در این رساله، فعالیت داروها بر اساس ساختار پروتئین هدف و برهمکنش داروها با آن و سپس محاسبه توصیف کننده های دارو و ساخت یک مدل ریاضی بین فعالیت دارو و توصیف کننده ها (qsar) پیش بینی شد. در این رابطه ساختار سه بعدی پروتئین مورد نیاز بود. در مواردی که ساختار کریستالی پروتئین موجود نبود جهت پیش بینی ساختار سه بعدی آن از روش مدل سازی همسانی(homology modeling) استفاده شد. شبیه سازی دینامیک مولکولی سا...

مهم ترین راهبرد در طراحی ترکیبات ضد التهابی قوی با کاهش قابل توجه اثرات جانبی، بازداری انتخابی آنزیم سیکلواکسیژناز-2 (cox-2) است. در پژوهش حاضر مطالعات qsar با استفاده از توصیف کننده های مولکولی مختلف سعی در کشف ساختار و خواص فیزیکوشیمیایی مشتقات پیرازولین به عنوان بازدارنده های cox-2 را دارد. ساختارهای سه بعدی 23 تا از مشتقات پیرازولین توسط روش نیمه تجربی am1 در نرم افزار hyperchem بهینه شدند....

این پژوهش به پیش بینی فعالیت دارویی 38 مشتق آمینواسید به عنوان بازدارنده های هیستون دی استیلاز (hdac) جهت درمان سرطان و برخی از بیماری ها اختصاص دارد. آنزیم های hdac موجب تسریع روند حذف گروه های استیل از باقیمانده های لیزین از پروتیین های شامل هیستون (histone) می شوند. پس از محاسبه ی توصیف کننده های مولکولی مستقل، با استفاده از روش مرحله ای انتخاب متغیر و گزینش 4 توصیف کننده، جهت مدل سازی از رگ...

بازدارنده های غیرنوکلئوزیدی نسخه بردار معکوس، یک طبقه جدید از داروهای ضد رتروویروسی هستند که برای درمان عفونت ویروس نقص ایمنی اکتسابی(hiv) استفاده می شوند. این بازدارنده ها از فعالیت آنزیم نسخه بردار معکوس که تکثیر ژنوم hiv را درکنترل دارد، جلوگیری می کنند. در بخش اول پروژه، مدل های qsar برای پیش بینی فعالیت ضد hiv یکسری از آنالوگ های فنتیل تیازولیل تیواوره (pett) که به عنوان بازدارنده های غیرن...

مشتقات بنزیمیدازول، یک طبقه ی جدید از داروهای ضد انگل هستند که برای درمان عفونت های ناشی از انگل های متفاوتی مانند گیاردیا اینتستینالیس و تریکوموناس واژینالیساستفاده می شوند. در بخش اول پروژه، رابطه کمی ساختار- فعالیت (qsar) 42 ترکیب از مشتقات بنزیمیدازول به عنوان داروهای ضد انگل گیاردیا اینتستینالیس، با استفاده از شبکه عصبی مصنوعی با الگوریتم تنظیم بایزین مورد مطالعه قرار گرفت و با روش رگرسیو...

فعالیت برخی مشتقات دارویی تتراهیدروکربازول به عنوان مهار کننده های گیرنده 5-ht6 با استفاده از روش qsar مبتنی بر ساختار پروتئین و qsar مبتنی بر لیگاند پیش بینی شد. به این منظور ساختار سه بعدی پروتئین هدف (5-ht6) از روش مدل سازی همسانی بدست آمد. سپس از داکینگ مولکولی برای بررسی برهم-کنش های موثر بین پروتئین و مشتقات تتراهیدروکربازول استفاده شد. مطالعات داکینگ مولکولی نشان داد که برهم کنش های آب گ...

فراهمی زیستی سری متنوعی از 216 ترکیب دارویی خوراکی با استفاده از پارامترهای ساختاری آنها و با بهره گیری از رویکرد qsar تخمین زده شد. بدین منظور توصیف کننده های مولکولی برای این ترکیبات محاسبه شده و پس از بررسی و پالایش اولیه، 9 توصیف کننده مهمتر انتخاب گردید. با استفاده از این توصیف کننده ها مدل های خطی و غیر خطی جهت پیش بینی فراهمی زیستی با استفاده از روش های رگرسیون خطی چندگانه (mlr)، شبکه عص...

مشتقات 1، 2، 3-تری آزول برای مدت های طولانی در مطالعات صورت گرفته به عنوان یک منبع پر بار والهام بخش برای یافتن داروی ضد سرطان بوده است. هدف اصلی پروژه حاضر بررسی خاصیت ضد سرطانی یک سری از مشتقات 1 ، 2، 3-تری آزول-پریمیدین روی سه رده سلول سرطانی، b16-f10 (تومور سیاه رنگ قشر عمیق پوست) ، mgc-803 (سرطان معده) وmcf-7 (سلول های سرطان سینه انسان) با بهره گیری از روش های qsar می باشد. ابتدا ساختار هن...

مطالعه ارتباط کمی ساختار- فعالیت برای پیش بینی فعالیت دارویی مشتقات پیرازول ها، با استفاده از توصیف کننده های ساختاری و روش رگرسیون خطی چند گانه توسعه داده شده است. توصیف کننده های مولکولی با استفاده از الگوریتم ژنتیک انتخاب شدند. سپس یک مدل ساده، قوی، قابل تفسیر و با خطای کم و ضریب همبستگی بالا ساخته شد. نتایج نشان می دهد که تکنیک های خطی مانند رگرسیون خطی چند گانه که با یک روش انتخاب متغیر من...