در این تحقیق، انرژی انواع دی پپتیدها با استفاده از محاسبات کوانتومی در سطح تئوری dft با سری پایه 6-311g** محاسبه شده است . دی پپتیدهای مورد مطالعه از اتصال آمینو اسید سرین به آمینو اسیدهای دیگر ایجاد شده اند. برای انواع دی پپتیدها و ایزومرهای ساختاری آنها انرژی، ساختار بهینه طول پیوندها، زوایای پیوندها، زوایای دای هدرال، کربن های آلفا ,و سد چرخش سرین مورد بررسی قرار گرفته شده وپایدارترین ساختار...

پپتید brevinin-18 یک نوع ناقص "truncated " از brevinin-1e می¬باشد که خاصیت ضدباکتریایی فرم آمیدی آن به اثبات رسیده است. در این پژوهش بر اساس اصول پپتید تقلیدی آنالوگی برای brevinin-18 طراحی شد سپس با روش فاز جامد spps به صورت شیمیایی سنتز شد.خالص سازی با دستگاه hplc وبا ستون¬های فاز معکوس vydac انجام شد. اثرات ضدمیکروبی آن بر روی چند گونه باکتری مورد بررسی قرار گرفت وبا پپتید brevinin-18 مقایسه...

پپتیدها زنجیر های مولکولی بلندی هستند که ساختار پروتئین ها را تشکیل می دهند. پپتیدهای سنتزی به عنوان دارو(پپتید هایی که فعالیت بیولوژیکی دارند) استفاده می شوند یادر تشخیص بیماری ها مورد استفاده قرار می گیرند. سنتز پپتیدها توسط شیمیدانان سنتز کار، مشکل است چرا که آمینو اسیدهای اضافه شده به زنجیر پپتیدی باید در جایگاه صحیح خود در زنجیر قرار بگیرند.این آمینو اسیدها متحمل دیگر واکنش ها نمی شوند.در ...

رگزایی، یک فرایند پیچیده چند مرحله ای شامل تکثیر، مهاجرت و تمایز سلول های اندوتلیال، تشکیل میکروتوبول و جوانه-زنی انشعاب های مویرگی جدید، یک رویداد ضروری در رشد و متاستاز تومورها بوده و بنابراین جلوگیری از آن به عنوان یکی از مهمترین راهکارهای درمان سرطان مطرح است. اندواستاتین، قطعه انتهای کربوکسیل کلاژن xviii، یک مهارکننده درون زاد رگزایی است که رشد طیف وسیعی از تومورها را بدون سمیت و مقاومت دا...

دیفنسین‎ها یکی از بزرگترین خانواده ‏های پپتیدهای ضد میکروبی می‎باشند. دیفنسین‎ها خانواده‎ای از پروتئین‎های کاتیونیک با 34-29 آمینو اسید هستند که در گرانول‎های فاگوسیت‎های پستانداران بسیار فراوان می‎باشند. اعضای این خانواده غنی از ریشه‎ی اسید آمینه‏ی آرژنین و حاوی 6 ریشه‎ی سیستئین حفاظت شده با سه باند دی سولفید درون مولکولی می‎باشند. این پپتیدها اولین بار در نوتروفیل‏های خرگوش و خوکچه هندی شناسا...

به رغم پیشرفت‌های چشمگیر در زمینه درمان سرطان، علاقه به طراحی داروهای جدید افزایش یافته‌است. برخی از پپتیدهای گیاهی طیف گسترده‌ای از فعالیت‌های سیتوتوکسیک را در برابر سلول‌های سرطانی نشان می‌دهند. هدف این مطالعه تجزیه و تحلیل آماری پپتیدهای ضد‌سرطان گیاهی شناخته شده و همچنین یافتن مهمترین ویژگی‌های مشترک بین آنها بود. در این راستا لیستی از پپتیدهای ضدسرطان گیاهی موجود در پایگاه داده (The Antimi...

پیوند هیدروژنی به عنوان عامل کنترل کننده بسیاری از فرایند های شیمیایی و بیو شیمیایی پدیده شناخته شده ای محسوب می شود. با این حال، به علت گسترده بودن برهمکنش هایی که جزو پیوند های هیدروژنی طبقه بندی می شوند، تعیین خواص دقیق آنها بسیار مشکل است. ویژگی های مختلف بر هم کنش های n-h•••o=cnh ، n-h•••o=co و c-h•••o=cnh با به کار بردن روش های از اساس (ab initio) ، dft و هم چنین تئوری aim مورد بررسی قرار...

  زمینه: گیرنده تروپومایوزین کیناز (Tropomyosin Receptor Kinas B, TRK B ) یکی از پروتئین ­ های سرطان­زاست .   هدف: مطالعه به منظور طراحی و بهینه­سازی پپتیدهای مناسب جهت مهار TRK B انجام شد.   مواد و روش­ها: این مطالعه پایه در سال 1391 در دانشگاه علوم پزشکی قزوین انجام شد، پس از طراحی کتابخانه پپتیدی با روش sequence tolerance و بهینه­سازی انرژی پپتیدهای طراحی شده با روش backrub در بسته نرم­افزار...