در این تحقیق با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی به توجیه افزایش نشر ذاتی فلورسانس آنزیم کربنیک انیدراز در حضور توپیرامات و کاهش آن در حضور فیورزماید پرداخته شد. نتایج شبیه سازی ها نشان دهنده فاصله گرفتن آمینواسیدهای تریپتوفان از یکدیگر و همچنین از هیستیدین ها و آرژنین اطراف خود در کمپلکس آنزیم-توپیرامات بود که این امر می تواند باعث افزایش سهم فلورسانس تریپتوفانها شود. نتایج عکس در مورد کمپ...

شبیه سازی دینامیک مولکولی روشی مناسب برای مدل سازی میکروسکوپی مواد است و در شاخه های مختلف علوم و تکنولوژی کاربرد فراوان دارد. اندازه گیری تجربی خواص ترمودینامیکی تعداد زیادی از مواد را به دلیل هزینه بالا و صرف زمان زیاد اقتصادی نیست. با استفاده از روش های محاسباتی مانند شبیه سازی دینامیک مولکولی، می توان خواص ترمودینامیکی آن ها را محاسبه و نتایج حاصل را با داده های تجربی مقایسه نمود. یکی از مب...

زمینه و هدف: دینامیک مولکولی، روشی برای شبیه سازی رفتار ترمودینامیکی مواد در سه فاز جامد، مایع و گاز با استفاده از نیرو، سرعت و مکان ذرات می باشد. دربین این عوامل، مهمترین عامل، نیرو است. در شبیه سازی دینامیک مولکولی کلاسیک، نیرو از پتانسیل کلاسیک به دست می آید. پتانسیل کلاسیکی، تابعی از مکان اتم ها یا هسته هاست و به موقعیت الکترون ها در اتم ها وابسته نیست. هدف از این کار، مطالعه و مقایسه ی انر...

در این پایان نامه، تلاش شده تا از روش های مدل سازی کامپیوتری جهت طراحی فاز ساکن، بهینه سازی پارامترهای جداسازی و بررسی مکانیسم بازداری استفاده شود. در مطالعه اول مدل سازی کامپیوتری از طریق روشهای کومفا، کومفا – تمرکز میدانی، و کومسیا بر روی یک سری از ترکیبات ضد سرطان انجام گرفت. قابلیت پیشگویی خارجی مدلهای ساخته شده، از طریق مجموعه آزمون مورد ارزیابی قرار گرفت. همچنین پارامترهای آماری م...

سولفورهگزافلورید،دارای ساختاراکتاهدرال،غیرقابل انفجار و غیرقابل اشتعال می باشد.در حالت خالص غیرسمی است.بسیار پایدارو به شدت الکترونگاتیو وجاذب الکترون است. یکی از سنگین ترین گازهای شناخته شده وگازی بی رنگ و بی بو است. ویژگی دی الکتریکی فوق-العاده آن نتیجه ی خصلت الکترونگاتیوی مولکول های آن می باشد که تمایل مشخصی به گرفتن الکترون های آزاد دارد و به تشکیل یون های سنگین با تحرک کم می انجامد. قدرت ...

در این تحقیق، نانوکامپوزیت های پلی آمید-6،6 + نانولوله ی کربنی به وسیله ی شبیه سازی دینامیک مولکولی مطالعه شده اند. جهت بررسی اثر انحنای سطح روی خواص پلیمر، سه سیستم حاوی نانولوله های (6،0)، (10،0) و (17،0) با قطر های به ترتیب 237/0، 393/0 و 666/0 نانومتر شبیه سازی شده اند. نتایج شبیه سازی تشکیل لایه های منظم پلیمر در کنار سطح نانولوله را نشان می دهند. نتایج نشان می دهد که با افزایش قطر نانولول...

هدف اصلی از این پژوهش بررسی پارامترهای موثر بر پخش نانو قطره نقره بر روی سطح مس با روش شبیه سازی دینامیک مولکولی است. ا ین شبیه سازی در هنگرد کانونیک (npt) انجام شده است. در این شبیه سازی از پتانسیل مورس و پتانسیل ساتن-چن کوانتومی استفاده شده است و برای حل معادلات دیفرانسیل جفت شده بین ذرات و محاسبه مسیرهای فاز از روش سرعت ورله استفاده کرده ایم. با تغییر تعداد اتم های نانو قطره نقره، اثر شعاع د...

این سوال مطرح است که آیا حضور پیوندهای دی سولفید، نقشی در سازش آنزیم ها برای حفظ فعالیت در دماهای مختلف دارد؟ برای این منظور مطالعات مقایسه ای خواص دینامیکی این آنزیمها انجام شد. نتایج ما در هر دو مقایسه (ahaباbaa وaha با (ppaنشان داد نوسانات ساختار، فواصل باقیمانده های عملکردی و همبستگی حرکتی بین اسیدآمینه های مهم در عملکرد، الگوی پیوند هیدروژنی و توزیع نیرو های وان دروالس و الکترواستاتیک در م...

در قسمت دوم تحقیق، شبیه سازی دینامیک مولکولی با هدف بررسی ویژگی های مولکولی کپسوله کردن داروی ضد سرطان مکلورتامین درون نانو لوله های تک جداره ی کربن و بور نیترید به کار گرفته شد. نمودارهای انرژی رسم و با استفاده از این نموارها پایداری سیستم ها تخمین زده شد. همچنین زاویه ی قرار گیری دارو درون نانو لوله ی بور نیترید محاسبه شد. علاوه بر این، بوسیله ی نمودارهای تابع توزیع شعاعی اتم- اتم حلال پوشی د...