به منظور بررسی تمایل اسیدهای آمینه مجاور(دوتایی) در ساختمانهای دوم از نوع مارپیچ آلفا، مکانهای مورد مطالعه در مارپیچ آلفا بدین شکل انتخاب شدند: c’، ccap، c1، c2، c3، c4، m، n4، n3، n2، n1، ncap، n’. در این مکانها توالی های دوتایی مورد بررسی عبارت بودند از: m1m2، n3n4، n2n3، n1n2، ncap n1، n’ncap، ccapc’، c1ccap، c2c1، c3c2، c4c3. m2m3. ترجیح قرار گرفتن هر اسید آمینه در هر جایگاه مارپیچ آلفا و ت...

ژن گیرنده پرولاکتین به دلیل نقش حیاتی در انتقال علائم هورمون لاکتوژن به پروموتر پروتئین شیر از مهمترین ژن های کاندیدای مؤثر در تولید شیر شناخته شده است. تحقیق حاضر با هدف توالی‌یابی اگزون 9 ژن گیرنده پرولاکتین در بز خلخالی و آنالیز بیوانفورماتیک این ژن در حیوانات اهلی انجام شده است. جهت آنالیزهای بیوانفورماتیک و مقایسه گونه‌ای، از توالی‌های ژنومی گونه‌های مختلف حیوانات اهلی استفاده شد جهش مشاهد...

آر.ان.ای­ های کوچک غیر کدکننده، نقش­ های مختلفی در رشد و توسعه گیاهان و حیوانات ایفا می­کنند. این آر.ان.ای‌های تنظیم­ گر، رشد و نمو را از طریق تنظیم سایر ژن­ها در سطوح رونویسی، پس از رونویسی و ترجمه هدایت می­کنند. فعالیت این ژن­ها از طریق تنظیم در سطح دی.ان.ای از طریق متیلاسیون، تبدیل یوکروماتین به هتروکروماتین و در سطوح دیگر از طریق برش آر.ان.ای­ های هدف، یا ممانعت از ترجمه آن­ها صورت می­ پذیر...

چکیده تنش اکسیداتیو یک تنش ثانویه است، علامت ندارد و در پس زمینه همه تنش ها وجود دارد و مهمّترین تنش در دنیای بیولوژی گیاهی و جانوری است. مثلاً شوری یک تنش اولیه است که پس از اعمال در گیاه، منجر به تولید ros ها که همان تنش اکسیداتیو است، می شود. گیاهان مکانیسم های مهمّی را برای مقابله با آنها در خود توسعه داده اند. ros ها یا انواع اکسیژن های واکنشی ، به عنوان مواد جهش زا در واکنش ها عمل می کنند ...

اسکوالن یک تری ترپن غیر اشباع می باشد که کاربردهای گسترده ای در داروسازی دارد. در این تحقیق تولید اسکوالن و بررسی بیوانفورماتیکی ژن آن در سویه بومی آئورانتیوکیتریوم مورد بررسی قرار گرفت. این سویه به ترتیب به میزان 7/3 و 6/1 گرم بر لیتر بیومس و روغن غنی از اسکوالن تولید می کند. مقدار اسکوالن تولیدی توسط این سویه 9/48 میلی گرم بر لیتر می باشد. همچنین ژن اسکوالن سنتاز از این سویه توسط آنالیز مولکو...

تجزیه کاربردی کدون اهمیت ویژه‌ای در بهینه‌سازی سامانه بیان ژن‌ها در تولید پروتئین دارد. جنس گوسیپیوم مهمترین گیاه تولیدکننده الیاف در دنیای جدید می‌باشد. در این تحقیق توالی کامل ژنوم کلروپلاست دو گونه‌ G.thurberi و G.arboreum توسط نرم افزار کدونW مورد مطالعه و تجزیه قرار گرفت. تجزیه کدون‌های دارای ترادف (RSCU) برای 57 ژن کدکننده پروتئین در ژنوم کلروپلاست این دو گونه به منظور دستیابی به فاکتورها...

در یوکاریوت‌ها DNA ژنومی در ترکیب با پروتئین‌های هیستونی کروماتین را ایجاد می‌کند. چپرون‌های هیستونی از طریق تغییر دسترسی به DNA بر میزان رونویسی ژن‌ها تأثیر می‌گذارند. بر خلاف مخمر و جانوران، در مورد چپرون‌های هیستونی گیاهی اطلاعات کمی وجود دارد. در این رابطه، خانواده nucleosome assembly protein (NAP) در تمام یوکاریوت‌ها حفاظت شده بوده و جزء جدایی ناپذیر در پایداری، حفظ و پویایی کرماتین یوکاری...

هشت ژنوم دیپلوئید شامل ژنوم‌های A، B، C، D، E، F، G و K در جنس گوسیپیوم Gossypium شناسایی شده اند. ژنوم A فقط به دو گونه herbaceum و arboreum پنبه های دنیای قدیم محدود شده است و این ژنوم از G. herbaceumبه گونه‌های دیگر انتقال پیدا کرده است. به منظور توالی یابی ژنوم کلروپلاست G. herbaceum (A1) و مقایسه آن با دو گونه G. hirsutum (AD1) و G. barbadense (AD2) توالی‌های ژنوم سه گونه از سایت مرکز مل...

nestrenconia sp.strain.f یک جنس نمک دوست از خانواده micrococcacae است که ژنوم آن غنی از cg است. توسط نرم افزار rast ژنوم باکتری را بررسی کردیم. این بررسی نشان داد که ژنوم باکتری حاوی ژن endo-1,4-beta-xylanase است. پروتئین های اندو 1و4 بتا زایلاناز ( ec 3.2.1.8) آنزیم های هیدرولاز هستند که پیوند های 1-4 گلیکوزیدیک را در مولکول زایلان از ترکیب همی سلولوز می شکند.مطالعات دینامیک مولکولی مشخص کرد ک...

هشت ژنوم دیپلوئید شامل ژنوم‌های A، B، C، D، E، F، G و K در جنس گوسیپیوم Gossypium شناسایی شده اند. ژنوم A فقط به دو گونه herbaceum و arboreum پنبه های دنیای قدیم محدود شده است و این ژنوم از G. herbaceumبه گونه‌های دیگر انتقال پیدا کرده است. به منظور توالی یابی ژنوم کلروپلاست G. herbaceum (A1) و مقایسه آن با دو گونه G. hirsutum (AD1) و G. barbadense (AD2) توالی‌های ژنوم سه گونه از سایت مرکز مل...