در این پروژه، یک مطالعه رابطه کمّی ساختار- فعالیت به منظور ارزیابی و پیش بینی آبگریزی (c log p) و فعالیت بیولوژیکی (ic50) 19 مولکول از مشتقات 6-آمینو-4- فنیل تتراهیدروکینولین انجام گرفت. در این روش، ساختار های مولکولی به ترتیب در نرم افزار های هایپر کم و گوسین 98 ساخته و بهینه سازی شد. که در آن بر هم کنش های منزوی و فعل و انفعالات در حلال (آب و اکتانول) با استفاده از مدل میدان واکنش اونزاگر در ن...

مطالعه رابطه کمی ساختار- فعالیت (qsar) بر روی فعالیت ضد رادیکالی 96 ترکیب از آنتی اکسیدان ها به منظور پیش بینی توان آنتی اکسیدانی آن ها انجام شد. به منظور انتخاب مهم ترین توصیف کننده ها از روش رگرسیون خطی چند گانه مرحله ای استفاده شد. مهم ترین توصیف کننده های انتخاب شده 5 توصیف کننده مولکولی بودند که نشانگر ویژگی های دوبعدی و سه بعدی ساختار مولکول بوده و برای مدلسازی آن ها از رگرسیون خطی چندگان...

توسعه و ایجاد یک مدل پیشگویانه برپایه ساختار با استفاده از روش رگرسیون خطی چندگانه براساس اجماع چندین روش داکینگ متفاوت (autodock vina, gold, flexx, surflex and glide) و توصیف کننده های حاصل از نتایج آن ها مورد مطالعه قرار گرفت. رابطه کمی ساختار-فعالیت میان فعالیت بازدارندگی 26 بازدارنده tmk استافیلوکوکوس اورئوس با توصیف کننده های داکینگ ایجاد گشت. برای اطمینان از توانایی پیشگویی مدل، مدل qsar ...

بخش اول این بخش شامل اجرای یک روش انتخاب متغیر با استفاده از روش جک نایف بر روی توصیفگرهای متعامد شده با استفاده از روش gram-schmidtاست. در این مطالعه از دادهی سلوود که دارای 31 مولکول و 53 توصیفگر است استفاده شده است. از دو روش رگرسیون: رگرسیون چند متغیره و همچنین pls در ساختن مدل و انتخاب متغیر در داخل جک نایف استفاده شده است. و نتایج نشان از عملکرد بهتر pls چه با داده ی هم مقیاس و چه با داد...

در این پژوهش، روش رابطه کمی ساختار- فعالیت (qsar) برای مدل سازی و پیش‏بینی فعالیت ضد فشار خون مشتقات پیریدازینون با استفاده از روش‏های مختلف کمومتریکس به کار رفته است. ابتدا با استفاده از نرم افزار‏های هایپرکم، موپک و دراگون تعدادی توصیف‏ کننده بدست آمد. در مرحله بعد با استفاده از روش رگرسیون خطی چند متغیره (mlr) تعداد مناسبی از توصیف ‏کننده‏ ها انتخاب شدند. در این قسمت از نرم افزار spss استف...

چکیده در بخش اول این پژوهش مدلهای qsrr برای پیش بینی فاکتور بازداری نمونه در کروماتوگرافی سیال فوق بحرانی(sfc) در درصد های مختلف اصلاحگر در فاز متحرک ایجاد شد. سری داده ها شامل بازداری 35 ترکیب آلی مختلف در 0 ،2 ،4 و6 درصد متانول در فاز متحرک است. مدل سازی فاکتور ظرفیت یک بار برای درصدهای مختلف اصلاحگر به طور جداگانه و یک بار به طور همزمان برای تمام شرایط صورت گرفته است. در مدلسازی همزمان، 140...

در بخش اول این تحقیق، ارتباط کمی ساختار – فعالیت (qsar) 56 ترکیب بازدارنده cdk2 با استفاده از دو روش خطی (رگرسیون خطی چندگانه؛ mlr) و غیر خطی (شبکه عصبی مصنوعی؛ ann) مدل سازی شد. بازدارنده های cdk2 (کیناز وابسته به حلقه) ترکیباتی هستند که نقش اساسی در تنظیمات سلولی داشته و از تکثیر اضافی سلول ها توسط cdk2 که دچار فعالیت بیش ازحد شده و منجر به سرطان می شوند جلوگیری می کنند. توانایی پیش بینی مدل ...

روابط ساختار- فعالیت از جمله روش های مهم در کمومتری هستند که بررسی رابطه ی بین ساختار و فعالیت ترکیبات، پیش بینی فعالیت ترکیبات جدید را براساس اطلاعات مربوط به ساختار شیمیایی آن ها امکان پذیر می سازد. در این تحقیق متغیرهای کوانتومی در حالت خلأ، حلال آب و اکتانول مطابق با روش اونزاگر، متغیرهای پتانسیل الکترواستاتیک پولیتزر، رزونانس مغناطیس هسته برای 67 مولکول ازمشتقات فنول محاسبه شد. وابستگی فعا...

امروزه طراحی مولکول های هوشمند و پیش بینی به کمک کامپیوتر سهم بزرگی در تحقیقات فعال کننده ها یا مهارکننده های پروتئینی دارد. مدل های مولکولی به عنوان یک تکنیک کلیدی درفرایند کشف دارو استفاده می شود. مدل های مولکولی یک نقطه شروع برای شبیه سازی های مولکولی در شرایط متفاوت و برای محاسبات ویژگی های مولکولی با استفاده از مکانیک مولکولی است. هدف روش های qsar ساختن مدل های پیش بینی کننده کمی برای کشف...