پردازش رشته های ژنتیکی برای مقاصد انتخاب و طبقه بندی ژن ها از اهداف اساسی علم بیوانفورماتیک، به عنوان پیوندی بین علوم کامپیوتر و علوم ژنتیکی است. فرایند انتخاب رشته های ژنتیکی به معنای کشف مواردی از بروز یک ژن خاص و مرتبط، ولی با شکل های متفاوت است؛ که ممکن است در مقاطع زمانی مختلف در بافت های متفاوت ظاهر شده باشند، درحالی که طبقه بندی به دسته بندی ژن های مرتبط با هم در جریان نمونه های مختلف می...

زمینه و هدف: یافتن ژن های مرتبط با بقا بر مبنای داده های بیان ژن، یک کاربرد مهم داده های ریزآرایه می باشد. هدف از مطالعه حاضر شناسایی ژن های مرتبط با بقای بیماران مبتلا به سرطان متعارف سلول های کلیوی با استفاده از داده های بیان ژن حاصل از ریزآرایه است. روش کار: این مطالعه از نوع تحلیل بقای داده های ابعاد بالا است. 177 نمونه بیمار مبتلا به سرطان متعارف سلول های کلیوی (conventional renal cell car...

برنج یکی از ارزشمندترین محصولات کشاورزی است. یکی از تأثیرگذارترین عوامل محدود کننده این محصول استراتژیک تنش خشکی می‌باشد. نظر به چند ژنی بودن تحمل به خشکی، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژن‌های کلیدی مربوطه در برنج با استفاده از تجزیه و تحلیل داده‌های ریزآرایه بوده است. به همین منظور با استفاده از نرم‌افزار تحت وب Genevestigator تمامی ژن‌های دارای تغییر بیان بالاتر و مساوی 5/2 ...

زمینه مطالعه: ردیابی ژن‌های مربوط به عوامل حدت که در یک سویه از اشریشیا کلی‌‌حضور دارند جهت تعیین پروفایل ژنوتیپی و همچنین قرارگیری سویه در پاتوتیپی خاص از اهمیت فوق العاده‌ای برخوردار است. هدف: هدف از انجام این مطالعه تعیین پاتوتیپ جدایه های مختلف ‌E. coli جدا شده از گوساله‌ها و طیور بومی ایران با استفاده از تکنیک ریزآرایه می باشد. روش کار: در مطالعه حاضر تعداد 67 جدایه از اشریشیا کلی ‌پـ...

سابقه و هدف: به کارگیری فناوری ریزآرایه dna که امکان بررسی بیان هزاران ژن را به طور هم زمان در حداقل زمان ممکن می سازد، در سال های اخیر موجب تولید حجم انبوهی از داده های بیان ژنی شده است. تحلیل آماری این داده ها شامل مواردی چون نرمال سازی، خوشه بندی، طبقه بندی است. هدف این مقاله بررسی نحوه به کارگیری روش های آماری خوشه بندی در داده های ریز آرایه dna است. روش بررسی: در این تحقیق داده های سرطان پ...

سابقه و هدف: با توجه به اهمیت تنش خشکی و نظر به اینکه تحمل به تنش خشکی صفتی چند ژنی می­باشد، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژن‌های کلیدی دخیل در تنش خشکی درگیاه جو با استفاده از تجزیه و تحلیل داده‌های ریزآرایه و همچنین شناسایی فرایندهای موثر بوده است. مواد و روش­ها: تمامی ژن‌های دارای بیان افتراقی (≤ 5/2 و≥ 5/2-) در بین تمامی آزمایشات ریزآرایه انجام شده ، با استفاده از نرم‌افزا...

زمینه و هدف: سرطان یکی از دلایل عمده مرگ و میر در دنیای امروز است و به عنوان یکی از مهم ‎‎ترین مشکلات سلامت جوامع محسوب می شو‎د. اکثر روش های پیشنهادی جهت دسته بندی سرطان ‎‎به کمک داده های بیان ژن مانند یک جعبه سیاه عمل کرده‏ و قابلیت تفسیرپذیری زیستی ندارند. این مطالعه با هدف معرفی روشی بهینه با قابلیت تفسیر داده های بیان ژن انجام شد. روش بررسی: در این مطالعه، روش ترکیبی پالایشی - پوششی برای ا...