تابع نیروی دانش پایه نوعی از توابع نمره دهی می باشد که از آن در زمینه تشخیص فولد پروتئین ها با موفقیت قابل توجهی استفاده شده است. ما در این مطالعه کارایی نوعی تابع انرژی دانش پایه و تابع نیروی هم ارز آن را در تشخیص کمپلکس های درست پروتئین-پروتئین از کمپلکس های نادرست، با یکدیگر مقایسه کردیم. مقدار نیروی کل که از یک جزء کمپلکس (گیرنده/لیگاند) بر جزء دیگر وارد می شود به عنوان معیار پایداری کمپلکس...

سوپراکسیددیسموتاز (sods) یکی از مهمترین آنتی اکسیدانهائی است که از سلولها در مقابل آسیب های ناشی از استرس اکسیداتیو محافظت می کند. در این میان یافتن ترکیبات شیمیایی تازه ای که توانائی فعال سازی این آنزیم را داشته باشد از اهمیت زیادی برخوردار است. لذا در این پژوهش از رویکرد محاسباتی جهت یافتن محرک های جدید آنزیم sod استفاده گردیده است. در این بررسی برروی 15 ترکیب شیمیایی سنتز شده توسط soulére e...

فتوپروتئینهای وابسته به یون کلسیم از دو خانواده کتنوفور (شانه داران) و کلنترات (کیسه تنان) با وجود تشابه ساختاری بالا، میزان تشابه آمینواسیدی بسیار پایینی دارند. در فتوپروتئینهای کلنترات، حفره اتصال به کلنترازین شدیداً آبگریز و دور از دسترس حلال است و اگرچه هیچ آمینواسید بارداری دیده نمیشود، حضور یک باقیمانده دارای بار مثبت، یعنی آرژنین 39 (در نمیوپسین)، در این حفره در فتوپروتئینهای کتنوفور بسیا...

مطابق نظریه ی آمیلویید، علّت آسیب دیدن سلول های عصبی سیستم اعصاب مرکزی در بیماران آلزایمری، تجمّع و تشکیل توده های پروتیین آمیلوییدبتا است. بدین منوال، تجزیه ی صفحه های بتا در مرحله ی ابتدایی این فرایند به عنوان یک روش درمان مناسب برای این بیماری پیشنهاد می شود. دارویی که درین تحقیق مطابق همین هدف استفاده شده، پنج پپتید جداشده از پایانه ی کربوکسیل آمیلوییدبتا با توالی گلیسین، لوسین، متیونین، والی...

ویروس htlv-1 از خانواده رتروویروس ها می باشد و باعث ایجاد بیماری هایی نظیر لوسمی t-cell بزرگسالان (atl) ، تشنج گرمسیری فلج کننده (ham/tsp ) و اختلالات عصبی می گردد. پروتئین پروتئاز یکی از مهمترین آنزیم های ویروسی بشمار می رود و با مهار آن می توان از ادامه چرخه آلودگی این ویروس جلوگیری بعمل آورد. سری جدیدی از مهار کننده ها را ایجاد گردید و با استفاده از ابزارهای محاسباتی نحوه اتصال آن ها به پروت...

زمینه و هدف : ویروس htlv-1 جز خانواده رتروویروس ها می باشد ، این ویروس در انسان باعث ایجاد بیماری هایی نظیر لوسمی t-cell بزرگسالان (atl )، ham/tsp و ... می گردد . یکی از پروتئین های مهم در این ویروس پروتئاز است که برای بلوغ ویروس نیز ضروری می باشد .مهارکننده هایی که تاکنون برای پروتئاز ساخته شده اند ،فعالیت مناسبی را از خود نشان نداده اند .در این مطالعه سری جدیدی از مهار کننده ها ایجاد و با است...

سوپراکسیددیسومتاز نقش مهمی در دفاع آنتی‏اکسیدانی داشته و آنزیم مهمی در شبکه انتقال الکترون باکتریای‏های تنفس کننده‏ آهن مانند خانواده ژئوباکتریاسه دارد. با توجه به نقش مهم باکتری‏های تنفس کننده‏ آهن در بیوتکنولوژی محیط زیست به ویژه در پالایش و تجزیه زیستی، درک مکانیسم مهار یا تحریک سوپراکسید دیسموتاز توسط عامل مهارگر یا محرک، به درک کاربردهای بیوتکنولوژیک آنزیم و چگونگی ارتقای کاربردها کمک خواه...

مقدمه: از آن جا که داروهای سنتزی ضد فشار خون دارای اثرات جانبی است، استخراج پپتیدهای ضد فشار خون از منابع طبیعی فاقد اثرات جانبی مورد نیاز است. هدف از این تحقیق، شناسایی پپتید حاصل از هیدرولیز آنزیمی پروتئین های تخم شترمرغ و مطالعه ی اثرات مهار کنندگی آن بر آنزیم تبدیل کننده ی آنژیوتانسین - 1 بود. روش ها: هیدرولیز آنزیمی پروتئین های تخم شترمرغ با استفاده از آنزیم های پپسین و پانکراتین انجام شد....

زمینه و هدف : ویروس htlv-1 جز خانواده رتروویروس ها می باشد ، این ویروس در انسان باعث ایجاد بیماری هایی نظیر لوسمی t-cell بزرگسالان (atl )، ham/tsp و ... می گردد . یکی از پروتئین های مهم در این ویروس پروتئاز است که برای بلوغ ویروس نیز ضروری می باشد .مهارکننده هایی که تاکنون برای پروتئاز ساخته شده اند ،فعالیت مناسبی را از خود نشان نداده اند .در این مطالعه سری جدیدی از مهار کننده ها ایجاد و با است...

چکیده درک جزئیات تاخوردگی پروتئین اساس و پایه طراحی موفقیت آمیز مهار کننده های پروتئینی و سایر پروتئین های دارویی است. پروتئین ها فقط در صورتی عملکرد درستی دارند که شکل مطلوب را به خود بگیرند . علی رغم انجام چند دهه تحقیق و مطاالعه این سوال هنوز وجود دارد که ساختارهای عملکردی پروتئین چگونه از ساختمان اوّل پروتئین ایجاد می شوند. پاسخ به این مسأله می تواند به درک علت تعدادی از بیماری ها که حاصل...