باکتری آئروموناس هیدروفیلا یک باکتری گرم منفی و متحرک است که به عنوان یک پاتوژن فرصت طلب و زئونوز در ماهیان گرمابی مطرح است. وقوع میزان بالای مرگ و میر در ماهیان، خسارات اقتصادی و مقاومت باکتریایی از عوامل اصلی پیدایش روش های جدید مانند واکسیناسیون علیه آئروموناس هیدروفیلا محسوب می شوند. با توجه به مطالعات اخیر پروتئین غشای خارجی ompts فاکتور حدت باکتری آئروموناس هیدروفیلابوده و نظر به اهمیت سپ...

nestrenconia sp.strain.f یک جنس نمک دوست از خانواده micrococcacae است که ژنوم آن غنی از cg است. توسط نرم افزار rast ژنوم باکتری را بررسی کردیم. این بررسی نشان داد که ژنوم باکتری حاوی ژن endo-1,4-beta-xylanase است. پروتئین های اندو 1و4 بتا زایلاناز ( ec 3.2.1.8) آنزیم های هیدرولاز هستند که پیوند های 1-4 گلیکوزیدیک را در مولکول زایلان از ترکیب همی سلولوز می شکند.مطالعات دینامیک مولکولی مشخص کرد ک...

پروتئین‎ها هرگز به صورت منفرد عمل نمی‎کنند، بلکه از طریق برهم‎کنش با ‎دیگر پروتئین‎ها، عملکردهایشان را اجرا می‎کنند. بررسی این برهم‎کنش‎ها، پایه‎ای برای کشف مکانیسم‎های مولکولی، فرآیندها و مفاهیم زیستی مربوط به عملکردهای پروتئین‎ها می‎باشد. روش‎های آزمایشگاهی مقیاس بزرگ همانند mass spectrometry و yeast two-hybrid ، لیست وسیعی از برهم‎کنش‎های پروتئین- پروتئین را فراهم آورده‎اند، که این داده‎ها ب...

پیشرفت فناوری­های نوین و سرعت تحقیقات علم ژنتیک منجر به تولید حجم بالای اطلاعات ژنتیکی در زمینه های مختلف نظیر توالی نوکلئوتید ها و اسید های آمینه، عملکرد ژن ها و پروتئین ها، جهش یافته ها و فنوتیپ های آن ها، نشانگرها و استفاده از آن ها و موضوعات مرتبط شده است. علاوه بر حجم زیاد اطلاعات ژنتیکی، این اطلاعات پیچیده و دارای تفاوت های ظریف در روش های آزمایشی هستند که می توانند در کیفیت و تفسیر اطلاع...

چکید‌ه از زمان پیدایش آنتی‌بادی‌های مونوکلونال (mAbs) انقلابی در پزشکی در زمینه کیت‌های تشخیصی و داروهای درمانی رخ داده است. یکی از زمینه‌های پیشرفته و رو به ترقی روزافزون در حوزه علم ایمونوانفورماتیک، بیوانفورماتیک آنتی‌بادی‌ها می‌باشد. این زمینه شامل: طراحی آنتی‌بادی، مدلینگ به روش‌های مختلف، بهینه‌سازی و بلوغ افینیتی، داکینگ(Docking)، انسانی‌سازی و کاهش ایمنی‌زایی، پایداری، رفع عیوب مخرب ساخ...

پیشرفت فناوری­های نوین و سرعت تحقیقات علم ژنتیک منجر به تولید حجم بالای اطلاعات ژنتیکی در زمینه‌های مختلف نظیر توالی نوکلئوتید‌ها و اسید‌های‌آمینه، عملکرد ژن‌ها و پروتئین‌ها، جهش‌یافته‌ها و فنوتیپ‌های آن‌ها، نشانگرها و استفاده از آن‌ها و موضوعات مرتبط شده است. علاوه بر حجم زیاد اطلاعات ژنتیکی، این اطلاعات پیچیده و دارای تفاوت‌های ظریف در روش‌های آزمایشی هستند که می‌توانند در کیفیت و تفسیر اطلاع...

چکیده زمینه و هدف: هپاتوسلولار کارسینوما(hcc) سومین عامل اصلی مرگ ناشی از سرطان در سراسر جهان محسوب می شود. ویروس هپاتیت b و ژن hbx آن به واسطه تداخل در مسیرهای سیگنالینگ نقش بسیار مهمی در پیشرفت سرطان hcc دارند. هم چنین به دلیل عدم وجود علائم بالینی در مراحل اولیه‏ی ابتلا، ضرورت شناسایی مارکرهای اختصاصی با حساسیت بالا جهت شناسایی زود هنگام افراد مبتلا به hcc احساس می گردد. از سوی دیگر، با پیشر...

یکی از مسائل مهم وچالش برانگیز در سیستم های بیولوژیکی، کشف مکانیزم هایی است که کنترل بیان ژن را بر عهده دارند. شبکه های تنظیمی ژنی مدل هایی هستند که در سطح ژنی این مکانیزم ها را بررسی می کنند. درک چگونگی ارتباط میان ژن ها در این نوع شبکه ها، یک گام مهم در فهم الگوی بیان ژن محسوب می شود. از آن جا که بسیاری از بیماری ها به دلیل الگوی بیان ژنی ناسالم پدید می آیند، حصول هر اطلاعاتی در این مورد به د...