امروزه طراحی مولکول های هوشمند و پیش بینی به کمک کامپیوتر سهم بزرگی در تحقیقات فعال کننده ها یا مهارکننده های پروتئینی دارد. مدل های مولکولی به عنوان یک تکنیک کلیدی درفرایند کشف دارو استفاده می شود. مدل های مولکولی یک نقطه شروع برای شبیه سازی های مولکولی در شرایط متفاوت و برای محاسبات ویژگی های مولکولی با استفاده از مکانیک مولکولی است. هدف روش های qsar ساختن مدل های پیش بینی کننده کمی برای کشف...

در بخش اول این پروژه، مطالعات کمی ساختار- فعالیت (qsar) بر روی اثر بازداری (pic50) 40 ترکیب دارویی از مشتقات فنیل آلکیل آمین که به عنوان ترکیبات ضد روان پریشی عمل می کنند، انجام شد. برای انتخاب مهمترین توصیف گرها از روش انتخاب متغیر مرحله ای و الگوریتم ژنتیک استفاده شد. همچنین برای ایجاد مدل جهت پیش بینی اثر بازداری روش رگرسیون خطی چند گانه (mlr) به عنوان یک روش خطی، شبکه عصبی مصنوعی (ann) به ع...

1-1-1- بی فنیل های چند کلره(pcbs) ترکیبات پلی کلره بی فنیل (pcbs) گروهی از مواد شیمیایی آلی سنتزی هستند که در حالت خالص، سفید رنگ و کریستاله هستند و ترکیبات صنعتی آن ها، به صورت مایع بی رنگ می باشند. ترکیبات پلی کلرینه بی فنیل بر اثر وارد کردن بی فنیل در گاز کلر در مجاورت پودر آهن یا کلرید آهن به عنوان کاتالیزور به صورت صنعتی تولید می شوند. در مجموع ??? ایزومر متفاوت بر حسب تعداد اتم کلر (? ...

در بخش اول این تحقیق، ارتباط کمی ساختار – فعالیت (qsar) 56 ترکیب بازدارنده cdk2 با استفاده از دو روش خطی (رگرسیون خطی چندگانه؛ mlr) و غیر خطی (شبکه عصبی مصنوعی؛ ann) مدل سازی شد. بازدارنده های cdk2 (کیناز وابسته به حلقه) ترکیباتی هستند که نقش اساسی در تنظیمات سلولی داشته و از تکثیر اضافی سلول ها توسط cdk2 که دچار فعالیت بیش ازحد شده و منجر به سرطان می شوند جلوگیری می کنند. توانایی پیش بینی مدل ...

کاندیدیازیس عفونت ناشی از قارچ کاندیدا آلبیکانس است. مشتقات بتراکسازول ها، بنزایمیدازول ها و )4و5 – (b پیریدین اکسازول ها دارای اثر مهار کنندگی روی این قارچ هستند . در پژوهش حاضر در مرحله ی اول سعی شده است با استفاده از روش رگراسیون خطی چند گانه ، فعالیت بیولوژیکی این ترکیبات مدل سازی و پیش بینی شود . این مشتقات شامل 60 مولکول هستند ، که مقادیر تجربی مهار کنندگی انها در دسترس است .

مطالعات 3d-qsar بر روی تعدادی از مشتقات کوئینولین به عنوان دارو‏های بازدارنده‏ی فسفودی‏استراز ? انجام گرفت.. در این مطالعه‏ از روش‏های comfa، comfa تمرکز میدانی و comsia، برای پیش‏گویی میزان اثر بازدارندگی ?? مولکول از مشتقات کوئینولین روی فسفودی‏استراز ?، استفاده گردید. مدل‏سازی‏های comfa، comfa تمرکز میدانی وcomsia ، با نرم‏افزار مدل‏سازی sybyl از شرکت tripos انجام شد. ترکیبات با استفاده از ا...

روابط ساختار- فعالیت از جمله روش های مهم در کمومتری هستند که بررسی رابطه ی بین ساختار و فعالیت ترکیبات، پیش بینی فعالیت ترکیبات جدید را براساس اطلاعات مربوط به ساختار شیمیایی آن ها امکان پذیر می سازد. در این تحقیق متغیرهای کوانتومی در حالت خلأ، حلال آب و اکتانول مطابق با روش اونزاگر، متغیرهای پتانسیل الکترواستاتیک پولیتزر، رزونانس مغناطیس هسته برای 67 مولکول ازمشتقات فنول محاسبه شد. وابستگی فعا...

در این تحقیق، مطالعات ارتباط کمی ساختار – خاصیت (qspr) با استفاده از مدل سازی خطی و غیرخطی برای پیش بینی ضریب خودنفوذی آلکان های خطی به کار گرفته شده است. داده های مربوط به ضریب خودنفوذی، با استفاده از روش تحلیل مولفه ی اصلی(pca) به چهار دسته ی آموزش، ارزیابی، تست و تست بیرونی دسته بندی گردید. توصیف کننده های ساختار مولکولی محاسبه شد و پس از حذف توصیف‎کننده های اضافی و افزودن دو پارامتر دما و ف...

هدف اصلی از پروژه ی حاضر کاوش اطلاعات از ترکیباتی بر پایه ی 4-کینولین هیدرازون با استفاده از مدل های qsar است که این مدل سازی ها در جستجوی ترکیبات ضد سل قوی ایجاد می شود. مدل سازی فعالیت ضد سل این ترکیبات به صورت تئوری به عنوان تابعی از توصیف کننده های مولکولی مختلف به وسیله ی روش های خطی و غیرخطی انجام شد. مدل سازی qsar با استفاده از انواع مختلفی از توصیف کننده هایی که توسط نرم افزارهای دراگون...

در بخش اول این پروژه، مدل qsprبر پایه روش ماشین بردار پشتیبان، جهت پیشگویی دمای خود اشتعالی 35 ترکیب آلی مایع قابل اشتعال با هوا در فشار بالا، بین 10-2 بار ساخته شد. آنها گروه های مختلف از ترکیبات آلی، شامل هیدروکربن های آلیفاتیک، آروماتیک ها، الکل ها، اسیدها، آلدهیدها، کتون ها، استرها و آمین ها می باشند. ابتدا ساختار مولکولی این ترکیبات در نرم افزار hyper chem رسم شدند و پس از بهینه سازی ساختا...