سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده های ژنی که بین فنوتیپ های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن های منفرد، تحلیل خانواده های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ ها به کار می گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده های ژنی پرداخته می شود. مواد و روش ها: از دو روش ط...

وجود داده‌های گمشده در داده‌های ریزآرایه، سبب کاهش دقت رسم شبکه‌های تنظیمی ژن، ایجاد اشتباه در خوشه بندی و تقسیم‌بندی تخصصی ژن‌ها و سایر تحلیل‌ها می‌شود. بنابراین تخمین داده-های گمشده مرحله مهمی در پیش پردازش داده‌های ریزآرایه، محسوب می‌شود. عملکرد الگوریتم-های تخمین در مجموعه داده‌های مختلف و با درصدهای متفاوت گمشدگی، متغیر است. همواره انتخاب مناسب‌ترین الگوریتم به منظور دستیابی به بیشترین دقت...

چکیده بیماری سپتوریوز یکی از مخرب ترین بیماری های برگی گندم در سراسر جهان است که سالانه خسارت های زیادی به بار می آورد. در حال حاضر استفاده از ارقام مقاوم و سموم شیمیایی دو روش اصلی کنترل این بیماری هستند. روش هایی زیادی جهت شناسایی ژن های مقاوم در منابع ژنتیکی وجود دارد اما اخیرا تکنیک ریزآرایه به عنوان یک روش قدرتمند جهت ارزیابی بیان ژن ها به طور هم زمان مورد توجه قرار گرفته است. جهت شناسایی...

زمینه و هدف: سرطان یکی از دلایل عمده مرگ و میر در دنیای امروز است و به عنوان یکی از مهم ‎‎ترین مشکلات سلامت جوامع محسوب می شو‎د. اکثر روش های پیشنهادی جهت دسته بندی سرطان ‎‎به کمک داده های بیان ژن مانند یک جعبه سیاه عمل کرده‏ و قابلیت تفسیرپذیری زیستی ندارند. این مطالعه با هدف معرفی روشی بهینه با قابلیت تفسیر داده های بیان ژن انجام شد. روش بررسی: در این مطالعه، روش ترکیبی پالایشی - پوششی برای ا...

بیان ژن، پدیدهای حیاتی در سایر موجودات زنده میباشد. ارزیابی این پدیده میتواند در سه سطح کلی ترنسکریپتومیکس، پروتئومیکس و متابولومیکس انجام گیرد. از ارزشمندترین روشها در سطح ترنسکریتومیکس، تکنولوژی ریزآرایهها بوده که قادرند بیان دهها هزار ژن را بطور همزمان اندازهگیری کنند. اما آزمایشات ریزآرایه، از ابتدا تا انتها، در معرض تغییرات ناخواسته ای بوده که ناشی از بایاسها یا ناهماهنگیهای آزمایشگاهی و ت...

  سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده‌های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده‌های ژنی که بین فنوتیپ‌های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می‌کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن‌های منفرد، تحلیل خانواده‌های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن‌ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ‌ها به کار می‌گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده‌های ژنی پرداخته می‌شود. مواد و روش‌ها: از ...