به دلیل سرعت بالای تکامل ژنوم هسته ای، مطالعات تکاملی بر روی ژنوم میتوکندریایی صورت می گیرد. از سوی دیگر تغییرات نوکلئوتیدی (جهش) در ژنوم میتوکندریایی یکی از مهمترین دلایل در ایجاد بیماری در مهره داران است. هدف از این پژوهش شناسایی، جداسازی و همسانه سازی ژن nd1 از ژنوم مرغ بومی خراسان و مقایسه آن با سایر توالی های ژنومی و پروتئینی این ژن به منظور بررسی جهش های احتمالی است. بدین منظور، از نمونه ...

در این پایان نامه‏، مسأله ی جستجوی گرافی مخفی از یک خانواده از گراف ها روی ‎‎n‎‏ رأس‏‏، بررسی می شود. در مدلی که از آن استفاده می کنیم‏، تنها عمل مجاز عبارت است از این پرسش که: ”آیا یک زیرمجموعه از رئوس‏، دارای یالی از این گراف مخفی است؟“. هدفی که در این راستا مطرح می شود‏، تخمین کم ترین تعداد پرسشی است که ‎‏برای شناسایی گراف مخفی مورد نیاز است‎. برای رسیدن به این هدف عموماً از الگوریتم های غیرا...

در این پژوهش قصد داریم شیوه های مختلف و راهکارهای گوناگون ساخت گراف های رشته را مورد مطالعه و بررسی قرار دهیم. گراف های رشته در حقیقت خود یک شکل بهینه شده از گراف های همپوشان هستند. گراف های رشته و همپوشان توسط رشته هایی موسوم به خوانش موجود در ژنوم موجود زنده، توالی ژنوم را تعیین می کنند. در این زمینه به دلیل حجم داده ای بالا و لزوم ذخیره سازی سریع آنها، روش های متفاوتی با زمان های اجرای مختلف...

در دهه اخیر با ظهور تکنولوژی توالی یابی نسل جدید (Next generation sequencing, NGS)، توالی یابی ژن ها و تشخیص بیماری های ژنتیکی وارد عرصه جدیدی شده است. با استفاده از این تکنیک این امکان فراهم گردیده تا در خصوص تشخیص علت ژنتیکی بسیاری از بیماری ها و سندروم ها از جمله اختلالات و ناهنجاری های مادرزادی که قبلا بواسطه محدودیت های تکنیک های مورد استفاده تحت عنوان "با علل نامعلوم "بیان می گردید، مشخص ...

هدف از انجام این پژوهش بررسی توالی نوکلئوتیدی ژن سیتوکروم اکسیداز 1 در ژنوم میتوکندری مرغ بومی خراسان و شناسایی جهش های احتمالی در آن بود. بدین منظور پس از نمونه گیری و استخراج dna از خون کامل، ژن cox1 با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر و در پلاسمید ptz57r/tدر سویه dh5α باکتری اشیریشیاکولای همسانه‎سازی گردید. در نهایت پلاسمید نوترکیب از یک کلونی نوترکیب استخراج و پس از خالص سازی توالی یابی ش...

بر خلاف مرغ که اطلاعات ژنومی آن کامل است، اطلاعات ژنتیکی زیادی در رابطه با بلدرچین در دسترس نیست. با توجه به شباهت¬های ژنتیکی بلدرچین ژاپنی با مرغ و تکمیل نقشه ژنومی مرغ، توالی ژنومی تطبیقی آن و همولوژی مرغ با از جمله بلدرچین می تواند مورد مطالعه قرار بگیرند و نقشه ژنومی آن تهیه شود. هدف از این تحقیق بررسی همسانی ژنوم بلدرچین ژاپنی و مرغ بر اساس توالی dna بود. برای این منظور بخشی از توالی dna ژ...

کلیه خصوصیات و صفات موجودات زنده، از ماده ژنتیکی آن ها نشات می گیرد. لذا شناسایی و کشف ترتیب و نوع عناصر سازنده این ماده، اساس بسیاری از علوم را تشکیل می دهد. توالی دی ان ای موجودات با استفاده از چهار عنصر تعیین می شود. تفاوت در ترتیب قرارگیری این عناصر نسبت به هم، عامل بروز ویژگی های متفاوت در موجودات است. تکنولوژی هایی که به بررسی ژنوم موجودات پرداخته و سعی در شناسایی عناصر و ترتیب آن ها نس...

16S rRNA یکی از اجزای بخش بزرگ ریبوزومی می باشد که بوسیله‌ی ژنوم میتوکندریایی کد می‌شود و به طور گسترده‌ای در مطالعات فیلوژنتیکی مربوط به گونه‌های نزدیک و به خصوص گونه های مربوط به Crassostrea مورد استفاده قرار می‌گیرد. پلی مورفیسم توالی نوکلئوتیدی مربوط به ژن 16S rRNA ژنوم میتوکندریایی اویستر خلیج فارس (Crassostrea sp.)، در 30 نمونه اویستر جمع آوری شده از بندر امام خمینی مورد بررسی قرار گرفت. ...

چندشکلی‌های تک نوکلئوتیدی ( SNP) امروزه به مهم‌ترین و کارآمدترین ابزار به نژادی تبدیل شده‌اند. مطالعات پویش کل ژنوم و انتخاب ژنومی دو کاربرد مهم در اصلاح نژاد دام هستند که هر دو مبتنی بر تعیین ژنوتیپ تعداد بسیار زیادی از این جایگاهها هستند. بدین منظور آرایه های با تراکم بالا از این نشانگرها در صنعت گاو شیری ارایه شده اند. از آنجاییکه ترانسکریپتوم تنها حاصل رونویسی بخشهایی از ژنوم است که رمزگر ب...

ویروس نفریت عفونی سبب ایجاد بیماری تحت بالینی با واگیری بالا در جوجه های جوان می شود که به کلیه ها آسیب می رساند. مطالعه حاضر، در جهت تعیین توالی و آنالیز فیلوژنتیکی ژنوم کپسید سروتیپ یک ویروس نفریت عفونی می باشد. نمونه گیری مربوط به دو گله جوجه گوشتی بود. جوجه های مورد مطالعه دارای علائم اسهال، کاهش رشد، عدم یکنواختی در سطح گله، بی حالی و افسردگی بودند. برخی از نمونه ها از جوجه هایی اخذ گردید ...