امروزه باتوجه به گسترش روزافزون اطلاعات و پیشرفت¬هایی که در زمینه¬های پزشکی صورت گرفته است، استفاده از روش¬هایی که بتوان سرعت انجام کار و دقت را افزایش و هزینه آزمایش¬ها را کاهش داد؛ امری غیرقابل اجتناب است. با استفاده از تکنولوژی ریزآرایه¬ها می¬توان میزان بیان چندین هزار ژن را اندازه گرفت. از چالش¬هایی که برای تجزیه و تحلیل داده¬های ریزآرایه با آن روبرو هستیم، تعداد زیاد ژن¬ها در این مجموعه دا...

استخراج dna ژنومی با کمیت و کیفیت مطلوب از نیازهای اساسی زیست شناسی مولکولی است. بیشتر روش-های تجاری استخراج dna زمان بر هستند و با استفاده از آنزیم ها (مانند پروتئیناز k) و حلال های آلی سمی (مانند فنل و کلروفرم) انجام می شوند. از آنجایی که این آنزیم ها گران قیمت و مواد شیمیایی مورد استفاده مضرند، به یک روش استخراج dna که این معایب را نداشته باشد، نیاز است. این تحقیق به منظور مقایسه روش استخراج...

تکنولوژی ریز آرایه (micro array) امکان بررسی همزمان،بسیاری از فعل و انفعالات زیستی را فرآهم میکند و دردو زمینه ژنومیکس (مطالعه مجموعه ژن های موجود زنده) و پروتئومیکس (مطالعه مجموعه پروتئین های موجود زنده) کاربرد های وسیعی دارد. بازده این روش بسیار بالا بوده و در مدت زمان کوتاهی قادر به تحلیل میزان قابل توجهی از اطلاعات میباشد. به منظور پردازش اطلاعات حاصل از ریز آرایه، بیوانفورماتیک می تواند حا...

مقدمه و هدف: در سال های اخیر، فناوری ریزآرایه ی dna نقش اساسی در تحقیقات ژنومی داشته ­است. با استفاده از این فناوری که امکان آنالیز هم­زمان سطوح بیان هزاران ژن را در شرایط مختلف فراهم­آورده­است، به حجم انبوهی از داده ها دست­می یابیم. روش های کلاسیک خوشه بندی نظیر روش های سلسله مراتبی و غیرسلسله مراتبی، روش هایی مناسب برای تحلیل این­گونه داده ها هستند اما محدودیت هایی نیز دارند. در این روش ها فر...

واکاوی موازنه شار یک روش ریاضی با رویکرد مدل‏سازی بر پایه محدودیت به‏منظور تجزیه و تحلیل شارهای سوخت‏و‏سازی از طریق شبکه‏های سوخت‏و‏سازی مقیاس ژنوم است. یکی از ضعف‏های fba این است که محدودیت‏های تنظیمی در آن لحاظ نشده است و بسیاری از اشتباهات در پیش‏بینی‏های انجام شده توسط این روش به دلیل فقدان محدودیت‏های تنظیمی است. بنابراین، طی سال های اخیر به منظور بهبود قابلیت پیش بینی روش واکاوی موازنه شا...

امروزه استفاده از اطلاعات ژنتیکی افراد در تشخیص و رده بندی انواع بیماری ها از جمله سرطان ها، مورد توجه قرار گرفته است. یکی از بهترین و دقیق ترین روش ها در این زمینه، بررسی مقادیر بیان ژنی در افراد مختلف توسط فناوری ریزآرایه می باشد. یکی از مشکلات داده های ریزآرایه کم بودن تعداد نمونه ها در مقایسه با تعداد ژن ها است. این مسیله سبب کاهش دقت رده بندی و افزایش هزینه های محاسباتی و آزمایشگاهی می شود...

مباحث مولکولی از اهمیت روز افزونی در بررسی های علوم زیستی برخوردار است که استخراج اسیدهای نوکلیک(dna و rna) اولین گام در این بررسی ها می باشد. لذا استفاده از یک روش استخراج dna که سریع، بی خطر، مقرون به صرفه و دارای کمیت و کیفیت مطلوبی باشد، همیشه مورد نیازاست. چندین روش مختلف به منظور حداقل کردن مراحل استخراج dna توسط محققان مختلف گزارش شده که نتایجمطالعات اخیرنشانمی دهد،باتوجهبههدفو کاربردیکه...

هدف: شناسایی ژن هایی که در کشت های اولیه سلول های شبکه ترابکولار (tm) بیانشان تحت تأثیر فاکتورهای رونویسی pitx2 و foxc1 قرار می گیرد. همچنین شناسایی ژن هایی که در بیماری گلوکوم نقش دارند. ژن های عامل بیماری گلوکوم که تاکنون شناخته شده اند تنها در کسر کوچکی از بیماران عامل بیماری می باشند. هدف ما در این مطالعه شناسایی ژن های دیگری است که ممکن است به علت نقش های ظریف، به راحتی توسط روشهای ژنتیکی ...

ظهور ترکیبات دارویی نوین همگام با مطالعه سازوکار و جایگاه عمل آنها در راستای تیمار و پیشگیری از بیماری ها، نقش ارزنده ای در علم پزشکی طی سالیان متمادی برعهده داشته است. بااین حال روش های متداول جهت کشف و شناسایی ترکیبات دارویی جدید موفقیت چندانی در پی نداشته اند. لذا جایگزین نمودن فنآوری های نوین با روش های مرسوم که عموما پر هزینه و کم بازده بوده و منجر به واکنش های دارویی پر خطر در بیماران می ...

ریزآرایه تکنولوژی پیچیده و مرکبی است که در زیست شناسی و طب کاربرد دارد. این تکنولوژی برای بررسی سطح بیان هزاران ژن بصورت همزمان کاربرد دارد. یک تراشه ی ریزآرایه شامل هزاران نقطه ی بسیار ریز از الیگونوکلئوتیدها به نام ویژگی ها می باشد. الیگونوکلئوتیدها توسط روبات در سطرها وستون ها آرایش یافته نصب می شوند. انتخاب تعداد کمتری از ویژگی ها یا ژن ها برای تشخیص و پیش بینی نتیجه ی یک بیماری در این راست...