5 Univ. Grenoble Alpes, Institut de Biologie Structurale (IBS), Grenoble, France. 6 CNRS, UMR5075, IBS, F-38027 Grenoble, France. 7 CEA, DSV, IBS, F-38027 Grenoble, France. 8 Max Planck Institute for Molecular Genetics, Berlin, Germany 9 Université de Lyon, Ecole Normale Supérieure de Lyon, Laboratoire de Chimie, UMR CNRS 5182, 10 Lyon, France. 11 Institut de Biochimie et de Biophysique Molécul...

*Centre de Recherche en Pharmacologie-Santé, Unité Mixte de Recherche 2587, Centre National de la Recherche Scientifique-Pierre Fabre, Institut de Sciences et Technologies du Médicament de Toulouse, 31400 Toulouse, France; Centre de Biologie du Développement, Unité Mixte de Recherche 5547, Centre National de la Recherche Scientifique-Université Paul Sabatier, Institut d’Exploration Fonctionnell...

R~sum~ Pour "multilingualiser" (et non simplement "localiser") Gif, un 6diteur de documents structures, nous avons d6fini un langage de transcription, appel6 langage E, analogue aux autres langages (S, Pet T) de Grif. E est utilis6 pour compl6ter la description structurale d'une classe de documents, 6crite en S, par une description "linguistique" concemant les syst~mes d'6cnture utilis6s clans ...

1Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale (IPBS), Département Mécanismes Moléculaires des Infections Mycobactériennes, Toulouse, France; 2Université de Toulouse; Université Paul Sabatier, IPS, IPBS, Toulouse, France; 3Membrane and Cytoskeleton Dynamics, CNRS Unité Mixte de Recherche (UMR) 144, Paris, France; 4Research Center, Inst...

RPBS (Ressource Parisienne en Bioinformatique Structurale) is a resource dedicated primarily to structural bioinformatics. It is the result of a joint effort by several teams to set up an interface that offers original and powerful methods in the field. As an illustration, we focus here on three such methods uniquely available at RPBS: AUTOMAT for sequence databank scanning, YAKUSA for structur...

1Unité Propre de Recherche 9050 Centre National de la Recherche Scientifique, Ecole Supérieure de Biotechnologie de Strasbourg Université Louis Pasteur, F-67400 Illkirch, Strasbourg, France, 2Département de Phamacochimie Moléculaire et Structurale, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale U266, Unité de Recherche Associée D1500 Centre National de la Recherche Scientifique, Univ...

We consider the following Minimum Connectivity Inference problem (MCI), which arises in structural biology: given vertex sets Vi ⊆ V, i ∈ I, nd the graph G = (V,E) minimizing the size of the edge set E, such that the sub-graph of G induced by each Vi is connected. This problem arises in structural biology, when one aims at nding the pairwise contacts between the proteins of a protein assembly, ...

Laboratoire de Dynamique des Interactions Membranaires Normales et Pathologiques, Universités de Montpellier II et I, CNRS; UMR 5235, case 107, Place Eugène Bataillon, 34095 Montpellier Cedex 05, France. Institut de Biologie et Chimie des Protéines (IBCP UMR 5086), CNRS, Université Lyon1, IFR128 BioSciences, Lyon-Gerland, 7 passage du Vercors, 69367 Lyon Cedex 07, France. Institut National de l...

Chemistry Aware Model Builder Isidro Cortes-Ciriano∗1,5, Daniel S. Murrell†2,5, Gerard J. P. van Westen, Ian P. Stott, Andreas Bender, Therese E. Malliavin, and Robert C. Glen Unite de Bioinformatique Structurale, Institut Pasteur and CNRS UMR 3825, Structural Biology and Chemistry Department, 25-28, rue Dr. Roux, 75 724 Paris, France. Unilever Centre for Molecular Science Informatics, Departme...