در این مقاله پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی بر پایه توالی اسید های آمینه آن ارائه خواهد شد. برای تعریف فاکتوری به منظور تشخیص میزان انعطاف پذیری از انرژی دو اسید آمینه متوالی استفاده شد. با استفاده از تحلیل های آماری برروی این انرژی، عددی بین صفر و صد به هر جفت اسید آمینه تعلق می گیرد که آنرا عدد انعطاف پذیری می نامیم. در نظر گرفتن اثرات همسایه ها تا چهار همسایه اسید آمینه باعث بهبود پیشگو...

ژن aroa یکی از ژن های مهم برای تولید اسید آمینه های آروماتیک می باشد و برای حیات باکتری بسیار ضروری است. نشان داده شده است، که توالی ژنی aroa در باکتری ها متفاوت است، بنابر این هدف این مطالعه تعیین توالی نوکلئوتیدی ژن aroa در سویه اشریشیا کلی بومی 80: k78o برای مشخص کردن تفاوت ها بین این سویه و سویه های موجود در بانک ژنی اشریشیا کلی 80: k78o بود. برای ازدیاد ژن aroa در سویه بومی از واکنش زنجیره...

  مقدمه‎:‎‏ سیانوباکتری ها، کاندیدای خوبی برای کشف محصولات طبیعی با کاربرد در صنایع داروسازی هستند. امروزه، عمده ‏متابولیتهای بیواکتیو جدا شده از سیانوباکتری ها به صورت پلی کتیدی ، پپتیدهای غیر ریبوزومی و یا هیبریدی از این دو ‏هستند. به رغم مطالعات بسیار در زمینه پراکنش ژنهای ‏NRPS، هیچکدام از آنها در زمینه سویه های سیانوباکتریایی دریاچه ‏لواسان نبوده است. بنابراین، ه...

بادنا ویروس یک انجیر (Fig badnavirus -1) متعلق به خانواده Caulimoviridae و جنس Badnavirus و یکی از شایع ترین عوامل ویروسی همراه با بیماری موزائیک انجیر در انجیرکاری های جهان می باشد. طی فصول زراعی سال های 1391 تا 1393، در مجموع تعداد 392 نمونه برگی علائم دار و بدون علائم ویروسی از انجیر کار های مختلف موجود در 9 استان کشور جمع آوری شد. نمونه ها توسط آزمون سرولوژیکی Dot Immunobinding Assay (DIBA)...

ژن مجتمع اصلی سازگاری نسجی (mhc) ملکول های mhc کلاس i و ii را کد می کند که در عرضه پپتید های آنتی ژنی به یاخته های t نقش دارند. این ملکول های پلی مرف نقش مهمی در بروز حساسیت و یا مقاومت به بیماری های عفونی دارند. در تحقیق حاضر ارتباط توالی اسید آمینه های جایگاه اتصال پپتید آنتی ژنی در آلل های مختلف 3bola-drb با بروز حساسیت یا مقاومت به اسهال در گوساله ها بررسی شد. با بررسی نمونه های خون اخذ شده...

سابقه و هدف: سیستم های SOS مهم ترین نقش را در تحمل شوری گیاه دارد. این سیستم در آرابیدوپسیس تالیانا به عنوان یک سیستم پیام رسانی سلول در مسیرهای تحمل به تنش شوری عمل می‌کند. مواد و روش ها: در این تحقیق با بررسی توالی ژن sos1 در آرابیدوبسیس از پایگاه Tair، EBI، NCBI، plantcare وEXPASY و هم چنین جهت بررسی روابط این ژن در سیزده گونه گیاهی مختلف، میزان همولوژی آن ها از لحاظ میزان تشابه با نرم افز...

زمینه مطالعه: برونشیت عفونی  پرندگان بیماری حاد، بسیار مسری،  با انتشار جهانی می باشد، جهش های نقطه ای و نوترکیبی ژنوم ویروس موجب تکامل مداوم آن شده و بنابراین ظهور واریته های ویروس برونشیت عفونی پرندگان کنترل این بیماری را پیچیده نموده است. هدف: بررسی خصوصیات ژنی واریته های جدید ویروس برونشیت عفونی جدا شده در مرغداری های صنعتی ایران در نمونه هایی که بین سال های 1388 و 1389 جمع آوری گردیده است....

 مقدمه و هدف: کنه بوافیلوس سبب انتقال برخی از اجرام پاتوژن و کاهش تولید دام می شود. پروتئین تروپومیوزین، تنظیم گر فعالیت اکتین بوده و نقش مهمی در واکنش های ایمنی و آلرژی دارد و در بسیاری از گونه های انگل ها انتخاب مناسبی جهت تهیه واکسن می باشد. مواد و روش کار: با توجه به خصوصیت ایمنی زایی پروتئین تروپومیوزین کنه، توالی کامل این پروتئین از کنه بوافیلوس میکروپولوس به همراه توالی تروپومیوزین...

مقدمه: آیورین 2/1 یک پپتید 13 آمینه ای است که طیف وسیعی از فعالیت های آنتی باکتریایی و ضد سرطانی را نشان می دهد. ساختار آن توسط طیف سنجی رزنانس مغناطیسی تعیین شده که مارپیچ آلفا است ولی هنوز مکانیسم عمل آن شناخته نشده است. این مطالعه با هدف تعیین عوامل موثر بر فعالیت پپتیدها و مطالعه ارتباط توالی-فعالیت در پپتید آنتی باکتریایی آیورین 2/1 و آنالوگهایش طراحی و انجام گردید. روش کار: در این مطالعه ...

به منظور بررسی تمایل اسیدهای آمینه مجاور(دوتایی) در ساختمانهای دوم از نوع مارپیچ آلفا، مکانهای مورد مطالعه در مارپیچ آلفا بدین شکل انتخاب شدند: c’، ccap، c1، c2، c3، c4، m، n4، n3، n2، n1، ncap، n’. در این مکانها توالی های دوتایی مورد بررسی عبارت بودند از: m1m2، n3n4، n2n3، n1n2، ncap n1، n’ncap، ccapc’، c1ccap، c2c1، c3c2، c4c3. m2m3. ترجیح قرار گرفتن هر اسید آمینه در هر جایگاه مارپیچ آلفا و ت...