سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده های ژنی که بین فنوتیپ های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن های منفرد، تحلیل خانواده های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ ها به کار می گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده های ژنی پرداخته می شود. مواد و روش ها: از دو روش ط...

مدل مخاطرات متناسب کاکس از روش های متداول در تحلیل داده های بقا می باشد که در هنگام استفاده از داده هایی با ابعاد بالا همگرا نشده و کارایی لازم برای برآورد را ندارد. به این منظور برای داده هایی با ابعاد بالا مدل کرنل کاکس جایگزین آن می شود. ماشین بردار پشتیبانی زیرمجموعه ای از تکنیک های داده کاوی است که توانایی کار با داده هایی با ابعاد بالا را دارد و همچنین نیازی به بررسی پیش فرض بر روی داده ه...

فناوری ریزآرایه یک ابزار تحلیلی کوچک است که به کمک آن می توان بیان ده ها هزار ژن را، به طور همزمان مورد کاوش قرار داد. سوال عمده مورد بحث در ریزآرایه ها، چگونگی انتخاب مارکرهای ژنی می باشد، تشخیص مارکرهای ژنی می تواند تشخیص زودتر، درمان و پیش بینی دقیق تر نتیجه بیماری ومتعاقب آن استفاده از درمان های مناسب وکاهش هزینه ها را در پی داشته باشد.با استفاده از نظریه های آماری برای پردازش داده های ریزآ...

فناوری ریزآرایه یک ابزار تحلیلی کوچک است که به کمک آن می توان بیان از دهها هزار ژن را، به طور همزمان مورد کاوش قرار داد.سوال عمده مورد بحث در ریزآرایه ها، چگونگی انتخاب مارکرهای ژنی می باشد، تشخیص مارکرهای ژنی می تواند تشخیص زودتر، درمان و پیش بینی دقیق تر نتیجه بیماری ومتعاقب آناستفاده از درمان های مناسب وکاهش هزینه ها را در پی داشته باشد. با استفاده از نظریه های آماری برای پردازش داده های ری...

برنج یکی از ارزشمندترین محصولات کشاورزی است. یکی از تأثیرگذارترین عوامل محدود کننده این محصول استراتژیک تنش خشکی می‌باشد. نظر به چند ژنی بودن تحمل به خشکی، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژن‌های کلیدی مربوطه در برنج با استفاده از تجزیه و تحلیل داده‌های ریزآرایه بوده است. به همین منظور با استفاده از نرم‌افزار تحت وب Genevestigator تمامی ژن‌های دارای تغییر بیان بالاتر و مساوی 5/2 ...

برنج یکی از ارزشمندترین محصولات کشاورزی است. یکی از تأثیرگذارترین عوامل محدود کننده این محصول استراتژیک تنش خشکی می‌باشد. نظر به چند ژنی بودن تحمل به خشکی، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژن‌های کلیدی مربوطه در برنج با استفاده از تجزیه و تحلیل داده‌های ریزآرایه بوده است. به همین منظور با استفاده از نرم‌افزار تحت وب Genevestigator تمامی ژن‌های دارای تغییر بیان بالاتر و مساوی 5/2 ...

  سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده‌های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده‌های ژنی که بین فنوتیپ‌های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می‌کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن‌های منفرد، تحلیل خانواده‌های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن‌ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ‌ها به کار می‌گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده‌های ژنی پرداخته می‌شود. مواد و روش‌ها: از ...

مقدمه و هدف: در سال های اخیر، فناوری ریزآرایه ی dna نقش اساسی در تحقیقات ژنومی داشته ­است. با استفاده از این فناوری که امکان آنالیز هم­زمان سطوح بیان هزاران ژن را در شرایط مختلف فراهم­آورده­است، به حجم انبوهی از داده ها دست­می یابیم. روش های کلاسیک خوشه بندی نظیر روش های سلسله مراتبی و غیرسلسله مراتبی، روش هایی مناسب برای تحلیل این­گونه داده ها هستند اما محدودیت هایی نیز دارند. در این روش ها فر...

یک ریزآرایه ماتریکسی از ردیف های حاوی توالی نمونه هاست که روی یک سطح ثابت شده اند. این روش بر اساس قواعد جفت شدن بازها محیطی را برای جفت شدن نمونه های شناخته شده (پروب ها) با نمونه های ناشناخته (الگوها) فراهم می آورد. برخلاف روش های قدیمی تر که عمدتاً بر پایه بررسی یک ژن در هر آزمون عمل می کنند، ریزآرایه ها وسعت عمل بسیار گسترده ای دارند، به طوری که می توان کل ژنوم را روی یک تراشه ژنی بررسی کرد....

امروزه استفاده از اطلاعات ژنتیکی افراد در تشخیص و رده بندی انواع بیماری ها از جمله سرطان ها، مورد توجه قرار گرفته است. یکی از بهترین و دقیق ترین روش ها در این زمینه، بررسی مقادیر بیان ژنی در افراد مختلف توسط فناوری ریزآرایه می باشد. یکی از مشکلات داده های ریزآرایه کم بودن تعداد نمونه ها در مقایسه با تعداد ژن ها است. این مسیله سبب کاهش دقت رده بندی و افزایش هزینه های محاسباتی و آزمایشگاهی می شود...