تشخیص بیماری های عفونی بوسیله ردیابی مستقیم و غیر مستقیم عامل عفونی انجام می گیرد. بوسیله روش های مستقیم اجزا و ترکیبات عوامل عفونی همچون، اسیدهای نوکلئیک، پروتئین های ساختمانی و غیر ساختمانی، آنزیم ها ردیابی می شوند. روشهای جداسازی مستقیم شامل کشت، میکروسکوپ الکترونی، ایمنوفلورسانس، ایمنوهیستوشیمی، الیزا، هیبریداسیون اسیدهای نوکلئیک، روشهای متنوعی از واکنش زنجیره ای پلی مراز (polymerase chain ...