مطالعه بر روی دو مجموعه اصلی شامل 75 مولکول از مشتقات تریآزول با حداقل غلظت بازدارندگی ) mic ( معین و 76 مولکول از مشتقات تترالون با 80 % غلظت بازدارندگی ( ic80 ( معین انجام شده است. ساختار اصلی کلیه مولکول های مجموعه اول تریآزول و مولکول های مجموعه دوم تترالون یکسان و تنها در برخی از استخلاف ها تفاوت داشتند. روش qsar که مبتنی بر تجزیه و تحلیل همبستگی و رگرسیون خطی چندگانه ) mlr ( می باشد، ...

در این مقاله، مطالعه ساختار- فعالیت بر روی یک مجموعه گسترده شامل 36 ترکیب از مشتقات کالکونها با فعالیت بیولوژیکی ضد سرطانی در سل های حاوی عامل سرطان پروستات (lncap)، با بکارگیری روش qsar که بر آنالیز همبستگی و رگرسیون خطی چندمتغیره دلالت دارد، صورت گرفته و از یک مجموعه معنی دار شامل شش توصیف گر مولکولی از گروه های:edge adjacency indices، atom-centered fragments، توصیف گرهای getaway و 3d-mors اس...

فعالیت برخی مشتقات دارویی تتراهیدروکربازول به عنوان مهار کننده های گیرنده 5-ht6 با استفاده از روش qsar مبتنی بر ساختار پروتئین و qsar مبتنی بر لیگاند پیش بینی شد. به این منظور ساختار سه بعدی پروتئین هدف (5-ht6) از روش مدل سازی همسانی بدست آمد. سپس از داکینگ مولکولی برای بررسی برهم-کنش های موثر بین پروتئین و مشتقات تتراهیدروکربازول استفاده شد. مطالعات داکینگ مولکولی نشان داد که برهم کنش های آب گ...

در این رساله، فعالیت داروها بر اساس ساختار پروتئین هدف و برهمکنش داروها با آن و سپس محاسبه توصیف کننده های دارو و ساخت یک مدل ریاضی بین فعالیت دارو و توصیف کننده ها (qsar) پیش بینی شد. در این رابطه ساختار سه بعدی پروتئین مورد نیاز بود. در مواردی که ساختار کریستالی پروتئین موجود نبود جهت پیش بینی ساختار سه بعدی آن از روش مدل سازی همسانی(homology modeling) استفاده شد. شبیه سازی دینامیک مولکولی سا...

در بخش اول این تحقیق، ارتباط کمی ساختار – فعالیت (qsar) 56 ترکیب بازدارنده cdk2 با استفاده از دو روش خطی (رگرسیون خطی چندگانه؛ mlr) و غیر خطی (شبکه عصبی مصنوعی؛ ann) مدل سازی شد. بازدارنده های cdk2 (کیناز وابسته به حلقه) ترکیباتی هستند که نقش اساسی در تنظیمات سلولی داشته و از تکثیر اضافی سلول ها توسط cdk2 که دچار فعالیت بیش ازحد شده و منجر به سرطان می شوند جلوگیری می کنند. توانایی پیش بینی مدل ...

در این پروژه، یک مطالعه رابطه کمّی ساختار- فعالیت به منظور ارزیابی و پیش بینی آبگریزی (c log p) و فعالیت بیولوژیکی (ic50) 19 مولکول از مشتقات 6-آمینو-4- فنیل تتراهیدروکینولین انجام گرفت. در این روش، ساختار های مولکولی به ترتیب در نرم افزار های هایپر کم و گوسین 98 ساخته و بهینه سازی شد. که در آن بر هم کنش های منزوی و فعل و انفعالات در حلال (آب و اکتانول) با استفاده از مدل میدان واکنش اونزاگر در ن...

روابط ساختار- فعالیت از جمله روش های مهم در کمومتری هستند که بررسی رابطه ی بین ساختار و فعالیت ترکیبات، پیش بینی فعالیت ترکیبات جدید را براساس اطلاعات مربوط به ساختار شیمیایی آن ها امکان پذیر می سازد. در این تحقیق متغیرهای کوانتومی در حالت خلأ، حلال آب و اکتانول مطابق با روش اونزاگر، متغیرهای پتانسیل الکترواستاتیک پولیتزر، رزونانس مغناطیس هسته برای 67 مولکول ازمشتقات فنول محاسبه شد. وابستگی فعا...

امروزه طراحی مولکول های هوشمند و پیش بینی به کمک کامپیوتر سهم بزرگی در تحقیقات فعال کننده ها یا مهارکننده های پروتئینی دارد. مدل های مولکولی به عنوان یک تکنیک کلیدی درفرایند کشف دارو استفاده می شود. مدل های مولکولی یک نقطه شروع برای شبیه سازی های مولکولی در شرایط متفاوت و برای محاسبات ویژگی های مولکولی با استفاده از مکانیک مولکولی است. هدف روش های qsar ساختن مدل های پیش بینی کننده کمی برای کشف...