با استفاده از نرم افزار گرومکس adii را در پوشش میسلی sds برای مدت ده نانوثانیه در پنج دمای مختلف شبیه سازی کردیم.

چکیده هیدروژن به عنوان یک منبع سوختی تمیز برای حمل و نقل محسوب می شود، ولی بخاطر سوختن آسان هیدروژن ذخیره سازی عاملی مخرب است. هم اکنون چهار فناوری برای ذخیره سازی هیدروژن تحت بررسی مورد استفاده واقع شده اند که شامل فشرده سازی گاز ، عمل معیان، هیبریدهای فلزی و جذب فیزیکی است. کشف فولرنها که دارای اندازه هایی در مقیاس نانومتری هستند، موجب ایجاد انگیزه ای در دانشمندان شد، چون این نوع از مواد کرب...

هدف از اجرای این طرح پژوهشی، بررسی ویژگی های حرارتی، رفتارهای تعادلی، و فازی آلیاژی متشکل از عناصر طلا و قلع به شیوه ی شبیه سازی دینامیک مولکولیست. پتانسیل برگزیده شده برای این شبیه سازی، پتانسیل دو و سه جسمی murrell – mottram است. این بررسی ها در غالب هنگرد nvt برای آلیاژ sn-%6au(درصد وزنی) و عناصر خالص تشکیل دهنده ی آن صورت پذیرفت. انرژی های جنبشی، پتانسیل، چگالی و ثابت شبکه ای که در آن سیستم...

کاربردهای نوین فناوری نانو، درک خواص ماده در ابعاد نانومتر را ضروری ساخته است. برای درک پدیده ذوب می توان از مطالعات پدیده شناختی سود جست. نانوخوشه ها به عنوان سیستمهایی که اثرهای سطحی در آن ها اهمیت دارد برای درک صحیح از شروع پدیده ذوب بیشتر مورد توجه قرار گرفته اند. شبیه سازیهای رایانه ای و روشهای عددی در کنار مطالعات آزمایشگاهی و نظری ، ابزاری مهم در بررسی خواص نانوخوشه هاست است و روش دینامی...

مولکول ‎dna‎ از دو رشته اسکلت قند-فسفات یکنواخت تشکیل شده که به صورت پادموازی قرار گرفته اند. در بین این دو رشته چهار باز نیتروژنی که با هم دو جفت یکتا را تشکیل می دهند وجود دارد. توالی این جفت بازها حامل اطلاعات وراثتی سلول است. نیاز به یافتن سطحی از مطالعه ی خصوصیات ‎dna‎ داریم که از طرفی در رژیم برهمکنش های ‎dna‎ با پروتئین ها باشد و از طرفی جهانی بودن کدهای ژنتیکی این مولکول را نادیده نگیرد...

آلفا1-آنتی تریپسین (?-1 antitrypsin, aat) یکی از اعضاء سوپر فامیلی سرپین ها و از مهار کننده های الاستاز نوتروفیل است.aat دارای ساختار دوم ویژه شامل سه صفجه بتا , نه آلفا هلیکس و لوپ مرکزی واکنشگر (rcl) می باشد. aat، پروتئازهای هدف را با تشکیل یک کمپلکس پایدار مهار می کند که در این حالت rcl برش یافته و درون ?-sheet a درج می شود که همراه با تغییر کانفورماسیون در aat می باشد. پلیمریزاسیون خود به خ...

در این پایان نامه خواص ترمودینامیکی و انتقالی 5 مایع یونی بر پایه 1- آلکیل 3- متیل ایمیدازولیوم برومید (آلکیل = متیل، اتیل، بوتیل، پنتیل و هگزیل)، با استفاده از شبیه سازی های دینامیک مولکولی بررسی شد. برهمکنشهای درون مولکولی و بین مولکولی بر اساس میدان نیروی کلاسیکی اتمهای متحد لیو توصیف شدند. در ابتدا کل سامانه در مجموعه همدما- هم فشار به مدت 5 نانو ثانیه تعادلسازی شدند. سپس برای محاسبه تعدادی...

بررسی تاثیر تنش بر نانولوله های کربنی تک دیواره با استفاده از تکنیک شبیه سازی دینامیک مولکولی کلاسیک (md) موضوع بحث این کار پژوهشی است. پتانسیل برهم کنشی بین اتم های کربن پتانسیل چند جسمی ترسف انتخاب شده و محاسبات در آنسامبل npt انجام شده است. در این پژوهش از روش فشار_ثابت برای سیستم های محدود بهره جسته ایم. دمای سیستم با مقیاس بندی سرعت و فشار به روش برندسن کنترل می شوند. نتایج شبیه سازی نشان ...

در این کار ما از پنج زنجیره ی پلی اتیلن ترفتالات که هر زنجیره ی آن شامل 120 واحد مونومر می باشد استفاده کرده ایم و به روش دینامیک مولکولی در دماهای مختلف ازk 280 تا k600، ابتدا در شرایط nvt و سپس در شرایط npt آرایش های تعادلی از پلیمر را ایجاد کرده و در انتها با روش ذره آزمون widom، پتانسیل شیمیایی مخلوط پلی اتیلن ترفتالات و گازهای مختلف را بررسی نمودیم. زنجیر پلیمر قبلأ توسط اسلامی و مولر پلات...

امروزه با وجود پیشرفت های زیاد در درمان سرطان، به دلیل ایجاد سلول های سرطانی مقاوم به دارو های ضدسرطانی موجود علاقه زیادی به توسعه دارو های ضدسرطانی با مکانیسم عمل جدید وجود دارد. مطالعات نشان داده که بعضی از این پپتید های ضدمیکروبی کاتیونیک نسبت به سلول های باکتریایی سمی ولی نسبت به سلول های طبیعی پستانداران سمی نیستند و طیف وسیعی از فعالیت های سیتوتوکسیک نسبت به سلول های سرطانی نشان می دهند. ...