مقدمه: از آنجایی‌که وقوع یک لقاح موفق نتیجه برهم کنش مناسب گیرنده‌ها و لیگاندهای مستقر در غشای دو سلول اسپرم و تخمک می‌باشد، بنابراین شناسایی وقایع مولکولی و گلیکوپروتئین‌های دخیل در این برهم کنش، با استفاده از آنتی‌بادی منوکلونال می‌تواند اطلاعات موجود در زمینه مکانیسم‌های دخیل در لقاح را افزایش داده و از طرف دیگر علت ناباروری‌های ناشی از نقایص مولکولی و یا ناباروری‌های با علت ایمونولوژیک را ر...

در این مطالعه تشکیل کمپلکس میان مولکول¬های hox (x= f, cl, br) با متیل فنیل کالکوژن¬ها 3ch y5h6c (y= o, s, se) از طریق برهمکنش¬های رقابتی پیوند هیدروژنی و پیوند هالوژنی با استفاده از روش نظری p)2d,2) g++311-6 /2 mp مورد مطالعه قرار گرفت. در این راستا پارامترهای ساختاری طول پیوند، انرژی پایداری برهمکنش و توابع ترمودینامیکی (آنتالپی و انرژی آزاد گیبس) برای کمپلکس¬های مورد نطر ارزیابی شد. با مقایسه...

هدف این پروژه سنتز مشتقاتی از پپتیدوکالیکس]4[آرن بود که بتواند توالی آمینواسیدها را در پپتیدها (در اینجا دی پپتید) به خوبی تمیز دهد. دو دی پپتید زیر برای این منظور مورد بررسی قرار گرفت. مقایسه دو نوع شناساگر (مشتق پپتیدوکالیکس آرن از لبه بالایی 44 و لبه پایینی46) نشان داد که نوع نیروهای بین مولکولی و نحوه بر هم کنش مهمان–میزبان برای هر یک از شناساگر متفاوت از دیگری می باشد. در مشتق پپتیدوکا...

محاسبات شیمی کوانتومی بر اساس روش نظریه ی تابعیت چگالی برای یک سری از مشتقات استامیدی(ttas انجام گردید. واکنش پذیری منطقه ای مشتقات استامیدی به عنوان داروی ضد ویروس اچ آی وی، بر اساس توابع فوکویی باروش dft مطالعه گردید. نتایج بر اساس تصحیح خطای انطباق مجموعه پایه (bsse) نشان داد که مکانیسم تشکیل پیوند بین مشتقات استامیدی و اسید آمینه تیروزین به عنوان مولکول بیولوژیکی عمدتاَ از طریق اتم های نیترو...

برهم کنش ضعیف بین مولکول ها و اتم ها نقش مهمی را در پدیده های فیزیکی و شیمیایی ایفا می کند. امروزه با گسترش کامپیوترها، امکان محاسبه پتانسیل های بین مولکولی دقیق از محاسبات ساختار الکترونی آغازین امکان پذیر است. در این کار تحقیقاتی از نظریه اختلال تعدیل یافته تقارنی ( sapt ) برای محاسبه انرژی های برهم کنش بین دو مونومر n2 و he استفاده می شود و محاسبات با استفاده از نرم افزار sapt2008 انجام می...

در اثر برهمکنش باریکه پرانرژی با ماده، فرایند برانگیختگی و یونیزاسیون اتم ها و بدنبال آن فلورسانس پرتو ایکس مشخصه ایجاد می شود. در برهم کنش باریکه مولکولی پرانرژی با ماده، پدیده های منحصربفرد اثر همسایگی و انفجار کولنی مشاهده شده است. در این پروژه پژوهشی برای مطالعه برهمکنش باریکه مولکولی با ماده، بهره اشعه ایکس مشخصه برهم کنش ناشی از باریکه مولکولی 2h+ با باریکه اتمی +h مقایسه شده است. باریکه ...

در سال های اخیر، برهم کنش اسپین-مدار در ساختارهای نیمه رسانا به دلیل کاربرد بالقوه در ادوات اسپینترونیک (الکترونیک مبتنی بر اسپین الکترون) توجه زیادی را به خود جلب کرده است. در نیمه رساناهای متداول دو نوع برهم کنش اسپین-مدار وجود دارد. یکی برهم کنش اسپین-مدار درسل هاوسکه به واسطه بی تقارنی وارون حجمی (نظیر ساختارهای روی-سولفید) ایجاد می شود و دیگری برهم کنش اسپین-مدار که ناشی از بی تقارنی وارون...

با استفاده از نرم افزار گوسین و در سطح محاسباتی (mp2/6-311++g(2d,2p) ساختار های ممکن برای برهم کنش های پیـــوند هیدروژنی و ســـایر برهم کنش های بین مولکولی با تغییــــر موقعیت های مولکول های اتیلن و هیدروژن فلورید نسبت به مولکول فسفین اکسید مورد بررسی قرار گرفت. با توجه به نتایج به دست آمده افزایش تعداد پیوندهای هیدروژنی و متناسب با آن افزایش اندازه کمپلکس ها باعث افزایش پایداری کمپلکس ها شده ...

فعالیت برخی مشتقات دارویی تتراهیدروکربازول به عنوان مهار کننده های گیرنده 5-ht6 با استفاده از روش qsar مبتنی بر ساختار پروتئین و qsar مبتنی بر لیگاند پیش بینی شد. به این منظور ساختار سه بعدی پروتئین هدف (5-ht6) از روش مدل سازی همسانی بدست آمد. سپس از داکینگ مولکولی برای بررسی برهم-کنش های موثر بین پروتئین و مشتقات تتراهیدروکربازول استفاده شد. مطالعات داکینگ مولکولی نشان داد که برهم کنش های آب گ...