سابقه و هدف: مطالعات انجام شده نشان می دهد که اتانول بیان پروتئین ها متعددی را در سلول های فیبروبلاست تغییر می دهد. تعدادی از این پروتئین ها  از فاکتورهای مهم در سرطان زایی هستند. بنابراین، آنالیز نقش عمل کردی و برهم کنش این دسته از پروتئین ها به منظور شناسایی مکانیسم های عمل کردی و سرطان زایی الکل دارای اهمیت است. مواد و روش ها: در این تحقیق با استفاده از نرم افزار cytoscape و الگوریتم های واب...

سابقه و هدف: بیماری دیابت نوع 1 در نتیجه تخریب خودایمنی سلول های بتا تولید کننده انسولین در پانکراس ایجاد می شود. برای گسترش درمان بیماری، شناسایی نشانگرهای درمانی کارآمد مورد نیاز است. روش های سیستم بیولوژی سبب فهم بهتری از عوامل عملکردی در بیماری می گردند. هدف این مطالعه، جستجوی نشانگرهای کاندید در این بیماری با بررسی ویژگی های توپولوژیکی زیرشبکه حاصل از تلفیق داده های بیان ژن و برهمکنش پروتئ...

سابقه و هدف: مطالعات انجام شده نشان می‌دهد که اتانول بیان پروتئین‌ها متعددی را در سلول‌های فیبروبلاست تغییر می‌دهد. تعدادی از این پروتئین‌ها  از فاکتورهای مهم در سرطان‌زایی هستند. بنابراین، آنالیز نقش عمل‌کردی و برهم‌کنش این دسته از پروتئین‌ها به منظور شناسایی مکانیسم‌های عمل‌کردی و سرطان‌زایی الکل دارای اهمیت است. مواد و روش‌ها: در این تحقیق با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape و الگوریتم‌های وا...

در این تحقیق اثر برهم کنش های چهار اسپینی بین اسپین های همسایه اول و دوم شبکه لانه زنبوری بر روی سیمای فاز مدل هایزنبرگ پادفرومغناطیس اسپین با برهم کنش های دو اسپنی بین همسایه های اول و دوم مورد مطالعه قرار گرفته است برای نزدیک کردن مدل اسپینی مؤثر برای شبکه لانه زنبوری به مدل هابارد باید علاوه بر برهم کنش های دو اسپینی برهم کنش های چند اسپنی را نیز در نظر بگیریم. در این تحقیق اثر برهم کنش های ...

مدل آیزینگ یکی از ساده ترین مدل های توصیف کننده برهم کنش ذرات است. در این تحقیق بسط دمای بالای پذیرفتاری مغناطیسی میدان صفر مدل آیزینگ فرومغناطیس و پادفرومغناطیس ومدل آیزینگ با یک برهم کنش پادفرومغناطیس بر روی شبکه دوبعدی کاگومه با برهم کنش بین نزدیک ترین همسایه ها بررسی شد. با استفاده از تقریب پد، نمای بحرانی مدل آیزینگ فرومغناطیس γ ≈ 1.75 تخمین زده شد که با فرضیه جهان شمولی درتطابق است. اما د...

شبکه های بر هم کنش پروتئینی و شاخص های مرکزیت آنها می تواند نقش پروتئین ها در یک شبکه و میزان اهمیت آنها را مشخص کند. در گراف متناظر این شبکه ها، پروتئین ها عضوهای شبکه هستند و یال بین آنها نشان دهنده برهم کنش متقابل بین آنها می باشد. در شبکه ها همواره عضوهایی که درجه و ضریب خوشه ای بالایی دارند مرکز تشکیل کلاسترهای بزرگ در شبکه هستند که قطب های گروهی شبکه می باشند. این کلاسترهای بزرگ هیچ گاه ب...

سابقه و هدف: بیماری دیابت نوع 1 در نتیجه تخریب خودایمنی سلول‌های بتا تولید‌کننده انسولین در پانکراس ایجاد می‌شود. برای گسترش درمان بیماری، شناسایی نشانگرهای درمانی کارآمد مورد نیاز است. روش‌های سیستم بیولوژی سبب فهم بهتری از عوامل عملکردی در بیماری می‌گردند. هدف این مطالعه، جستجوی نشانگرهای کاندید در این بیماری با بررسی ویژگی‌های توپولوژیکی زیرشبکه حاصل از تلفیق داده‌های بیان ژن و برهمکنش پروت...

مولکول پروتئین زنجیره خطی از اسید آمینه ها است. پیش بینی برهم کنش های پروتئین-پروتئین یک مسئله مهم در بیوانفورماتیک و سیستم های زیستی به حساب می آید. در حقیقت استخراج برهم کنش های میان پروتئین ها برای ساختن شبکه های برهم کنشی پروتئینی ضروری می باشد. این شبکه ها نقش مهمی در شناخت اکثر فرایندهای زیستی دارند. در سال های اخیر، از روش های آزمایشگاهی با توان عملیاتی بالا برای کشف برهم کنش های پروتئین...

مقدمه: بررسی‌ها نشان داده است که برهم کنش بین عوامل ژنتیک و عوامل محیطی، از جمله رژیم غذایی، بر بروز سندرم متابولیک موثر است. لذا مطالعه‌ی حاضر با هدف بررسی برهم کنش پلی‌مورفیسم‌های ژن پروتئین انتقال‌دهنده‌ی کلسترول استر (Cholesteryl Ester Transfer Protein=CETP) با مصرف درشت‌مغذی‌ها در رابطه با خطر سندرم متابولیک و اجزای آن انجام شد. مواد و روش‌ها: در این مطالعه‌ی مورد ـ شاهدی لانه گزیده جور شد...

پروتئین ها‎ مولکول های زیستی پراهمیتی هستند که فعالیت های مختلفی را در بدن موجودات زنده انجام می دهند. آن ها معمولا برای انجام فعالیت های خود به یکدیگر متصل می شوند یا به اصطلاح با یکدیگر برهمکنش‏‎ دارند. یک شبکه ی برهمکنش پروتئین‎، در یک گونه ی خاص از جانداران پروتئین های آن گونه و برهمکنش بین آن ها را نشان می دهد. یک کمپلکس پروتئینی‎، اجتماعی از پروتئین ها است که باهم برهمکنش داشته و عمل زیس...