نتایج جستجو برای: charmm
تعداد نتایج: 456 فیلتر نتایج به سال:
The AMBER and CHARMM force fields are analyzed from the viewpoint of the permutational symmetry of the potential for feasible exchanges of identical atoms and chemical groups in amino and nucleic acids. In each case, we propose schemes for symmetrizing the potentials, which greatly facilitate the bookkeeping associated with constructing kinetic transition networks via geometry optimization.
دسته جدیدی از ترکیبات شیمیایی با عنوان مایعات یونی با خواص و ویژگی های فوق العاده، قادر به ایجاد محیط های شیمیایی سبز به منظور اجرای فرآیندهای شیمیایی هستند، اما با وجود تحقیقات آزمایشگاهی و تئوری زیاد هنوز هیچ ارتباط روشنی بین ساختار مولکولی و خواص این مایعات بدست نیامده است. یکی از راه های بدست آوردن خواص ترمودینامیکی و ماکروسکوپی این مایعات، استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی می باشد. این ...
Motivation Glycans play a central role in many essential biological processes. Glycan Reader was originally developed to simplify the reading of Protein Data Bank (PDB) files containing glycans through the automatic detection and annotation of sugars and glycosidic linkages between sugar units and to proteins, all based on atomic coordinates and connectivity information. Carbohydrates can have ...
The hydration behavior of two model disaccharides, methyl-D-maltoside (1) and methyl-Disomaltoside (2), has been investigated by a comparative 10 ns molecular dynamics study. The detailed hydration of the two disaccharides was described using three force fields especially developed for modeling of carbohydrates in explicit solvent. To validate the theoretical results the two compounds were synt...
نمودار تعداد نتایج جستجو در هر سال
با کلیک روی نمودار نتایج را به سال انتشار فیلتر کنید