سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده‌های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده‌های ژنی که بین فنوتیپ‌های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می‌کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن‌های منفرد، تحلیل خانواده‌های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن‌ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ‌ها به کار می‌گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده‌های ژنی پرداخته می‌شود. مواد و روش‌ها: از ...

ریزآرایه تکنولوژی پیچیده و مرکبی است که در زیست شناسی و طب کاربرد دارد. این تکنولوژی برای بررسی سطح بیان هزاران ژن بصورت همزمان کاربرد دارد. یک تراشه ی ریزآرایه شامل هزاران نقطه ی بسیار ریز از الیگونوکلئوتیدها به نام ویژگی ها می باشد. الیگونوکلئوتیدها توسط روبات در سطرها وستون ها آرایش یافته نصب می شوند. انتخاب تعداد کمتری از ویژگی ها یا ژن ها برای تشخیص و پیش بینی نتیجه ی یک بیماری در این راست...

مقدمه و هدف: در سال های اخیر، فناوری ریزآرایه ی dna نقش اساسی در تحقیقات ژنومی داشته ­است. با استفاده از این فناوری که امکان آنالیز هم­زمان سطوح بیان هزاران ژن را در شرایط مختلف فراهم­آورده­است، به حجم انبوهی از داده ها دست­می یابیم. روش های کلاسیک خوشه بندی نظیر روش های سلسله مراتبی و غیرسلسله مراتبی، روش هایی مناسب برای تحلیل این­گونه داده ها هستند اما محدودیت هایی نیز دارند. در این روش ها فر...

هدف: شناسایی ژن هایی که در کشت های اولیه سلول های شبکه ترابکولار (tm) بیانشان تحت تأثیر فاکتورهای رونویسی pitx2 و foxc1 قرار می گیرد. همچنین شناسایی ژن هایی که در بیماری گلوکوم نقش دارند. ژن های عامل بیماری گلوکوم که تاکنون شناخته شده اند تنها در کسر کوچکی از بیماران عامل بیماری می باشند. هدف ما در این مطالعه شناسایی ژن های دیگری است که ممکن است به علت نقش های ظریف، به راحتی توسط روشهای ژنتیکی ...

در این پایان نامه یک سیستم عصبی- فازی سلسله مراتبی- مکملی برای کلاسه بندی داده های بسیاربعدی بیان ژن معرفی می شود. در سال های اخیر تکنولوژی ریزآرایه، امکان مانیتورینگ بیان هزاران ژن را بطور همزمان فراهم کرده است. داده های سطوح بیان ژن اطلاعات ارزشمندی در مورد شبکه های بیولوژیک، حالات سلولی و فهم چگونگی رفتار ژن ها دربردارد. یک هدف از تحلیل داده های بیان ژن تعیین چگونگی تأثیر بیان هر ژن منفرد رو...

سابقه و هدف: در سال 1999 در یک مقاله، گالوپ و همکارانش کوشیدند تا برخلاف روش های بسیار پرهزینه متداول و رایج، با ارائه روشی نوین بر مبنای داده های بیان ژنی این سرطان را تشخیص دهند. هدف مشخص بود: ارائه روشی جدید که در عین کم هزینه بودن، کاراتر نیز باشد. آن ها با مطالعه 6817 ژن مربوط به 38 فرد مبتلا به لوکمیا با بهره گیری از روش های آماری خاصی در نهایت 50 ژن را انتخاب و برای تشخیص افراد بیمار است...

سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده های ژنی که بین فنوتیپ های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن های منفرد، تحلیل خانواده های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ ها به کار می گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده های ژنی پرداخته می شود. مواد و روش ها: از دو روش ط...

ظهور ترکیبات دارویی نوین همگام با مطالعه سازوکار و جایگاه عمل آنها در راستای تیمار و پیشگیری از بیماری ها، نقش ارزنده ای در علم پزشکی طی سالیان متمادی برعهده داشته است. بااین حال روش های متداول جهت کشف و شناسایی ترکیبات دارویی جدید موفقیت چندانی در پی نداشته اند. لذا جایگزین نمودن فنآوری های نوین با روش های مرسوم که عموما پر هزینه و کم بازده بوده و منجر به واکنش های دارویی پر خطر در بیماران می ...

انتخاب ویژگی یکی از فرایندهای پیش پردازش داده‌ها در مباحث مربوط به یادگیری ماشین و داده‌کاوی محسوب می‌شود که در برخی زمینه‌ها نظیر کار با داده‌های ریزآرایه در بیوانفورماتیک که با مشکل ابعاد بالای داده‌ها در مقابل تعداد کم نمونه‌ها مواجه است، از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. انتخاب ویژگی‌های (ژن‌های) موثر در تشخیص بیماری از داده‌های ریزآرایه نقش مهمی در تشخیص زودهنگام بیماری و راه‌های مواجهه با آن...