سابقه و هدف: سیستم های SOS مهم ترین نقش را در تحمل شوری گیاه دارد. این سیستم در آرابیدوپسیس تالیانا به عنوان یک سیستم پیام رسانی سلول در مسیرهای تحمل به تنش شوری عمل می‌کند. مواد و روش ها: در این تحقیق با بررسی توالی ژن sos1 در آرابیدوبسیس از پایگاه Tair، EBI، NCBI، plantcare وEXPASY و هم چنین جهت بررسی روابط این ژن در سیزده گونه گیاهی مختلف، میزان همولوژی آن ها از لحاظ میزان تشابه با نرم افز...

سابقه و هدف : روش های ژنومیکس نظیر تجزیه و تحلیل توالی های EST، امکان شناسایی مارکرهای مرتبط با ژن های بیان شده و miRNA های شبکه های تنظیمی و متابولیکی را فراهم می آورند. در این مقاله شناسایی عناصر مرتبط با ژنوم بیان شده در غدد برگی  Salvia fruticosaمورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش ها : 1465 توالی EST مربوط به کتابخانه ژنوم بیان شده در سلول غدد برگی گیاهان جنس Salvia از خانوادۀ نعناعیان از پایگ...

مقدمه: مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس به صورت گسترده در محیط وجود دارند و عامل ایجاد کننده بیماری در حیوانات، پرندگان و بیماران نقص سیستم ایمنی و افراد سالم می باشد. هدف از این مطالعه به کارگیری روش ترادف یابی چند جایگاهی (MLSA) در شناسایی مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس بود. روش کار: در این مطالعه، ابتدا توالی ژن های 16S rRNA، rpoB و hsp65 برای 8 زیر گونه از کمپلکس مایکوباکتریوم آویوم از بانک ژنی جمع آ...

در ژنوم ماهیان در اثر فرآیند مضاعف شدن در طول تکامل، دو کپی از هورمون رشد (GH-1 و GH-2) وجود دارند. هدف از پژوهش حاضر جداسازی ژن GH-1  ز GH-2 در ماهی سفید دریای خزر  با استفاده از تکنیک توالی یابی و معرفی آنزیم های برشی اختصاصی برای این دو جایگاه می­باشد. به این منظور، 5 قطعه ماهی سفید به طور تصادفی انتخاب و نمونه­های مورد نیاز برای استخراج DNA از باله دمی جداسازی شدند. پس از استخراج DNA به روش...

سابقه و هدف : پروتئین‌های LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین‌های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. بیشتر دسته بندی‌های عمومی ژن‌های LEA به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست می‌آید. روش‌های بیو انفورماتیکی روش‌های مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی می‌باشند. مواد و روشها : در این تحقیق جهت مطالعه ژن Wdhn13 پروتئین های LEA درگ...

ژیاردیا لامبلیا تک یاخته انگلی آلوده کننده روده کوچک است، که در سراسر جهان انسان را آلوده می کند. ژیاردیا لامبلیا در انسان معمولاً به وسیله نوشیدن آب های آلوده با کیست انتقال می یابد. نشانه های بیماری شامل اسهال چرب، نفخ شکم، اسهال و دل پیچه است. اما در بیشتر موارد در افراد با دستگاه ایمنی سالم، بیماری بدون نشانه است یا دارای علائم بیماری خفیف می باشد. از میان شش گونه شناخته شده ژیاردیا، فقط ژیا...

ژیاردیا لامبلیا با نام های دیگر ژیاردیا اینتستینالیس و ژیاردیا دئونالیس، تک یاخته انگلی آلوده کننده روده کوچک در سراسر جهان است. عفونت ناشی از ژیاردیا لامبلیا در اثر نوشیدن آب های آلوده و یا انتقال مدفوعی- دهانی می باشد. نشانه های بیماری شامل اسهال چرب، نفخ شکم، اسهال و دل پیچه است .اما در بیشتر موارد در افراد با دستگاه ایمنی سالم، بیماری بدون نشانه یا دارای علائم بیماری خفیف می باشد. ایزوله ها...

انطباق چند توالی به طور گسترده ای در زمینه ی بیوانفورماتیک مورد استفاده واقع شده است که از پیش بینی ساختار، تجزیه و تحلیل بیولوژیکی و شبیه سازی فیلوژنتیکی می توان به عنوان برخی از کاربردهای آن نام برد. طیف وسیعی از روش ها به منظور حل مسئله ی انطباق چند توالی ارائه گردیده است با این حال برخی از آن ها به پیش نیازهایی جهت یافتن انطباق بهینه احتیاج دارند و یا ممکن است از معایبی همچون پیچیدگی محاسبا...