بیماری هانتیگتون یک بیماری در ارتباط با سیستم عصبی است که بوسیله افزایش سه نوکلئوتید سیتوزین-آدنین-گوانین در ژن هانتینگتین بوجود می آید. سه نوکلئوتید سیتوزین-آدنین- گوانین اسید آمینه گلوتامین را کد می کند که افزایش این ردیف سه تایی باعث افزایش طول قطعه پلی گلوتامین در پروتئین هانتینگتین گردیده که این منجر به عدم حلالیت پروتئین فوق و به دنبال آن تجمع یافتن این پروتئین سمی در سلولهای خاصی از سیست...

ساختار، خواص و عملکرد اسیدهای نولکییک تحت تاثیر برهمکنش های آنها با یونهای فلزی می باشد. این یونها نقش بسیار مهمی در پایداری و ناپایداری ساختار دو رشته ای dna جفت بازها و بازهای منزوی آن دارند برای درک نقش مهم کاتیونها در بیوفیزیک dna .ابتدا باید جزییات برهمکنش این یونها با بازهای منزوی مورد بررسی قرار گیرد. به منظور تامین این هدف در این پژوهش به مطالعه برهمکنش بازهای اسیدهای نوکلییک (آدنینی ، ...

ملکول کافئین (caf) یک آلکالوئید از مشتقات پورین است و از آنجایی که caf آنالوگ باز آدنین (a) است، می تواند به ماکروملکول dna ملحق و با باز تیمین (t) جفت شود. گاهی اوقات به باز سیتوزین (c) متصل و جفت باز at را به جفت باز gc تبدیل می کند و منجر به جهش انتقالی می شود. به همین دلیل بعضی نویسندگان caf را به عنوان جهش زای ضعیف در نظر می گیرند. بنابراین، در این پروژه، برای مطالعه برهمکنش های ملکول caf ...

زمینه و هدف: در حال حاضر افزایش شیوع بیماری های آلرژیک در جوامع مختلف، یکی از مهم ترین مشکلات بهداشتی جهان است و تحقیقات بسیار زیادی در سراسر دنیا جهت دستیابی به روشهای مطمئن پیشگیری و درمان این بیماری ها در حال انجام می باشد. یکی از این روشها، استفاده از ردیفهای نوکلئوتیدی حاوی سیتوزین ـ گوانین( cpg-odns ) است که با مکانیسم های متعدد منجر به تعدیل پاسخ های ایمنی و تغییر الگوی سایتوکاینی در سیس...

چکیده در این پایان نامه، خواص پیوندهای هیدروژنی در جفت بازهای dna (گوانین- سیتوزین و آدنین- تیمین) در حلال های آب، متانول و کلروفرم، با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی مطالعه شدند و نتایج به دست آمده مقایسه شده و مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. شبیه سازی های دینامیک مولکولی انجام شده نشان دادند که حلال های آب و متانول بر پیوندهای هیدروژنی جفت باز گوانین- سیتوزین، نسبت به جفت باز آدنین- تی...

تأثیر متقابل برهم کنش ?-? و انرژی پیوندهای هیدروژنی مجزا در کمپلکس های سه تایی فنیل آلانین-گوانین-سیتوزین (ph:g-c) و فنیل آلانین-سیتوزین-گوانین (ph:c-g) در سطوح نظری mpwb1k/6-311++g** و m05-2x/cc-pvdz مورد مطالعه قرار گرفته است. برهم کنش بین پیوند هیدروژنی و برهم کنش استکی نشان می دهد هر دو برهم کنش اثر ضعیف کنندگی روی یکدیگر دارند. اثر برهم کنش استکی روی ساختارها و انرژی های مجزا در جفت باز گو...

اهمیت ترکیبات سیس پلاتین در درمان بیماری های مختلف از جمله سرطان, ما را بر آن داشت تا چگونگی اثر این داروها را بر نوکئوتیدهای رشته ی dna مورد بررسی قرار دهیم. بررسی ها را با استفاده از روش های مکانیک کوانتومی تئوری تابعی چگال(dft)در سطح محاسباتی b3lyp/lanl2dzانجام داده ایم تا جهت گیری دارو را نسبت به رشته و بر همکنش آن را مورد توجه قرار داده و بتوان قدرت آن را مورد محاسبه قرار داد.در این مطالعه...

    پروتئین شوک حرارتی ۷۰ یک چاپرون است که در پاسخ به استرس بیان می‌شود.  هدف از این تحقیق تعیین توالی و جهش‌های تک نوکلئوتیدی پروموتور و ژن پروتئین شوک حرارتی ۷۰ و بررسی اثر جهش‌های تک نوکلئوتیدی بر ساختار سه بعدی و عملکرد پروتئین شوک حرارتی ۷۰ مرغ بومی استان خوزستان با استفاده از روش­های بیوانفورماتیکی بود.  جهت انجام این تحقیق از ۲۰ قطعه مرغ بومی از مناطق مختلف استان خوزستان خون­گیری انجام ش...

برهم کنش رادیکال های هیدروکسیل، فنیل و فنوکسی با جفت بازهای تشکیل دهنده dnaدو رشته ای، آدنین- تیمین و گوانین-سیتوزین، با استفاده از روش dft مورد بررسی قرار گرفته است. برهم کنش رادیکال ها از هر دو طرف بالا و پایین با هریک از جفت بازها در حالت گازی و در حلال آب بررسی شده است. برای هر کمپلکس جفت باز- رادیکال ساختار هندسی با استفاده از روش b3lyp-6311g(d,p) بهینه شده و محاسبات انرژی وnbo در سطح محاس...

انرژی پیوندهای هیدروژنی مجزا (ehb) در برخی از دیمرهای دارای چند پیوند هیدروژنی با استفاده از مقادیر چگالی الکترونی در نقاط بحرانی پیوندها (bcp) به دست آمده از روش اتم ها در ملکول ها (aim) و در سطوح نظری b3lyp/6-311++g** و mp2/6-311++g** محاسبه شده است. انرژی های به دست آمده در توافق خوبی با نتایج روش قبلی و هم چنین با نتایج حاصل از آنالیز اوربیتال پیوندی طبیعی (nbo) هستند. هم چنین اثر استخلاف ر...