بیوانفورماتیک علمی است بین رشته ای که قواعد ریاضی، فیزیک، شیمی و علوم کامپیوتر را به داده های وسیع، متنوع و پیچیده زیست شناسی، اعمال می کند. هدف بیوانفورماتیک، حل مسایل زیست شناسی در سطح مولکولی است. پروتیین ها از اجزای اصلی سلول های موجودات زنده هستند. هر مولکول پروتیین، از زنجیره ای از اسیدهای آمینه تشکیل می شود. برای پروتیین چهار ساختار (اول، دوم، سوم، چهارم) تعریف شده است. ساختار اول، همان ...

پروتئین پوششی نقش های متعددی را در مراحل سیکل آلودگی به عهده دارد و گزینه مناسبی برای مطالعات تبارزایی و تنوع ژنتیکی به حساب می آید. به منظور بررسی آنالیز تبارزایی، تنوع ژنتیکی و فشار انتخاب بر ژن پروتئین پوششی جدایه های ویروس موزاییک زرد کدو (zymv)، هفت جدایه b10، b21، b22، h7، w5، z3 و z14 از غرب کشور و از میزبان های متفاوت تعیین توالی و با 65 جدایه قابل دسترس در پایگاه داده های نوکلئوتیدی مو...

ویروس موزائیک زرد کدو (ZYMV) از ویروس­های مهم کدوئیان است. پروتیین پوششی (Coat Protein, CP) پوتی­ویروس­ها به لحاظ تبارزایی حائز اهمیت است و از سوی دیگر منطقه ورامین نیز از مناطق مهم تولید کدوئیان بشمار می­آید، اما تاکنون ناحیه ZYMV-CP در جدایه­های این منطقه تعیین­ توالی نشده است. بنابراین، هدف این پژوهش، تعیین­ توالی ZYMV-CP در جدایه­ های ورامین و بررسی روابط فیلوژنتیکی آن با دیگر جدایه­های ZYM...

زمینه و هدف: اهمیت پروتئین vp2 پاروویروس سگی در اتصال به سلول‎های سرطانی انسانی و کیت‎های تشخیصی دامپزشکی سبب شده تا مطالعات گسترده‎ای در زمینه تولید این پروتئین صورت گیرد. هدف از انجام این پژوهش کلونینگ و تایید بیان پروتئین پوششی vp2 پاروویروس سگی در سیستم پروکاریوتی و بهینه نمودن بیان پروتئین vp2 در سیستم منحصر به فرد پروکاریوتی بدون سلول می‎باشد. مواد و روش‎ها: در این مطالعه تجربی، پلاسمید p...

از مهمترین فواید تولید پروتئین های نوترکیب در گیاهان می توان به اقتصادی بودن آن نسبت به سیستم های صنعتی، تولید فرآورده های بیولوژیکی فعال و مشابه شکل طبیعی، تولید بالای پروتئین نوترکیب و غیره اشاره کرد. از طرف دیگر پایین بودن سطح بیان ترنسژن ها و همچنین خاموشی آن ها در نسل های بعد از مهمترین فاکتورهای محدودکننده در این زمینه می باشد. انتخاب بافت مناسب گیاه جهت بیان و نیز بهبود قطعه ژنی از جمله ...

بالا راسته neuropterida شامل سه راسته neuroptera, megalopteraو raphidiopteraاست. راسته neuroptera شامل دو زیر راسته myrmeleontiformia و hemerobiidiformia است. myrmeleontiformia شامل بالا خانواده myrmeleontoidea است که از دو خانواده myrmeleontidae (antlions) و ascalaphidae (owlflies) تشکیل شده است و اکثر بالتوری های این بالا خانواده در این دو خانواده قرار دارند. در این تحقیق به منظور بررسی تنوع ...

برنج غذای اصلی بیش از نیمی از جمعیت جهان به ویژه کشورهای در حال توسعه است و خشکی مهمترین عامل کاهش عملکرد برنج در آسیا می‌باشد. این تحقیق به منظور شناسایی ژن‌های پاسخ دهنده به تنش خشکی با کمک تجزیه و تحلیل اطلاعات EST دو کتابخانه برگ برنج انجام شد. داده‌های کتابخانه‌های EST در شرایط شاهد و تنش خشکی، از پایگاه ‏داده NCBI دریافت و با استفاده از نرم‏افزار EGassembler ویرایش، دسته‏بندی و هم‏گذاری ش...

ویروس های نوترکیب گیاهی به دلیل اینکه آلودگی ایجاد شده توسط آن ها سریع و به صورت سیستمیک بوده است و همچنین باعث تولید مقادیر بالایی از پروتیین های نوترکیب در مدت زمان کمی پس از تلقیح می گردد، به عنوان ناقلین بیانی مورد استفاده قرار گرفته اند. خاموشی rna روند دفاعی قدرتمندی در گیاهان برای مقابله با ویروس های گیاهی است. این روند سبب تجزیه rna ویروس می شود و در نهایت، غلظت ویروس و ایجاد علائم در گ...

چکیده ویروس موزائیک شلغم (Turnip mosaic virus; TuMV) یکی از اعضای جنس پوتی‌ویروس می­باشد که وسیع­ترین دامنه­ی میزبانی را در بین پوتی‌ویروس­ها دارد. به منظور ردیابی و شناسایی این ویروس، در ماه­های آبان و آذر سال 1395 از مزارع زعفران دارای علائم استان خراسان جنوبی و شهرستان های قاین، خوسف و بیرجند تعداد 175 نمونه برداشت گردید. ردیابی اولیه­ی ویروس با آزمون الایزا صورت گرفت که طی آن آلودگی نمونه‌ه...

برنج غذای اصلی بیش از نیمی از جمعیت جهان به ویژه کشورهای در حال توسعه است و خشکی مهمترین عامل کاهش عملکرد برنج در آسیا می‌باشد. این تحقیق به منظور شناسایی ژن‌های پاسخ دهنده به تنش خشکی با کمک تجزیه و تحلیل اطلاعات EST دو کتابخانه برگ برنج انجام شد. داده‌های کتابخانه‌های EST در شرایط شاهد و تنش خشکی، از پایگاه ‏داده NCBI دریافت و با استفاده از نرم‏افزار EGassembler ویرایش، دسته‏بندی و هم‏گذاری ش...