استخراج dna به­صورت خالص، پایدار و با کمیت و کیفیت مناسب، گام مهمی در اجرای پژوهش­های بیولوژیکی می­باشد. در این پژوهش، dna مربوط به نمونه خون 600 بلدرچین ژاپنی با روش نمکی تغییر یافته با پودر رختشویی و بدون استفاده از آنزیم پروتئیناز k استخراج شد. نمونه­های dna به­دست آمده در مراحل آماده­سازی کتابخانه ژنومی، با نانودراپ، فلئورومتر، بیوآنالیزر، الکتروفورز، pcr، هضم با آنزیم­های آندونوکلئاز، اتصا...

استخراج dna به­صورت خالص، پایدار و با کمیت و کیفیت مناسب، گام مهمی در اجرای پژوهش­های بیولوژیکی می­باشد. در این پژوهش، dna مربوط به نمونه خون 600 بلدرچین ژاپنی با روش نمکی تغییر یافته با پودر رختشویی و بدون استفاده از آنزیم پروتئیناز k استخراج شد. نمونه­های dna به­دست آمده در مراحل آماده­سازی کتابخانه ژنومی، با نانودراپ، فلئورومتر، بیوآنالیزر، الکتروفورز، pcr، هضم با آنزیم­های آندونوکلئاز، اتصا...

هم ترازی چندگانه توالی های پروتئینی تکنیکی جهت نمایش رابطه میان اسیدهای آمینه چندین توالی پروتئینی می باشد. بدین معنا که چندین توالی پروتئینی با یکدیگر به گونه ای هم تراز شوند که بیش ترین مشابهت را با هم پیدا کنند. این مسئله یکی از اساسی ترین مسائل در حوزه بیوانفورماتیک می باشد. اهمیت آن به دلیل کاربردش در تخمین درخت تکاملی، پیش بینی عملکرد و ساختار دوم و سوم پروتئین ها و نیز یافتن موتیف میان ت...

بر خلاف مرغ که اطلاعات ژنومی آن کامل است، اطلاعات ژنتیکی زیادی در رابطه با بلدرچین در دسترس نیست. با توجه به شباهت¬های ژنتیکی بلدرچین ژاپنی با مرغ و تکمیل نقشه ژنومی مرغ، توالی ژنومی تطبیقی آن و همولوژی مرغ با از جمله بلدرچین می تواند مورد مطالعه قرار بگیرند و نقشه ژنومی آن تهیه شود. هدف از این تحقیق بررسی همسانی ژنوم بلدرچین ژاپنی و مرغ بر اساس توالی dna بود. برای این منظور بخشی از توالی dna ژ...

هدف: lipoid proteinosis یک بیماری نادر اتوزومی مغلوب است که از جهش در پروتئین ماتریکس خارج سلولی1 (ecm1) بوجود می آید. ژن ecm1 ، 10 اگزون دارد و در مطالعاتی که تا به امروز صورت گرفته، ثابت شده میزان جهش در 3 اگزون این ژن (6، 7 و8) از سایر اگزون های آن بیشتر بوده است. مطالعات قبلی در مورد این بیماری، بررسی جهش های 3 اگزون 6، 7 و 8 بوده است. مطالعه فعلی ما در مورد 7 اگزون (1، 2، 3، 4، 5، 9 و 10...

همردیفی توالی ها روشی برای در اختیار گرفتن اطلاعات اساسی در بیوانفورماتیک است. با این حال، حل مساله ی همردیفی توالی های چندگانه دشوار است. در این پایان نامه ، بهینه سازی تجمع ذرات و الگوریتم ژنتیک برای حل این مساله استفاده شده است. درالگوریتم تجمع ذرات، هر ذره نشان دهنده ی یک همردیفی است و ذرات برای رسیدن به جواب با استفاده از برخی قوانین حرکت می کنند. همچنین در الگوریتم ژنتیک هر کروموزوم به عن...

سابقه و هدف: بیماری زنگ قهوه ای (زنگ برگی) گندم یکی از بیماری های مهم گندم است که توسط قارچ puccinia triticina erikson ایجاد می شود. در سال های اخیر توالی یابی نواحی مختلف dna ریبوزومی به ویژه ناحیه its1 به منظور بررسی تفاوت های ژنتیکی پاتوتایپ های عوامل بیماریزای زنگ های مختلف گندم مورد استفاده قرار گرفته است. هدف از انجام این پژوهش، بررسی تشابهات و تفاوت های موجود بین پاتوتایپ های عوامل بیمار...

هدف: لیشمانیوزیس جزء بیماری های عفونی– انگلی مهم دنیاست که توسط تک یاخته های نسجی خونی داخل سلولی اجباری از جنس لیشمانیا ایجاد می شود. ژن lack یک پروتئین 36 کیلودالتونی است که در فرم های پروماستیگوت و آماستیگوت انگل، در گونه های مختلف لیشمانیا به مقدار بالایی وجود دارد. lack پاسخ ایمنی سریعی علیه انگل ایجاد می کند؛ بنابراین این ژن برای تهیه آنتی ژن نوترکیب مناسب بوده و انتخاب خوبی به عنوان واکس...

سابقه و هدف: بیماری زنگ قهوه ای (زنگ برگی) گندم یکی از بیماری های مهم گندم است که توسط قارچ puccinia triticina erikson ایجاد می شود. در سال های اخیر توالی یابی نواحی مختلف dna ریبوزومی به ویژه ناحیه its1 به منظور بررسی تفاوت های ژنتیکی پاتوتایپ های عوامل بیماریزای زنگ های مختلف گندم مورد استفاده قرار گرفته است. هدف از انجام این پژوهش، بررسی تشابهات و تفاوت های موجود بین پاتوتایپ های عوامل بیمار...

زیتون (olea europaea l.) یک محصول روغنی مهم است، اما اطلاعات ژنومی و ترانس کریپتومی موجود برای این گیاه محدود است. این اطلاعات جهت آشکار ساختن مکانیزم های مولکولی بیوسنتز اسید های چرب و توسعه نشانگرهای مولکولی ضروری می باشد. در مجموع مقادیر کمی از نشانگرهای مولکولی بر پایه ی توالی-های بیانی در زیتون، کارآمدی و صحت اصلاح ژنتیکی را محدود ساخته است. توالی یابی ترانس کریپتومی با کارآمدی بالا برای ت...