مقدمه: در این تحقیق عملکرد 3 نانوموتور بر روی 15 پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش‌ساز آمیلوئید بتا از طریق شبیه‌سازی دینامیک مولکولی انجام گرفت. روش: در این مطالعه 14 نوع موتانت و 1 نوع نرمال پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از پایگاه داده NCBI به دست آمده و سپس شبیه‌سازی با استفاده از نرم افزارDesigner Ascalaph  انجام شد. 15 پپتید با ساختار‌های 3 بعدی پایدار سنتز شده، برای ورود به م...

مقدمه: در این تحقیق عملکرد 3 نانوموتور بر روی 15 پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش‌ساز آمیلوئید بتا از طریق شبیه‌سازی دینامیک مولکولی انجام گرفت. روش: در این مطالعه 14 نوع موتانت و 1 نوع نرمال پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از پایگاه داده NCBI به دست آمده و سپس شبیه‌سازی با استفاده از نرم افزارDesigner Ascalaph  انجام شد. 15 پپتید با ساختار‌های 3 بعدی پایدار سنتز شده، برای ورود به م...

پیوندهای هیدروژنی بین مولکولی در جفت بازهای اسید نوکلئیک یک نقش کلیدی در اختصاصی کردن ساختار آن ها بازی می کند. ساختار جفت باز a – t و ساختارهای مختلف پیش بینی شده مربوط به این جفت باز با استفاده از محاسبات ab- initio در سطح محاسباتی g** 31-6 hf/و در یک سری از سطوح نظریه تـابعی چگالی ، b3lyp/6-31g** و b3lyp/6-311++g**بهینه شد. پـارامترهای ساختـمانـی و انرژی های بهینه شده به دست آمد و بر روی پای...

در تقریب بورن – اپنهایمر،انرژیهای مولکولی به بخش های مجزای الکترونی و چرخشی-ارتعاشی تجزیه میشود.انرژی الکترونی بستگی به حالت های کوانتومی تک تک الکترونها داردو تابعی از فاصله بین هستهای r است.به علت تطبیق لحظه ای مختصات الکترونی با تغییر r، انرژی الکترونی و انرژی دافعه کولنی (v(r با هم یک میدان نیرو برای حرکت چرخشی-ارتعاشی هسته ای به وجود می آورند.از آنجا که حل دقیق معادله شرودینگر برای حرکت ال...

در تحقیقات انجام شده در این رساله به منظور محاسبه و بررسی عامل نفوذ حرارتی، هدایت گرمایی و شارهای گرما، الگوریتم جدیدی از دینامیک مولکولی غیر تعادلی را توسعه دادیم . این الگوریتم برپایه روشی است که اخیرا"هافسجولد تحت عنوان الگوریتم hex بکار برده شده است ، که در آن شار گرمایی ثابتی به دیواره های جعبه شبیه سازی اعمال می شود و سپس در هر گام زمانی گرادیانهای غلظت و دما محاسبه می گردند. مطالعات انجا...

از دیدگاه علم وصنعت اطلاع از خواص ترمودینامیکی مانند چگالی، ویسکوزیته و … یا به طور کلی داده های p-v-t امری ضروری می باشد. سانگ و میسون یک معادله حالت تحلیلی پیشنهاد کردند که بر پایه مکانیک آماری می باشد. در این معادله ضریب دوم ویریال که نقش اصلی را بر عهده دارد با اطلاع از انرژی پتانسیل بین مولکولی محاسبه می شود و بقیه پارامترها به جزئیات شکل پتانسیل حساس نیستند و فقط به شاخه دافعه انرژی پتان...

مقدمه: در این تحقیق عملکرد 3 نانوموتور بر روی 15 پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از طریق شبیه سازی دینامیک مولکولی انجام گرفت. روش: در این مطالعه 14 نوع موتانت و 1 نوع نرمال پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از پایگاه داده ncbi به دست آمده و سپس شبیه سازی با استفاده از نرم افزارdesigner ascalaph  انجام شد. 15 پپتید با ساختار های 3 بعدی پایدار سنتز شده، برای ورود به م...

چکیده ندارد.