هدف از ساخت یک درخت تکامل¬نژادی، کنار هم قرار دادن مجموعه¬ای از گونه¬های مختلف زیستی است به¬صورتی که این درخت، روابط تکاملی بین گونه¬های مورد نظر را نشان دهد. برای ساخت این درختان روش¬های متعددی وجود دارد که استفاده از هر روش ممکن است تعدادی درخت متفاوت برای مجموعه¬ی گونه¬های موجود تولید کند. با انتخاب هر پروتئین از یک موجود و بدست¬آوردن پروتئین¬های یکسان یا مشابه در دیگر موجودات، این امکان وجو...

فیلوژنتیک شاخه ای از علم زیست شناسی است که با استفاده از داده های موجود ، تحول مولکولی را استنباط می کند. از میان مدلهای ریاضیاتی که برای تسهیل این استنباط مورد استفاده قرار می گیرد ، مدلهای آماری کاربرد وسیع تری دارند. در این گونه از مدلها می توان فرض کرد که تحول مولکولی به عنوان یک فرایند احتمالاتی در امتداد یک درخت ریشه دار که تنها برگهای آن قابل مشاهده است، اتفاق می افتد. برای پارامتری سا...

‏ بر اساس نظریه ی تکامل، همه ی موجودات زنده روی کره ی زمین با یکدیگر مرتبط بوده و از نیای مشترکی به وجود آمده ‏ند. یکی از پیشرفت های مهم در زیست شناسی تکاملی، طی چند دهه ی اخیر، یافتن روشی برای تعیین الگوی نیاکانی میان ‏جانداران است. این روش که فیلوژنتیک نام گرفته، امکان رد یابی تاریخ موجودات زنده را با دقت بیشتری فراهم نموده است. ‏مدل های مختلف درخت فیلوژنتیک معمولا تکامل تنها یک ژن برای موجود...

سابقه و هدف: عفونت های میکروسپوریدیایی در تمام میزبانان مهره دار و بی مهره رخ می دهد. شایع ترین میکروسپوریدیای آلوده کننده انسان و حیوانات انتروسایتوزون بینئوسی است. هدف از این مطالعه شناسایی ایزوله های زئونوز انتروسایتوزون بینئوسی در گاوهای کشتار شده تهران به روش مولکولی می باشد.مواد و روش ها: در این مطالعه توصیفی 126 نمونه مدفوع از گاوهای کشتار شده تهران جهت وجود انتروسایتوزون بینئوسی بررسی ش...

مقدمه: نوکاردیا یکی از مهم‌ترین گروه از اکتینومایست‌های هوازی است که در خاک زندگی می‌کند و قادر است به وسیله تنفس و تلقیح تروماتیک به بدن انسان وارد شود و عفونت نوکاردیوزیس را به وجود آورد. روش‌های مولکولی یکی از بهترین روش‌های سریع و دقیق برای شناسایی و افتراق این گروه از باکتری‌ها می‌باشد. هدف از این مطالعه ارزیابی سه ژن خانه‌دار در تشخیص و تفریق مهم‌ترین گونه‌های نوکاردیا بود. روش: در این مط...

استرس گرمایی یکی از مهمترین عوامل استرس­زای محیطی است که تولید طیور در دنیا به‌خصوص در مناطق گرم همانند استان سیستان و بلوچستان در ایران را با چالش همراه کرده است. استرس گرمایی موجب افزایش تولید رادیکال­های آزاد در بدن پرندگان می­شود. گلوتاتیون پراکسیداز نقش مهمی به‌عنوان آنتی­اکسیدان سلولی در استرس گرمایی ایفا می­کند. هدف از انجام این پژوهش، تجزیه تکاملی و فیلوژنتیک توالی نوکلئوتیدی GPX-1 در د...

مقدمه: نوکاردیا یکی از مهم‌ترین گروه از اکتینومایست‌های هوازی است که در خاک زندگی می‌کند و قادر است به وسیله تنفس و تلقیح تروماتیک به بدن انسان وارد شود و عفونت نوکاردیوزیس را به وجود آورد. روش‌های مولکولی یکی از بهترین روش‌های سریع و دقیق برای شناسایی و افتراق این گروه از باکتری‌ها می‌باشد. هدف از این مطالعه ارزیابی سه ژن خانه‌دار در تشخیص و تفریق مهم‌ترین گونه‌های نوکاردیا بود. روش: در این مط...

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های ایرانی قارچ puccinia triticina، یازده جدایه متعلق به مناطق جغرافیایی مختلف تعیین فنوتیپی و پاتوتیپی گردیدند و ناحیه igs1rdna توالی یابی شد. در رابطه با کلیه جدایه ها یک محصول pcr با اندازه 870 جفت بازی به دست آمد. هم ردیف­سازیتوالی های igs1 مربوط به جدایه های مورد بررسی نمایانگر 2/1-0 درصد تفاوت بین آنها بود که بیانگر توالی های بسیار مشابه در این ناحیه است. ...

مقدمه: تلاش جهت ایجاد ارزش های فیلوژنتیک mrna زیرواحدهای اصلی گیرندۀ gabaa شامل a ، b g، d، e، q، p،   می تواند دانش ما را در طبقه بندی و عملکرد آن ها بهبود بخشد. علاوه بر این، تشابهات و واگرایی بین گونه های مختلف می تواند برای مشخص کردن عملکرد این گیرنده ها مهم باشد. مواد و روش ها: پس از هم ردیفی توالی های کامل mrna زیرواحدهای gabaa در گونه های انسان و موش صحرایی، درخت فیلوژنتیک با نرم افزار c...

مقدمه: نورون‏‌های ترشح کنندۀ گاما آمینو بوتریک اسید که یک ناقل عصبی مهاری است و به‏ عنوان ناقل عصبی اصلی شناخته می‏‌شود، نورون‏‌های گابائرژیک نامیده می‏‌شوند. فیلوژنتیک بر اساس اطلاعات ترتیبی، توصیف دقیق‏‌تری از الگوهای وابستگی را فراهم می‏‌نماید. مواد و روش‌ها: پس از هم‌ردیفی توالی‌های کامل ژن mRNA زیرواحدهای آلفای GABAA در گونه‌های انسان و موش صحرایی، درخت فیلوژنتیک با نرم‌افزار CLC Main Work...