در این پایان نامه، مطالعات ارتباط کمی ساختار و فعالیت سه بعدی، الحاق مولکولی و غربالگری مجازی دو سری از بازدارنده های کیناز در راستای یافتن رابطه ای میان خواص مولکولی و فعالیت های زیستی و همچنین پیشنهاد ترکیبات جدید با خاصیت بازدارندگی بیشتر انجام شد. در مطالعه اول، مدل کیوسار سه بعدی جدید autogpa براساس انطباق فارماکوفوری برای مقایسه با دو مدل کومفا و کومسیا بر مبنای برخط کردن بر روی بیشترین ز...

شیمی محاسباتی شاخه ای از شیمی است که با استفاده از اصول علوم کامپیوتری در استخراج اطلاعات از سیستم های شیمیایی، به حل مسائل شیمی کمک می کند. این رشته، از نتایج شیمی نظری، در قالب برنامه های کامپیوتری، برای محاسبه ساختار و خواص مولکول ها و جامدات استفاده می کند. این رشته علمی نوین می باشد که با تمرکز بر آمیخته ی ذخایر اطلاعات شیمیایی، داده ها را به اطلاعات و اطلاعات را به دانش تبدیل می کند. در...

در این پایان نامه، مطالعات روابط کمی ساختار فعالیت (کیوسار) سه بعدی، الحاق مولکولی، غربالگری مجازی و admet برای دو سری از بازدارنده های پلیمریزاسیون توبولین در نقش عوامل ضدسرطانی به منظور پیش بینی فعالیت زیستی بالقوه ترکیبات و پیشنهاد ترکیبات با خواص ضدسرطانی قویتر انجام شدند. در مطالعه اول، مطالعات کیوسار سه بعدی کومفا و کومسیا و الحاق مولکولی برای مشتقات ارتو آریل کالکون با فعالیت ضدسرطانی رو...

گیرنده جفت شده پروتئین g 119 (gpr 119) یک هدف جالب و امیدوارکننده برای درمان بیماری دیابت نوع 2 (t2dm) است. در این تحقیق، روابط کمّی ساختار- فعالیت سه بعدی، الحاق کردن مولکولی و غربالگری مجازی بر روی یک سری از آگونیست های جدید gpr 119 انجام شد. نتایج، توانایی پیش بینی و قابلیت اطمینان بالایی از مدل ها را نشان داد. یک مدل فارماکوفوری کیفی با استفاده از الگوریتم hip-hop ساخته شد. این مدل رضایت بخش...

اگزوسیتوز سیناپسی یکی از موارد مهم در بررسی و توضیح مکانیسم الحاق غشایی می باشد. بر اساس مهمترین مدل ارائه شده به نام مدل الحاق کامل، وزیکول های ترشحی برای آزاد سازی نوروتراسمیترها در فضای سیناپسی به طور کامل در غشا فیوز شده و جزئی از غشاء پلاسمایی سلول پیش سیناپسی می شوند. تراکم وزیکول های درون سلولی حاوی نوروتراسمیتر ها، مطرح کننده سوالی می باشد مبنی براینکه چگونه وزیکول های ترشحی به صورت هما...

در این پایان ¬نامه، مطالعات روابط کمی ساختار- فعالیت سه¬بعدی و الحاق کردن مولکولی به منظور یافتن رابطه¬ای میان خواص مولکولی و فعالیت زیستی بر روی مشتقات ایندولینون مهارکننده¬های plk4 به عنوان عوامل ضد تکثیری جدید و همچنین پیشنهاد ترکیباتی با خاصیت ضدسرطانی بیشتر انجام شد. مدل¬¬های کومفا و کومسیا براساس برخط نمودن بر روی بیشترین زیر مجموعه ساختاری مشترک تولید شدند. اعتبارسنجی داخلی و خارجی برای ...

زمینه و هدف: لوسمی پرومیلوسیتی حاد(apl) با جابجایی کروموزومی (15:17) t ( الحاق گر ژن های pml و rara)، همراه است. شواهد سیتوژنتیک و مولکولی این جابجایی در 90 تا100درصد بیماران با ریخت شناسی apl شناسایی شده است. این بیماری به صورت ویژه ای  به درمان با atra حساس بوده و به شیمی درمانی رایج بخوبی پاسخ می دهد. ناهنجاری t(1117)(q23q21)  همراه با بازآرایی p‏lzf-rara  شایع ترین جابجایی جایگزین است که در...

در این پایان نامه، مطالعه 4d-qsar بر روی دو مجموعه از بازدارنده های گرم منفی lpxc به عنوان داروی آنتی بیوتیک و بازدارنده های pi3k با خاصیت ضد سرطانی انجام شده است. بعد چهارم در این روش مدلسازی، مربوط به نمونه برداری از مجموعه صورت بندی ها می باشد. این روش به کمک شبیه سازی دینامیک مولکولی، به جای استفاده از یک صورت بندی منفرد، از یک مجموعه صورت بندی نمونه برداری شده برای هر ترکیب، استفاده می کند...

در این پایان نامه، مطالعات روابط کمّی ساختار-فعالیت سه بعدی و الحاق نمودن مولکولی به منظور یافتن رابطه ای بین خواص مولکولی و فعالیت زیستی برروی مهارکننده های گلیکوژن سنتازکیناز–3 (gsk-3)با پایه مالئیمید به عنوان تثبیت کننده های خلق و خوی و همچنین پیشنهاد ترکیباتی با اثر دارویی بهتر جهت رفع اضطراب و هیجان انجام شد. مدل های کومفا و کومسیا براساس برخط نمودن بر روی بیشترین زیر مجموعه ساختاری مشترک ت...

در این پایان نامه، تلاش شده تا از روش های مدل سازی کامپیوتری جهت طراحی فاز ساکن، بهینه سازی پارامترهای جداسازی و بررسی مکانیسم بازداری استفاده شود. در مطالعه اول مدل سازی کامپیوتری از طریق روشهای کومفا، کومفا – تمرکز میدانی، و کومسیا بر روی یک سری از ترکیبات ضد سرطان انجام گرفت. قابلیت پیشگویی خارجی مدلهای ساخته شده، از طریق مجموعه آزمون مورد ارزیابی قرار گرفت. همچنین پارامترهای آماری م...