چاره گانی  ح. 1394. کاربرد فن آوری ریزآرایه ها در نماتدشناسی گیاهی. دانش بیماری شناسی گیاهی 5(1):89-76. در طی یک واکنش سازگار، نماتدهای مولد غده ریشه (meloidogyne spp.) با تحریک تولید سلول های غول آسای چند هسته ای منجر به ایجاد تمایز در ریشه گیاه میزبان می گردند. رشد و تکثیر بیش از اندازه سلول های اطراف سلول های غول منجر به تولید غده روی ریشه گیاه میزبان می شود. مطالعات مختلف نشان داده که تغییر...

وجود داده های گمشده در داده های ریزآرایه، سبب کاهش دقت رسم شبکه های تنظیمی ژن، ایجاد اشتباه در خوشه بندی و تقسیم بندی تخصصی ژن ها و سایر تحلیل ها می شود. بنابراین تخمین داده-های گمشده مرحله مهمی در پیش پردازش داده های ریزآرایه، محسوب می شود. عملکرد الگوریتم-های تخمین در مجموعه داده های مختلف و با درصدهای متفاوت گمشدگی، متغیر است. همواره انتخاب مناسب ترین الگوریتم به منظور دستیابی به بیشترین دقت...

داده های ریزآرایه در تشخیص و طبقه بندی انواع بافت های سرطانی نقش بسزایی دارند. در پژوهش های سرطان همیشه تعداد نسبتا کم نمونه ها در ریزآرایه باعث ایجاد مشکلاتی در طراحی طبقه بندها شده است. بنابراین داده های ریزآرایه قبل از طبقه بندی از طریق تکنیک های انتخاب ژن پیش پردازش و ژن های فاقد اطلاعات آن ها دور ریخته می شود. اساسا یک روش انتخاب ژن مناسب می تواند بطور موثر کارایی دسته بندی بیماری ها (سرطا...

امروزه باتوجه به گسترش روزافزون اطلاعات و پیشرفت¬هایی که در زمینه¬های پزشکی صورت گرفته است، استفاده از روش¬هایی که بتوان سرعت انجام کار و دقت را افزایش و هزینه آزمایش¬ها را کاهش داد؛ امری غیرقابل اجتناب است. با استفاده از تکنولوژی ریزآرایه¬ها می¬توان میزان بیان چندین هزار ژن را اندازه گرفت. از چالش¬هایی که برای تجزیه و تحلیل داده¬های ریزآرایه با آن روبرو هستیم، تعداد زیاد ژن¬ها در این مجموعه دا...

پس از آن که در سال 1996 سشنا تکنولوژی ریزآرایه را کشف کرد، به یک باره حجم انبوهی از داده های مربوط به ژن انسان در اختیار محققین قرار گرفت. همین امر سرآغاز ایجاد شاخه ی جدیدی در علم بیوانفورماتیک برای تشخیص بیماری ها بویژه سرطان گشت. محققین توانستند با تحلیل داده های ریزآرایه و کلاس بندی ژن ها به نتایج مقبولی در زمینه ی تشخیص انواع مختلف سرطان برسند اما همچنان با چالش تعداد بسیار زیاد ویژگی های ...

استفاده از روش های مهندسی ژنتیک و ژنتیک مولکولی برای افزایش کمی و کیفی محصولات از یک سو و کاهش هزینه ها و زمان تولید از سوی دیگر، در شاخه های گوناگون کشاورزی بسیار ارزشمند گردیده است. وارد کردن ژن های گوناگون مربوط به صفات مختلف به ده ها گونه جهت اصلاح یا بهبود فرآورده های کشاورزی و کنترل آفات زیستی، تنها نمونه های کوچکی از کاربردهای گسترده گیاهان تراریخته را شامل می شوند. از مشکلات تولید گیاها...

وجود داده‌های گمشده در داده‌های ریزآرایه، سبب کاهش دقت رسم شبکه‌های تنظیمی ژن، ایجاد اشتباه در خوشه بندی و تقسیم‌بندی تخصصی ژن‌ها و سایر تحلیل‌ها می‌شود. بنابراین تخمین داده-های گمشده مرحله مهمی در پیش پردازش داده‌های ریزآرایه، محسوب می‌شود. عملکرد الگوریتم-های تخمین در مجموعه داده‌های مختلف و با درصدهای متفاوت گمشدگی، متغیر است. همواره انتخاب مناسب‌ترین الگوریتم به منظور دستیابی به بیشترین دقت...

چکیده بیماری سپتوریوز یکی از مخرب ترین بیماری های برگی گندم در سراسر جهان است که سالانه خسارت های زیادی به بار می آورد. در حال حاضر استفاده از ارقام مقاوم و سموم شیمیایی دو روش اصلی کنترل این بیماری هستند. روش هایی زیادی جهت شناسایی ژن های مقاوم در منابع ژنتیکی وجود دارد اما اخیرا تکنیک ریزآرایه به عنوان یک روش قدرتمند جهت ارزیابی بیان ژن ها به طور هم زمان مورد توجه قرار گرفته است. جهت شناسایی...

بیان ژن، پدیدهای حیاتی در سایر موجودات زنده میباشد. ارزیابی این پدیده میتواند در سه سطح کلی ترنسکریپتومیکس، پروتئومیکس و متابولومیکس انجام گیرد. از ارزشمندترین روشها در سطح ترنسکریتومیکس، تکنولوژی ریزآرایهها بوده که قادرند بیان دهها هزار ژن را بطور همزمان اندازهگیری کنند. اما آزمایشات ریزآرایه، از ابتدا تا انتها، در معرض تغییرات ناخواسته ای بوده که ناشی از بایاسها یا ناهماهنگیهای آزمایشگاهی و ت...