی قرار گرفت. نرخ رشد جلبک در هر سه محیط حاوی دوزهای مختلف از این ماده در روز های ششم وهفتم مطالعه مقدار کمتر از 20٪ را نسبت به کنترل نشان می دهد. نرخ رشد نسبت به شاهد...

بسیاری از عملکردهای rna به تعاملات بین rna و پروتئین ها وابسته است چنانکه درک مکانیزم مولکولی تعاملات rna و پروتئین یکی از مباحث اصلی در علم بیوانفورماتیک به شمار می رود. تعاملات پروتئین و rna نقش مهمی در گستره ی وسیعی از فرآیندهای مختلف سلولی از جمله پیوند و ساخت پروتئین، بیان ژن، پردازش rna، مکانیزم دفاع سلولی و تنظیم رونویسی در بیان ژن جهت مقابله با عوامل بیماری زا دارند. روش های آزمایشگاهی ...

برهمکنش های بین پروتئین های غشایی از دیدگاه عملکردی و درمانی حائز اهمیت فراوان هستند. نظر به ضرورت روش های محاسباتی در مورد این پروتئین ها و نیز با توجه به اینکه توزیع نامتقارن کلاس ها کارایی پیشگویی جایگاه های برهمکنش پروتئین ها را تا حد زیادی تحت تاثیر قرار می دهد، این مطالعه به یافتن راه-حلی برای پرداختن به این مساله در پیشگویی جایگاه های برهمکنش پروتئین های غشایی اختصاص داده شد. به این منظو...

بار، ممان دوقطبی و مقادیر ویژه ممان چهارقطبی بعنوان خواص فیزیکوشیمیایی برای پیشگویی عملکرد اتّصال پروتئینها به ریبونوکلئیک اسید در این تحقیق مورد استفاده قرار گرفتند. از روش ساده و کارآی لوژستیک رگرسیون برای انجام عمل پیشگویی استفاده شد. در معادله لوجیت حاصل، پارامتر بار بیشترین ضریب (19/19) و بیشترین تاثیر را در پیشگویی داشت و بعد از آن پارامتر ممان دوقطبی اهمیت داشت. روش لوژستیک رگرسیون بصورت ...

پیشگویی ساختار دوم پروتئین مرحله ای حد واسط در پیشگویی ساختار سوم با استفاده از توالی اسیدآمینه های پروتئین می باشد. از آنجا که پیچ بتا جزیی بسیار مهم از ساختار دوم پروتئین است. بنابراین پیشگویی پیچهای بتا و انواع آنها برای پیشگویی ساختار دوم ضروری می باشد. هدف از این مطالعه، پیشگویی انواع پیچهای بتا با استفاده از مدل ترکیبی دو مرحله ای شامل روش آماری آنالیز ممیزی خطی و روش غیرخطی شبکه عصبی مصن...

چکیده ندارد.