مولکول پروتئین زنجیره خطی از اسید آمینه ها است. پیش بینی برهم کنش های پروتئین-پروتئین یک مسئله مهم در بیوانفورماتیک و سیستم های زیستی به حساب می آید. در حقیقت استخراج برهم کنش های میان پروتئین ها برای ساختن شبکه های برهم کنشی پروتئینی ضروری می باشد. این شبکه ها نقش مهمی در شناخت اکثر فرایندهای زیستی دارند. در سال های اخیر، از روش های آزمایشگاهی با توان عملیاتی بالا برای کشف برهم کنش های پروتئین...

امروزه داروهای ضد صرع از جمله داروهایی هستندکه مورد توجه زیادی واقع شده اند. در این پایان نامه به مطالعه ی داروی لاموتریژن که نوعی داروی ضد صرع می باشد، توسط نظریه تابعیت چگالی و شبیه سازی دینامیک مولکولی پرداخته شده است. پارامترهای میدان نیروی متعلق به این دارو برای اولین بار محاسبه شده است. برای رسیدن به پارامترهای میدان نیروی مورد نظر از طریق نظریه تابعیت چگالی از نر م افزارg09 استفاده شده ا...

در حال حاضر روشهای شبیه سازی به ابزارهای قدرتمندی در تمام زمینه های علوم تبدیل شده اند. این روشها در مقایسه با روشهای مرسوم نظری و تجربی، راه سومی برای مطالعات می باشند که توانائی های بیشتری نسبت به روشهای تجربی در به بوته آزمایش گذاشتن نظریه های پیشرفته نسبت به روشهای آنالیتیک دارند و از آنها در پروسه هایی می توان استفاده کرد که با روشهای تجربی غیرقابل دسترس هستند. از میان روشهای متعدد شبیه سا...

پروتئین بازی میلیان ‏‎(mbp)‎‏ ، یکی از مهمترین پروتئین های صفحه میلینی می باشد. در محلول آبی، حالت پایدار ترمودینامیکی ‏‎mbp‎‏ (18500 ‏‎mw‎‏) ، یک مارپیچ انعطاف پذیر بوده که در آن، پروتئین شامل حدود بیست درصد ساختار ثانوی صفحه ‏‎b-‎‏ می باشد. در خلاف اثر ‏‎(0.1 - 1.0 mm)cu2+ , zn2+ , ca2+‎‏ تفکیک ‏‎mbp‎‏ را از غشا مهار می کنند.برهم کنش ‏‎mbp‎‏ سیستم عصبی مرکزی گاو با یونهای روی مس با تکنیک های ...

بررسی عملکرد توالیهای زیستی در زمره مسائل مورد توجه در حیطه بیو انفورماتیک است. علیرغم مطالعات گسترده در زمینه ی پیشبینی ساختار پروتئینها، تعیین ساختار سه بعدی پروتئین کماکان کار مشکلی است. با توجه به این موضوع که اسیدهای آمینه توسط رشتهای از کاراکترها نشان داده میشوند، لازمه پیشبینی ساختار پروتئینهای جدید، تبدیل اسیدهای آمینه به فرمت عددی است. در این پژوهش، برای توصیف دنبالههای پروتئین، از یک ...

هدف از مطالعه حاضر بررسی بر هم کنش مشتق محلول در آب مورین بنام مورین-´5- سولفونیک اسید وهم چنین کمپلکس های مس (ii) و روی (ii) که حاوی این مشتق می باشند با پروتیین bsa است. این سه ترکیب سنتز و توسط روشهای اسپکتروفتومتری، 1h nmr و آنالیز عنصری شناسایی شدندو سپس نوع پیوند کمپلکس و لیگاند (namsa) باbsa توسط روشهای اسپکتروفتومتری، فلوریمتری، دورنگ نمائی چرخشی بررسی شد. افزایش این ترکیب و کمپلکس به ...

چکیده 1 با توجه به اهمیت مهندسی کریستال و طراحی جامدات بخاطر پتانسیل کاربردشان در زیست مولکولی، علم مواد و علوم مربوط به داروسازی، ما در این پروژه ترکیبات 9-(پیریدینیل)-9-فلورنولها و 9-(2- (پیریدینیل) اتینیل)-9-فلورنولها را تهیه نمودیم که امکان بررسی برهم کنش های بین مولکولی را می دهد. برای این منظور این ترکیبات با بازده های خوبی سنتز شدند و با روشهای اسپکتروسکوپی شناسایی شدند. با بررسی ساختار...

این پایان نامه در دو بخش انجام پذیرفت: در بخش اول، هدف تهیه ی حس گرهای پروتیینی بر پایه ی مشتق های کالیکس[4]آرن گوگرددار پوشش داده شده بر روی نانوذرات تیتانیوم دی اکسید است. به این منظور ابتدا دو ترکیب 5،11،17،23-تتراترشیوبوتیل-25،26،27،28-تتراهیدروکسی-2،8،14،20-تترا-تیوکالیکس[4]آرن و 5،11،17،23-تتراترشیوبوتیل-25،26،27،28-تتراکیس(هیدروکسی-کربونیل متوکسی)-2،8،14،20-تتراتیوکالیکس[4]آرن برای بررس...

در این مقاله بر هم کنش بین متیل اتیل کتون و برخی الکل های نوع دوم (2- پروپانول ، 2- بوتانول ، 2- پنتانول ، 2- هگزانول و 2- هپتانول) با استفاده از روش تجربی و با به کار گیری انتگرال های کرک وود – باف در مطالعه ترمودینامیک محلول ها و پدیده انحلال ترجیحی مورد بررسی قرار گرفته است . برای سیستم های دو جزئی شامل متیل اتیل کتون با برخی الکل های نوع دوم ، پارامترهای Gii ، Gjj ، Gij ، δii ، δjj و δijدر ...

در این تحقیق تولید تشدید در برهم کنش های قوی بین هادرون ها در چارچوب مدل کوارکی خاصی بررسی خواهد شد.تلاش خواهیم کرد ویژگی های فیزیکی برخی از این تشدیدها که به تازگی دیده شد ه اند، را تعیین کنیم. بررسی تشدیدها که با ساخت شتاب دهنده ها آغاز شده است، شاید به 40 سال اخیر برمی گرددکه به شناسایی ذرات زیادی، مزون ها و باریون ها می انجامد. در آزمایش های جدید نیز تشدیدهایی از این دست دیده می شودکه بر...