در این پژوهش قصد داریم شیوه های مختلف و راهکارهای گوناگون ساخت گراف های رشته را مورد مطالعه و بررسی قرار دهیم. گراف های رشته در حقیقت خود یک شکل بهینه شده از گراف های همپوشان هستند. گراف های رشته و همپوشان توسط رشته هایی موسوم به خوانش موجود در ژنوم موجود زنده، توالی ژنوم را تعیین می کنند. در این زمینه به دلیل حجم داده ای بالا و لزوم ذخیره سازی سریع آنها، روش های متفاوتی با زمان های اجرای مختلف...

عامل بیماری لکه سوختگی گندم قارچcochliobolus sativus است که در بسیاری از مناطق جهان به عنوان یکی از مهم ترین بیماری های گندم مطرح است. از مناطق آلوده شمال کشور نمونه های مشکوک به این بیماری جمع آوری و از میان آن ها هشت جدایه عامل بیماری به عنوان نماینده انتخاب و مورد بررسی مورفولوژیکی، اثبات بیماریزایی و مولکولی قرار گرفتند. مشخصات مورفولوژیکی جدایه ها با استفاده از کلیدهای معتبر نشان داد که عل...

چکیده سابقه و هدف: یکی از فناوری های پیشرفته در ویرایش ژنوم، مربوط به فناوری تکرارهای کوتاه پالیندرومی فاصله دار منظم خوشه ای است. در این پژوهش RNA راهنمای مربوط به ژن SGR درگیر در تجزیه کلروفیل، در تماس نزدیک با پروتئین Cas9 در سازه CRISPR برای هدف قرار دهی این ژن در برگ های فستوکای بلند قرار گرفت. مواد و روش‌ها: در راستای ساخت سازه CRISPR/Cas9 قابل برنامه ریزی برای هدف گیری ژن SGR، ابتدا یک...

سابقه و هدف: بیماری شیگلوز از علل عمده ابتلا کودکان به اسهال در ایران است و ژن virg نقش کلیدی را در بیماری زایی و قدرت تهاجم باکتری شیگلا بازی می کند. هدف از این مطالعه، همسانه سازی، توالی یابی ژن virg و ساخت سازه جهش یافته pgem∆virg به منظور القای نوترکیبی در سویه شیگلا بومی با هدف ساخت سویه کاندید واکسنی زنده تقلیل حدت یافته است. روش بررسی: با استفاده از آزمون های بیوشیمیایی، سویه شیگلای بومی...

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های ایرانی قارچ puccinia triticina، یازده جدایه متعلق به مناطق جغرافیایی مختلف تعیین فنوتیپی و پاتوتیپی گردیدند و ناحیه igs1rdna توالی یابی شد. در رابطه با کلیه جدایه ها یک محصول pcr با اندازه 870 جفت بازی به دست آمد. هم ردیف سازیتوالی های igs1 مربوط به جدایه های مورد بررسی نمایانگر 2/1-0 درصد تفاوت بین آنها بود که بیانگر توالی های بسیار مشابه در این ناحیه است. ...

مقدمه: باکتری‏های گرم منفی از مهم‏ترین باکتری‏های بیماری‏زا برای موجودات دریایی از جمله ماهیان زینتی هستند. مواد و روش‏‏ ها: در این پژوهش گونه‏های Vibrio از ماهی زینتی گوپی در استخرهای پرورش ماهی کاشان، اصفهان، ایران جداسازی و بر اساس روش‏های تشخیص مولکولی و توالی یابی ژنتیکی شناسایی شدند. نمونه‏های کبد، کلیه، پوست، مغز و آبشش از ماهی زینتی گوپی در منطقه کاشان، اصفهان، ایران در مراحل لارو، بال...

سابقه و هدف: گاما آمینو بوتیریک اسید (گابا) یک اسیدآمینه چهار کربنه غیر پروتئینی است که در درمان فشارخون، دیابت، التهاب و افسردگی می تواند بکار رود. گابا توسط آنزیم گلوتامیک اسید دکربوکسیلاز در بسیاری از موجودات شامل باکتری‌ها سنتز می شود. از اینرو همسانه سازی این آنزیم جهت بهینه‌سازی تولید گابا اهمیت دارد. هدف از این پژوهش همسانه سازی و ساخت وکتور بیانی حاوی ژن گلوتامات ­دکربوکسیلاز از باکتری ...

بارکدگذاری dna روشی ساده برای شناسایی گونه ها با استفاده از یک توالی کوتاه ژنتیکی از یک بخش استاندارد ژنوم است. این روش به منظور شناسایی هشت گیاه دارویی جمع آوری شده از استان اردبیل مورد استفاده واقع شد. استخراج dna به روش تغییر یافته ctab انجام گرفت و pcr با آغازگرهای طراحی شده بر اساس بارکدهای کلروپلاستی rbcl، trnh-psba، matk و بارکد هسته ای its انجام شد. سپس محصولات pcr خالص سازی و تعیین توا...

چکیده مقدمه: سوپ ترخینه یکی از غذاهای محلی ناحیه غرب ایران می باشد که از قدیم الایام کاربرد دارویی و درمانی داشته و در درمان سرماخوردگی مورد استفاده قرار می­گرفته است. تحقیقات نشان داده است که ترخینه و دوغ ترخینه منبع غنی از باکتری‌های پروبیوتیک می­باشند. لذا به دلیل ابهام آمیز بودن تست‌های بیوشیمیایی جهت شناسایی باکتری‌ها، استفاده از روش‌های مولکولی جهت شناسایی و بررسی فیلوژنتیکی باکتری‌های...

سابقه و هدف: امروزه آنتی بادی ها در حوزه های تشخیص و درمان جایگاه ویژه ای را به خود اختصاص داده اند. در این میان، آنتی بادی های مونوکلونال کاملاً انسانی به دلیل عدم برانگیختن پاسخ ایمنی در بدن و کارایی بالا در درمان بیماری ها مورد توجه قرار گرفته اند. تحقیق پیش رو به منظور ساخت کتابخانه ژنی آنتی بادی نوترکیب انسانی از یک فرد واکسینه با توکسوئید کزاز انجام گرفته است. مواد و روش ها: ابتدا از فرد ا...