زمینه مطالعه: ردیابی ژن های مربوط به عوامل حدت که در یک سویه از اشریشیا کلی حضور دارند جهت تعیین پروفایل ژنوتیپی و همچنین قرارگیری سویه در پاتوتیپی خاص از اهمیت فوق العاده ای برخوردار است. هدف: هدف از انجام این مطالعه تعیین پاتوتیپ جدایه های مختلف e. coli جدا شده از گوساله ها و طیور بومی ایران با استفاده از تکنیک ریزآرایه می باشد. روش کار: در مطالعه حاضر تعداد 67 جدایه از اشریشیا کلی پـس از...

سابقه و هدف: فناوری ریزآرایه برای بررسی همزمان بیان هزاران ژن در بازه وسیعی از ژنومیک، نظیر شناسایی ژنها، اکتشاف داروها و تشخیص‌‌های کلینیکی مورد استفاده قرار گرفته است. آزمایشهایی که بر اساس فناوری ریزآرایه انجام می‌شوند حجم بسیار زیادی از داده‌ها را فراهم می‌کنند که در مطالعات بیولوژیک بی‌نظیر بوده است. نرمال سازی، خوشه‌بندی، طبقه‌بندی و ... از جمله روشهای مورد استفاده در تحلیل آماری این نوع ...

چکیده به کارگیری تجزیه ماتریس در کاهش ابعاد داده نوع گراف: مورد کاوی داده ریز آرایه به کوشش: فهیمه گودرزی یکی از شاخه های مهم بیو انفوماتیک فناوری ریز آرایه dna است که امکان بررسی عبارت هزاران ژن را به طور هم زمان و در حداقل زمان ممکن می سازد که در سال های اخیر موجب تولید حجم انبوهی از داده های عبارت ژن شده است. تحلیل آماری این داده ها شامل نرمال سازی، خوشه بندی، طبقه بندی و ... غیر...

یکی از شاخه های مهم بیوانفورماتیک فن آوری ریزآرایه dna است که امکان بیان هزاران ژن را به طور هم زمان در حداقل زمان، ممکن می سازد. داده های خام ریزآرایه، تصاویری هستند که باید به ماتریس-های بیان ژن تبدیل شوند. ماتریس هایی که ردیفشان بیانگر ژن ها و ستون هایشان بیانگر نمونه های متعدد مانند بافت ها یا آزمایش ها و اعداد سلول ها سطح بیان ژن را در یک ژن و یک نمونه ی خاص بیان می کنند. یکی از محدودیت ها...

سابقه و هدف: در سال 1999 در یک مقاله، گالوپ و همکارانش کوشیدند تا برخلاف روش های بسیار پرهزینه متداول و رایج، با ارائه روشی نوین بر مبنای داده های بیان ژنی این سرطان را تشخیص دهند. هدف مشخص بود: ارائه روشی جدید که در عین کم هزینه بودن، کاراتر نیز باشد. آن ها با مطالعه 6817 ژن مربوط به 38 فرد مبتلا به لوکمیا با بهره گیری از روش های آماری خاصی در نهایت 50 ژن را انتخاب و برای تشخیص افراد بیمار است...

Background: Microarray DNA technology has paved the way for investigators to expressed thousands of genes in a short time. Analysis of this big amount of raw data includes normalization, clustering and classification. The present study surveys the application of clustering technique in microarray DNA analysis. Materials and methods: We analyzed data of Van’t Veer et al study dealing with BRCA1...

چاره گانی  ح. 1394. کاربرد فن آوری ریزآرایه ها در نماتدشناسی گیاهی. دانش بیماری شناسی گیاهی 5(1):89-76. در طی یک واکنش سازگار، نماتدهای مولد غده ریشه (meloidogyne spp.) با تحریک تولید سلول های غول آسای چند هسته ای منجر به ایجاد تمایز در ریشه گیاه میزبان می گردند. رشد و تکثیر بیش از اندازه سلول های اطراف سلول های غول منجر به تولید غده روی ریشه گیاه میزبان می شود. مطالعات مختلف نشان داده که تغییر...

فناوری ریزآرایه ی dna دارای آثار شگرفی در تحقیقات سرطان می باشد و داده های بیان ژن ریزآرایه، برای تشخیص ویژگی های ژنتیکی سرطان کاربرد وسیعی دارد، که می تواند به منظور افزایش دقت تشخیص سرطان و پیش بینی بیماری استفاده گردد. البته در مطالعات مختلف به دلیل محدودیت اندازه ی نمونه ها، اغلب هم پوشانی محدودی بین ویژگی های ژن هایی که برای تشخیص سرطان ها بدست آمده وجود دارد. استفاده از داده ی ریزآرایه، م...

سابقه و هدف: به کارگیری فناوری ریزآرایه dna که امکان بررسی بیان هزاران ژن را به طور هم زمان در حداقل زمان ممکن می سازد، در سال های اخیر موجب تولید حجم انبوهی از داده های بیان ژنی شده است. تحلیل آماری این داده ها شامل مواردی چون نرمال سازی، خوشه بندی، طبقه بندی است. هدف این مقاله بررسی نحوه به کارگیری روش های آماری خوشه بندی در داده های ریز آرایه dna است. روش بررسی: در این تحقیق داده های سرطان پ...

سابقه و هدف: فناوری ریزآرایه برای بررسی همزمان بیان هزاران ژن در بازه وسیعی از ژنومیک، نظیر شناسایی ژنها، اکتشاف داروها و تشخیص های کلینیکی مورد استفاده قرار گرفته است. آزمایشهایی که بر اساس فناوری ریزآرایه انجام می شوند حجم بسیار زیادی از داده ها را فراهم می کنند که در مطالعات بیولوژیک بی نظیر بوده است. نرمال سازی، خوشه بندی، طبقه بندی و ... از جمله روشهای مورد استفاده در تحلیل آماری این نوع د...