مولکول dna نه تنها از دیدگاه زیست شناسان دارای اهمیت فراوان زیستی است بلکه مورد جالبی برای مطالعه فیزیکدان ها نیز می باشد. حالت های باز ( open state: حالتی که در آن پایه های دو رشته از یکدیگر جدا شده و باعث باز شدن بخشی از دو رشته از هم می شوند.) در مارپیچ دوتایی مولکول dnaقابل مدلسازی با سالیتون های توپولوژیک هستند. از آنجایی که این مولکول دارای طول بسیار بلند (در حدود متر) و عرض بسیار کوچک (د...

عملکردهای مهم زیستی مولکول dna، همچون فشرده سازی، نسخه برداری و تکثیر، تحت تأثیر خواص مکانیکی آن است. خواص مکانیکی dna همچنین در طراحی نانو بلوک های ساختمانی سازه های مولکولی، آزمایش های دست کاری تک مولکول ها و حسگرها و عملگرهای قابل-برنامه ریزی نقش مهمی دارد. یک راه ساده برای بدست آوردن پارامترهای تعیین کننده رفتار مکانیکی dna کشش مولکول های منفرد dna و اندازه گیری تغییرات نیرو برحسب طول موثر ...

مولکول dna نوعی اسید نوکلئیک می باشد که دارای دستورالعمل های ژنتیکی است و از این دستور العمل ها برای کار کرد و توسعه بیولوژیکی موجودات زنده استفاده می کند. نقش اصلی مولکول dna ذخیره سازی طولانی مدت اطلاعات ژنتیکی می باشد. خواص مکانیکی dna نقش به سزایی در کیفیت فرایند های بیولوژیکی مربوط به این مولکول ایفا می کند. امروزه دامنه کاربرد dna منحصر به سلول های زنده نمی شود بلکه در نانوبیوروبوتیک و نا...

توالی های تک رشته DNA یا RNA که تحت عنوان آپتامر شناخته می شوند قادرند مولکول هدف را با اختصاصیتی در حد آنتی بادی های مونوکلونال ردیابی نمایند. با این وجود قرار گیری مایکوتوکسین ها در گروه مولکول های کوچک و تفاوت بالای وزن مولکولی آنها با توالی های آپتامری تبدیل به چالشی جدی در معرفی پروب های آپتامری برای آنها شده است. در بررسی حاضر با هدف دستیابی به توالی آپتامری جدید و کوتاه تر برای آفلاتوکسی...

dna مولکولی است که از نظر زیستی – به دلیل قابلیت نگهداری و انتقال اطلاعات- دارای اهمیت فراوان می باشد. لذا تحقیق چگونگی کارکرد آن از دیدگاه دانشمندان علوم مختلف امری واجب به نظر می رسد. از جمله این کارکردها، اثرات بلند برد این مولکول است که با کمک فیزیک غیرخطی توجیه می شود. با در نظر گرفتن معادلات حرکت غیرخطی برای مولکول dna و جستجوی جواب برای آن معادلات آثار وجود سالیتون های توپولوژیک در این م...

شبیه سازی دینامیک مولکولی روی ساختار B-DNA با توالی d(CGCGAATTCGCG) و در محیطی با غلظت یک مولار از نمک سدیم کلرید انجام شد. مطالعه در هفت دمای مختلف از 280 تا 400 کلوین با فاصله دمایی 20 کلوین با زمان شبیه سازی 50 نانو ثانیه برای هر دما انجام گرفت. در هر دما تابع توزیع شعاعی برای مولکول‌های آب و کاتیون‌های سدیم در اطراف اتم‌های مختلفی از مولکول دی ان ای محاسبه شد. محاسبات نشان داد در طی فرآیند ...

در این مقاله خواص ترابرد الکترونی از طریق مولکول dna بر پایه یک رشته شبه تناوبی از نئوکلوتیدهای آن به صورت عددی بررسی می-شود. با استفاده از یک روش تابع گرین تعمیم یافته، رسانش الکترونی مولکول dna به صورت رشته poly(gact)-poly(ctga) در ساختاری به صورت مدل فلز / dna / فلز مطالعه می شود. با استفاده از یک طرح بازبهنجارش، هامیلتونی دو رشته مولکول dna ( dsdna ) را به یک هامیلتونی مؤثر متناظر با یک زنج...

دراین پایان نامه با استفاده از تکنیک شبیه سازی دینامیک مولکولی تعادلی خواص گرمایی و مکانیکی نانوسیم روی مطالعه شده است، این شبیه سازی در هنگرد npt انجام شده و از پتانسیل کلری-روزاتو برای انجام شبیه سازی استفاده شده است. با به دست آوردن نتایج حاصل از شبیه سازی دینامیک مولکولی بر روی عنصر zn متوجه این نکته شدیم که عنصر zn به علت ویژگی ساختاری اندکی متفاوت با ساختار hcp توسط پتانسیل های موجود قابل...

در این مقاله, با استفاده از مدل هامیلتونی بستگی قوی, یک روش تابع گرین تعمیم یافته و تکنیکهای تقسیم­بندی لودین, بعضی از خواص اساسی رشته poly(dg)-poly(dc) مولکول dna در ساختار swnt/dna/swnt به صورت عددی بررسی می­شود. مولکول dna در مدل استخوان ماهی ب ه صورت یک مولکول تخت با m سلول و 3 جایگاه ( یک جایگاه برای هر زوج پایه و دو جایگاه برای اسکلت ) در نظر گرفته می­شود. مولکول dna در این مدل بین دو نان...

مقدمه: بسیاری از ترکیبات مشتق شده از گیاهان دارویی مانند آنتی‌اکسیدان‌ها و پلی فنل ها نقش بسزایی در پیشگیری و درمان انواع سرطان ها دارند. یکی از فرایندهای مهار سرطان، فعال کردن مسیر آپوپتوز است و ما قصد داریم در این مطالعه، تأثیر دینامیک مولکولی هسپرتین (Hesperetin) را بر روی فاکتورهای پیش آپوپتوزی Bad، Bak و Bim در محیط شبیه‌سازی‌شده بررسی نماییم. روش کار: اطلاعات مربوط به ساختار سه بعدی و فای...