پپتید¬های حلقوی یک دسته رایج از ترکیبات¬اند که مشخصات ساختاری و بیولوژیکی ویژه دارند. این ترکیبات عملکرد¬های متفاوتی در اندام¬های زنده دارند. اغلب این ترکیبات از نظر بیولوژیکی فعال هستند. پپتید¬های حلقوی، با توجه به پیکربندی¬های منحصربه فرد خود به طور گسترده به عنوان مولکول¬های مدل برای پپتید¬های بزرگ تر در شیمی، بیوشیمی و شیمی دارویی استفاده می-شوند. ساختار این مولکول¬ها نشان دهنده عملکردشان ا...

تمام صورت بندی های ممکن برای ترکیب 3- مرکاپتو- پروپن سلنال ( mcps ) در سطوح با b3lyp و mp2 با تابع پایه 6-311++g** و g2mp جهت تعیین ترتیب پایداری صورت بندی ها و امکان تشکیل پیوند هیدروژنی درون مولکولی مختلف در فاز گازی بهینه شده اند. همچنین، محاسبات برای تمام صورت بندی های mcps در سطح b3lyp و همان تابع پایه انجام شده است. افزایش نسبی مرتبه قدرت پیوند هیدروژنی برای سیستم های پیوند هیدروژنی نشان ...

در بخش تجربی این پروژه با رویکرد مهندسی کریستال نسبت به سنتز و شناسایی ساختار لیگاند کربوکسامیدی l (n- (2-پیرازین)- تیوفن-2-کربوکسامید) و کمپلکس های سری هالید جیوه (ii) این لیگاند اقدام گردید. بررسی ساختارهای ابرمولکولی این ترکیب ها نشان می دهد که تشکیل پیوند های هیدروژنی کلاسیک n-h...n و برهم کنش های غیرکووالانسی ضعیف π...π (در مورد لیگاند آزاد l) و c-h...π (در کمپلکس های 2 و 3) بین حلقه های آ...

دینامیک پرتون شرکت کننده در پیوند هیدروژنی در فرآیندهای انتقال فاز فروالکتریکی بلورهای فروالکتریکی دارای نقش اساسی می باشد. بلور ‏‎kh2po4 از جمله بلورهایی است که مولکولهای آن به واسطه وجود پیوندهای هیدروژنی در کنار هم قرار گرفته اند. مطالعات پراش نوترونی به وضوح یک سیستم پیوند هیدروژنی غیر خطی را در این بلور نشان می دهد که پیوندهای هیدروژنی در یک راستا و در یک امتداد قرار گرفته اند. در بررسی ای...

نظریه تابعی چگالی از جمله روش های مطالعه دستگاه های زیستی به شمار می آید. در این پایان نامه برآنیم که به مطالعه قدرت پیوند هیدروژنی در ساختار پلی آلانین آلفاهلیکس با استفاده از کد محاسباتی wien2k بپردازیم. آلانین از جمله آمینواسیدهایی است که تمایل زیادی برای قرارگرفتن در ساختار آلفاهلیکس از خود نشان می دهد. ساختار آلفاهلیکس را به این دلیل انتخاب کرده ایم که می توان اثر برهم کنش پپتید-پپتید را ب...

  در این پژوهش مطالعات تئوری بر روی پارامترهای هندسی، پیوند هیدروژنی و خواص الکترونی لیگاند انامینون حاوی حلقه پیران C19H19O7N] [ وکمپلکس دو هسته‌ای مولیبدن [C40H44Mo2N2O20] با این لیگاند با روش های تئوری تابع چگال و هارتری فاک انجام پذیرفت، این محاسبات با روش‌های B3LYP,BPV86 ,B3PW91 و HF با استفاده از سری پایه های 6-311G ,6-311G**,6-311++G** و LanL2DZ صورت گرفت. برای بررسی اثر توابع و سری های ...

پیوند هیدروژنی یکی از مهمترین برهمکنش هایی است که نقش برجسته ای را در فرآیندهای شیمیایی و بیوشیمیایی ایفا می کند، و به اندازه کافی روی آرایش مولکول های شرکت کننده در این برهمکنش ها تاًثیرگذار می باشد. علاوه بر آن، با تشکیل پیوند هیدروژنی پارامترهای ساختاری، فرکانس ارتعاشی و خواص الکترونی مولکول ها به میزان قابل ملاحظه ای تغییر می کند. در پروژه حاضر، پیوند هیدروژنی یاری شده توسط رزونانس در مولکول...

در این مقاله رفتار جذب مخلوط اتانول/آب در غشای پلیمری پلی دی متیل سیلوکسان (pdms) در دو دمای °c 45 و 60 در غلظت های مختلف خوراک، توسط مدل انرژی آزاد گیبس uniquac و مدل اصلاح شده با اثر پیوند هیدروژنی uniquac-hb بررسی شده است. قدرت پیش بینی دو مدل، اثر پیوند هیدروژنی، غلظت و دمای خوراک بر فرآیند جذب سیستم مذکور مطالعه شده است. با فرض برقراری تعادل ترمودینامیکی اجزاء در دو فاز موجود، پارامترهای ت...

روش رزونانس مغناطیسی هسته پروتون( ) بـرای بررسی اثـر حـلال پوشـی کاتیون های قلیایی خاکی با متانول( )، اتانول( ) و پروپانول( ) در نیترومتان( ) به عنوان حلال بی اثر بررسی شده است. بدین منظور فرکانس رزونانس پروتون های الکل بر حسب تابعی از نسبت مولی حلال به یون فلز با غلظت ثابت یون فلزی معین شده است. میانگین اعداد حلال پوشی کاتیون ها، ، در هر نسبت مولی الکل به یون فلزی، بر اساس نتایج جابه جایی شیمی...

در این پروژه ساختار استخلافهای مختلف کمپلکسهای آنیلید-(h2o)n و آنیلین- oh- در روش های hf، b3lyp و mp2 و با توابع پایه6-311++g(d,p) و 6-311++g(2d,2p) بهینه شده اند. محاسبات نظری نشان داد که در برهمکنش آنیلید با یک و دو مولکول آب هیچ واکنش انتقال پروتونی رخ نمیدهد اما در برهمکنش آنیلید با سه و چهار مولکول آب واکنش انتقال پروتون مشاهده میشود. همچنین در برهمکنش بین آنیلین و یون هیدروکسید نیز واکن...