سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده‌های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده‌های ژنی که بین فنوتیپ‌های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می‌کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن‌های منفرد، تحلیل خانواده‌های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن‌ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ‌ها به کار می‌گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده‌های ژنی پرداخته می‌شود. مواد و روش‌ها: از ...

پیچیدگی شبکه های زیستی و تعداد زیاد ژ ن ها در مجموعه داده های ریز آرایه منجر به چالش های فراوان در زمینه تحلیل داده های بیان ژنی شده است. الگوریتم های خوشه بندی که ژن های مشابه یکدیگر را به هدف تحلیل عملکرد ژن ها گروه بندی می نماید اولین قدم برای رویارویی با این چالش ها می باشد. بطور کلی روش های خوشه بندی فازی برای تحلیل داده های بیان ژنی مناسب تر می باشند زیرا گروه های زیستی به طور ذاتی دارای ...

زمینه و هدف: همزمان با فعالیت هوازی حجمی از اکسیدان ها تولید می گردد که سیستم ایمنی را تحت تاثیر قرار می دهد، با این حال این میزان تاثیرات بر اساس جنسیت و فعال بودن متفاوت خواهد بود، لذا هدف از تحقیق حاضر بررسی بیان ژنی آنزیم سوپراکسیداز دیسموتاز میتوکندریایی ( (mn sod mn superoxide dismutase)) و اثرات شاخص های اکسیدانی و التهابی در بیان ژنی آنزیم سوپر اکسیداز دیسموتاز میتوکندریایی در مردان و ز...

هدف از این مطالعه، شناسایی ژن‌های تنظیمی مؤثر در بروز بیماری ورم پستان در گاو شیری با استفاده از داده-های ریزآرایهDNA بود. بدین منظور فایل بیان ژنی با بیشترین تعداد آرایه و متعلق به پلت‌فرم افی‌متریکس GPL1221 با شماره دسترسی GSE24560از پایگاه GEO استخراج شد. برای آزمون کنترل کیفیت داده از بسته‌یArrayQualityMetrics و برای پیش‌پردازش داده‌ها از تابع Threestep بسته‌ی AffyPLM در محیط R استفاده شد. ...

توجه به وجود باقی‌مانده هورمون‌های محرک رشد در لاشه حیوانات کشتار شده در کشتارگاه به عنوان یک خطر بالقوه برای سلامت افراد جامعه ضروری می‌باشد. پژوهش حاضر با هدف شناسایی بیومارکرهایی جهت تشخیص استفاده غیرقانونی از محرک‌های رشد استروئیدی در کشتارگاها انجام شد. برای این منظور در ابتدا آنالیز بیان افتراقی ژن‌ها در یک پروفایل بیان ژنی موجود در پایگاه داده Arrayexpress با شماره دسترسی E-GEOD-12179، ش...

زمینه و هدف: سرطان پروستات ازجمله سرطان‌های شایع میان مردان است که ناهمگونی بسیار بالایی را در ویژگی‌های ژنتیکی و پاتولوژیکی از خود نشان می‌دهد. توضیح روابط تنظیمی بین mRNA و microRNA می‌تواند به شناسایی الگوی تنظیم بیان ژن در سرطان پروستات بدخیم کمک کند. در این مطالعه یک‌پارچه‌سازی شبکه هم‌بیان ژنی و شبکه تنظیمی microRNA در تومور بدخیم پروستات با آنالیز داده‌های بیانی میکرواری بررسی گردید. روش...

پیش زمینه و هدف: نقص در عملکرد فاکتور 9 منجر به بیماری هموفیلی b می گردد. استفاده از فرآورده های پلاسمایی جهت جلوگیری از خونریزی، خطر انتقال عوامل عفونی را افزایش می دهد. بنابراین امروزه استفاده از فاکتور 9 نوترکیب، به عنوان جایگزین مناسب نوع پلاسمایی آن مطرح شده است. به منظور بیان و تولید فاکتور 9 نوترکیب، استفاده از یک وکتور بیانی با توالی های تنظیمی سیس مناسب ازجمله توالی های اینترونی لازم ا...

در این پایان نامه شیوه ی به کار گیری مدلهای مصنوعی سلول های زیستی در تکامل کنترلگر های خطی و غیر خطی مورد بررسی قرار می گیرد. نشان داده می شود که بازنمایی سلولیِ کنترلگرها، تکامل پذیری آنها را در به کار گیری الگوریتم ژنی افزایش می دهد. در این پایان نامه مدل جدیدی از یک سلول مصنوعی با الهام و ساده سازی از مدل های مرسوم قبلی معرفی می شود و سپس شیوه ی به کارگیری آن برای طراحی کنترلگر خطی و غیر خطی ...

مدل مخاطرات متناسب کاکس از روش های متداول در تحلیل داده های بقا می باشد که در هنگام استفاده از داده هایی با ابعاد بالا همگرا نشده و کارایی لازم برای برآورد را ندارد. به این منظور برای داده هایی با ابعاد بالا مدل کرنل کاکس جایگزین آن می شود. ماشین بردار پشتیبانی زیرمجموعه ای از تکنیک های داده کاوی است که توانایی کار با داده هایی با ابعاد بالا را دارد و همچنین نیازی به بررسی پیش فرض بر روی داده ه...