الگوی مارکوف پنهان در مسائل بیوانفورماتیک کاربرد فراوانی دارد. برای مثال این الگو در هم ردیفی دنباله ­ ها، تفسیر خانواده ­ های پروتئین و پیش ­ بینی ژن بکار می ­ رود. پارامترهای این الگو از طریق الگوریتم بام-ولش تعلیمی که یک الگوریتم em است برآورد می ­ شود. بکارگیری کارآمدترین الگوریتمها برای دنباله های طویل نیازمند حجم وسیعی از حافظه می ­ باشد. در این مقاله روش ­ های مختلفی از جمله استراتژی پیش...

در مطالعه حاضر، فیلوژنی 15 گونه علفی و چندساله مربوط به بخش ornithopodium bunge و دو بخش نزدیک به آن یعنی بخش های onobrychoidei dc. و dissitiflori dc. با استفاده از داده های حاصل از ریخت شناسی، توالی ناحیه its ژنوم هسته ای و توالی ژن matk کلروپلاستی، ارزیابی و تحلیل شد. بر اساس نتایج به دست آمده از داده های ریخت شناختی، اعضای دو بخش onobrychoidei و ornithopodium تاکسون های نزدیک به هم بوده، به ...

زمینه و هدف: باکتری سالمونلا یکی از مهم‌ترین عوامل گاستروانتریت باکتریایی و بیماری‌های ناشی از غذا است. تاکنون بیش از ۲۵۰۰ سرووار از این جنس شناسایی‌شده که اکثر آنها برای انسان بیماری‌زا هستند. ساختار فیلوژنی خانواده انتروباکتریاسه براساس توالی ۱۶S rRNA تنوع وسیعی ندارد. بنابراین این ژن به دلیل میزان توالی بالای حفاظت‌شده در ساختار خود، نمی‌تواند مشکلات طبقه‌بندی را در گونه‌های نزدیک به هم حل ک...

تنک کردن یکی از مهم ترین عملیات کشاورزی است که در مرحله داشت بسیاری از محصولات ردیفی انجام می گیرد. انجام این عملیات به صورت دستی، مستلزم وقت و هزینه زیاد است. برای کاهش دشواری عملیات تنک کردن، کاهش هزینه ها و انجام به موقع آن، نیازمند کاربرد ماشین های تنک کن هستیم که به دو گروه عمده تصادفی و انتخابی تقسیم می شوند. انواع انتخابی این ماشین ها بعد از انواع تصادفی ارائه شدند تا مشکلات آن ها را برط...

بمنظور ارزیابی کشت مخلوط ذرت (zea mays l.) و لوبیا (phaseolus vulgaris l.) آزمایشی در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی با 11 تیمار و سه تکرار اجرا گردید. تیمارهای آزمایش شامل کشت مخلوط تراکم معمول ذرت(c) با تراکم معمول لوبیا(b) باضافه 10%،20 % و30% {b(c+30%c),b(c+20%c),b(c+10%c)} ، کشت مخلوط تراکم معمول لوبیا(b) با تراکم معمول ذرت(c) باضافه 10%، 20% و 30% {b(c+30%), b(c+20%),b(c+10%)} کشت مخلوط ترا...

گذر به گل دهی یک تغییر فاز بزرگ در چرخه ی زندگی گیاهان است. ژن apetala1 در پیش برد مرحله گذر ونیز تعیین هویت مریستم گل نقش ایفا می کند. این پژوهش با هدف طراحی پرایمر، استخراج، شناسایی و تعیین توالی این ژن در گیاه خردل سیاه (brassica nigra)انجام شد. rna کل از گل های بالغ استخراج و برای ساخت cdna استفاده گردید. آغازگرهای اختصاصی بر اساس توالی ژن های هم ساخت ap1 در گیاهان هم خانواده در سایت ncbi ط...

سابقه و هدف: سیستم های sos مهم ترین نقش را در تحمل شوری گیاه دارد. این سیستم در آرابیدوپسیس تالیانا به عنوان یک سیستم پیام رسانی سلول در مسیرهای تحمل به تنش شوری عمل می کند. مواد و روش ها: در این تحقیق با بررسی توالی ژن sos1 در آرابیدوبسیس از پایگاه tair، ebi، ncbi، plantcare وexpasy و هم چنین جهت بررسی روابط این ژن در سیزده گونه گیاهی مختلف، میزان همولوژی آن ها از لحاظ میزان تشابه با نرم افزار...

سازند آب تلخ یکی از واحد های کرتاسه پسین مربوط به حوضه رسوبی کپه داغ (شمال شرق ایران) می باشد. در این مطالعه سازند مورد نظر در شرق حوضه در روستای پادها واقع است. این سازند دارای991 متر ضخامت بوده و لیتولوژی آن متشکل از شیل و مارن خاکستری تا خاکستری متمایل به آبی می باشد. مرز زیرین آن با سازند آبدراز به صورت تدریجی و هم شیب و مرز بالایی آن با سازند نیزار ناپیوسته است. در این مطالعه 42 گونه فرا...

به منظور تعیین مناسب ترین عرض نوار در کشت مخلوط ذرت و لوبیا، آزمایشی در سال زراعی 1387 در مزرعه تحقیقاتی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد، در قالب طرح بلوکهای کامل تصادفی با 8 تیمار و 3 تکرار اجرا گردید. تیمارهای آزمایش شامل کشت خالص ذرت (mc)، کشت خالص لوبیا (mb)، کشت مخلوط ردیفی (r) و کشت به صورت مخلوط نواری (s) شامل پنج ترکیب (2 – 2)، (3 – 3)، (4 – 4)، (5 – 5) و (6 – 6) از ردیفهای ذرت و لو...